Влияние метилирования ДНК лейкоцитов и разнообразия микробиомов на механизмы защиты хозяина во время внебольничной пневмонии (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)
Влияние метилирования ДНК лейкоцитов и разнообразия микробиомов на защитные механизмы хозяина при внебольничной пневмонии
Внебольничная пневмония (ВП) представляет собой серьезную проблему здравоохранения, а смертность и заболеваемость, связанные с тяжелой пневмонией, остаются значительными, несмотря на современные методы лечения.
Хотя роль измененного метилирования ДНК при раке широко изучалась, знания о его влиянии на антибактериальную защиту весьма ограничены. Кроме того, недавние доклинические исследования показали, что кишечная и респираторная микробиота способствует защите организма от бактериальной пневмонии.
Это исследование направлено на изучение совершенно новой области исследований, связывающей степень метилирования ДНК в лейкоцитах крови (моноциты и нейтрофилы) и функцию кишечной и респираторной микробиоты на влияние врожденных иммунных ответов и защиты хозяина от ВП.
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Обоснование:
Внебольничная пневмония (ВП) представляет собой серьезную проблему здравоохранения, а смертность и заболеваемость, связанные с тяжелой пневмонией, остаются значительными, несмотря на современные методы лечения.
Хотя роль измененного метилирования ДНК при раке широко изучалась, знания о его влиянии на антибактериальную защиту весьма ограничены. Кроме того, недавние доклинические исследования показали, что кишечная и респираторная микробиота способствует защите организма от бактериальной пневмонии.
Это исследование направлено на изучение совершенно новой области исследований, связывающей степень метилирования ДНК в лейкоцитах крови (моноцитах и нейтрофилах) и функцию кишечной и респираторной микробиоты на влияние врожденных иммунных ответов на ВП и защиту хозяина от ВП.
Основные цели:
- Получить представление о роли измененного метилирования ДНК в лейкоцитах крови (моноцитах и нейтрофилах) в ответах врожденного иммунитета и защите хозяина у пациентов с ВП.
- Определить состав и функцию кишечной и респираторной микробиоты у больных ВП.
Второстепенная цель:
1. Оценить влияние микробиоты кишечника на метилирование ДНК лейкоцитов у больных ВП.
Дизайн исследования:
Обсервационное исследование среди пациентов с ВП в отделении неотложной помощи и отделении внутренних болезней Академического медицинского центра Амстердама
Исследуемая популяция:
231 больной ВП и 115 здоровых лиц старше 18 лет.
Методы:
У вышеупомянутых пациентов и здоровых добровольцев будет взято не более 90 мл крови для анализа паттернов метилирования ДНК очищенных моноцитов и нейтрофилов, которые будут проанализированы в связи с ДНК-метилтрансферазной и транслокационной (TET) активностью, экспрессией генов РНК. и выбор стандартных тестов функции врожденного иммунитета. Кроме того, изолированные моноциты и нейтрофилы из образцов при поступлении будут стимулироваться in vitro Streptococcus pneumoniae и Klebsiella pneumoniae. Кроме того, будут получены ректальные и носоглоточные мазки для изучения роли состава и функции кишечной и респираторной микробиоты. Материал пациента будет получен при включении и на 28-й день, когда пациенты будут осмотрены в амбулаторной клинике для последующего наблюдения.
Характер и степень бремени и рисков, связанных с участием, пользой и принадлежностью к группе:
Участие в этом обсервационном исследовании не принесет пользы участникам и здоровым добровольцам. Исследование предоставит информацию о влиянии метилирования ДНК лейкоцитов, а также кишечной и респираторной микробиоты на механизмы защиты хозяина во время ВП. Полученные знания могут потенциально принести пользу пациентам с ВП в будущем, предоставив альтернативные варианты иммуномодулирующего лечения, которые изменяют реакцию хозяина. Бремя и риски для пациентов, участвующих в исследовании ELDER-BIOME, минимальны. Исследователи возьмут 90 мл крови, 4 ректальных мазка и 2 мазка из носоглотки, разделенных на две временные точки (день поступления и 28-й день после поступления). Здоровые добровольцы будут подвергнуты одному взятию крови (70 мл) и 2 ректальным и 2 мазкам из носоглотки в один момент времени.
Тип исследования
Регистрация (Ожидаемый)
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
Noord-Holland
-
Amsterdam, Noord-Holland, Нидерланды, 1105 AZ
- Рекрутинг
- Academic Medical Center - University of Amsterdam
-
Контакт:
- Tom van der Poll, MD, PhD
- Электронная почта: t.vanderpoll@amc.uva.nl
-
Младший исследователь:
- W. Joost Wiersinga, MD, PhD, MBA
-
Младший исследователь:
- Brendon P Scicluna, PhD
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
Принимает здоровых добровольцев
Полы, имеющие право на обучение
Метод выборки
Исследуемая популяция
Описание
Критерии включения:
- Клиническое подозрение на новый эпизод острой респираторной инфекции
- Основной причиной обращения является клиническое подозрение на новый эпизод острой респираторной инфекции; госпитализация НЕ обязательна
- Явный новый или прогрессирующий инфильтрат, консолидация, полость или плевральный выпот на рентгенограмме грудной клетки или компьютерной томографии, выполненных в диагностических (не исследовательских) целях
- Появление следующих симптомов в течение последних 7 дней:
- Как минимум один респираторный симптом (кашель, боль в горле, насморк или заложенность носа, одышка)
- Как минимум один системный симптом (лихорадка, головная боль, мышечная боль, потливость, озноб или усталость).
Критерий исключения:
- Пациент не в состоянии дать информированное согласие
- Информированное согласие пациента не получено
- Пациент переведен из другой больницы
- Пациент включен в интервенционное клиническое исследование противоинфекционной или иммуномодулирующей терапии.
- Пациент получал какие-либо пероральные или системные антибиотики более чем за 48 часов до госпитализации.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Больные пневмонией
ректальный мазок (4 раза), разделенный на две временные точки (день 0 и день 28); )
|
ректальный мазок при исходном посещении (2 раза) и на 28-й день (2 раза) ИЛИ ректальный мазок в один момент времени (2 раза) (здоровые добровольцы)
мазок из носоглотки при исходном посещении (1x) и на 28-й день (1x) ИЛИ мазок из носоглотки в один момент времени (2x) (здоровые добровольцы)
забор крови при исходном посещении (45 мл) и на 28-й день (45 мл) (пациенты с пневмонией) ИЛИ однократный забор крови (70 мл) (здоровые добровольцы)
|
|
Здоровые предметы
ректальный мазок (2x) мазок из носоглотки (2x) забор крови (70 мл)
|
ректальный мазок при исходном посещении (2 раза) и на 28-й день (2 раза) ИЛИ ректальный мазок в один момент времени (2 раза) (здоровые добровольцы)
мазок из носоглотки при исходном посещении (1x) и на 28-й день (1x) ИЛИ мазок из носоглотки в один момент времени (2x) (здоровые добровольцы)
забор крови при исходном посещении (45 мл) и на 28-й день (45 мл) (пациенты с пневмонией) ИЛИ однократный забор крови (70 мл) (здоровые добровольцы)
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Изменения в метилировании ДНК лейкоцитов
Временное ограничение: день 0
|
день 0
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Состав и функции микробиоты кишечника и носоглотки
Временное ограничение: день 0
|
день 0
|
|
Изменения в метилировании ДНК лейкоцитов
Временное ограничение: день 28
|
день 28
|
|
Состав и функции микробиоты кишечника и носоглотки
Временное ограничение: день 28
|
день 28
|
Соавторы и исследователи
Публикации и полезные ссылки
Общие публикации
- Brands X, van Engelen TSR, de Vries FMC, Haak BW, Klarenbeek AM, Kanglie MMNP, van den Berk IAH, Schuurman AR, Peters-Sengers H, Otto NA, Faber DR, Lutter R, Scicluna BP, Stoker J, Prins JM, Joost Wiersinga W, van der Poll T. Association of Hyperferritinemia With Distinct Host Response Aberrations in Patients With Community-Acquired Pneumonia. J Infect Dis. 2022 Jun 1;225(11):2023-2032. doi: 10.1093/infdis/jiac013.
- Brands X, Haak BW, Klarenbeek AM, Butler J, Uhel F, Qin W, Otto NA, Jakobs ME, Faber DR, Lutter R, Wiersinga WJ, van der Poll T, Scicluna BP. An epigenetic and transcriptomic signature of immune tolerance in human monocytes through multi-omics integration. Genome Med. 2021 Aug 16;13(1):131. doi: 10.1186/s13073-021-00948-1.
- Brands X, de Vries FMC, Uhel F, Haak BW, Peters-Sengers H, Schuurman AR, van Engelen TSR, Lutter R, Cremer OL, Bonten MJ, Schultz MJ, Scicluna BP, van der Poll T; MARS Consortium. Plasma Ferritin as Marker of Macrophage Activation-Like Syndrome in Critically Ill Patients With Community-Acquired Pneumonia. Crit Care Med. 2021 Nov 1;49(11):1901-1911. doi: 10.1097/CCM.0000000000005072.
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
Первичное завершение (ОЖИДАЕТСЯ)
Завершение исследования (ОЖИДАЕТСЯ)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (ОЦЕНИВАТЬ)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (ДЕЙСТВИТЕЛЬНЫЙ)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- NL57847.018.16
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .