L'effetto della mEtilazione del DNA dei leucociti e della diversità del microBIOME sui meccanismi di difesa dell'ospite durante la polmonite acquisita in comunità (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Fondamento logico:

La polmonite acquisita in comunità (CAP) rappresenta un grave problema sanitario e la mortalità e la morbilità associate alla polmonite grave rimangono considerevoli, nonostante lo stato dell'arte delle cure.

Mentre il ruolo della metilazione del DNA alterata nel cancro è stato ampiamente studiato, la conoscenza del suo impatto sulla difesa antibatterica è molto limitata. Inoltre, recenti studi preclinici hanno dimostrato che il microbiota intestinale e respiratorio contribuisce alla difesa dell'ospite contro la polmonite batterica.

Questo studio mira a esplorare un'area di ricerca completamente nuova che collega l'estensione della metilazione del DNA nei leucociti del sangue (monociti e neutrofili) e la funzione del microbiota intestinale e respiratorio sull'influenza delle risposte immunitarie innate e della difesa dell'ospite contro la CAP.

Obiettivi primari:

1. Per ottenere informazioni sul ruolo della metilazione del DNA alterata nei leucociti del sangue (monociti e neutrofili) nelle risposte immunitarie innate e nella difesa dell'ospite nei pazienti con CAP.
2. Per determinare la composizione e la funzione del microbiota intestinale e respiratorio nei pazienti con CAP.

Obiettivo secondario:

1. Valutare l'influenza del microbiota intestinale sulla metilazione del DNA dei leucociti nei pazienti con CAP

Disegno dello studio:

Studio osservazionale tra pazienti con CAP presso il Dipartimento di Emergenza e il Reparto di Medicina Interna dell'Academic Medical Center Amsterdam

Popolazione studiata:

231 pazienti con CAP e 115 soggetti sani sopra i 18 anni di età.

Metodi:

Dai suddetti pazienti e volontari sani, verrà prelevato un massimo di 90 ml di sangue per analizzare i modelli di metilazione del DNA di monociti e neutrofili purificati, che saranno analizzati in relazione all'attività di DNA metiltransferasi e dieci undici traslocazioni (TET), espressione genica dell'RNA e una selezione di test di funzione immunitaria innata standard. Inoltre, monociti e neutrofili isolati dai campioni di ammissione saranno stimolati in vitro con Streptococcus pneumoniae e Klebsiella pneumoniae. Inoltre, saranno ottenuti tamponi rettali e rinofaringei per studiare il ruolo della composizione e della funzione del microbiota intestinale e respiratorio. Il materiale del paziente sarà ottenuto al momento dell'inclusione e il giorno 28, quando i pazienti saranno visitati in ambulatorio per il follow-up.

Natura ed entità dell'onere e dei rischi associati alla partecipazione, al beneficio e alla parentela di gruppo:

La partecipazione a questo studio osservazionale non gioverà ai partecipanti e ai volontari sani. Lo studio fornirà informazioni sull'influenza della metilazione del DNA dei leucociti e del microbiota intestinale e respiratorio sui meccanismi di difesa dell'ospite durante la CAP. Le conoscenze ottenute possono potenzialmente giovare ai pazienti con CAP in futuro fornendo opzioni terapeutiche immunomodulanti alternative che modificano la risposta dell'ospite. L'onere ei rischi per i pazienti che partecipano allo studio ELDER-BIOME sono minimi. Gli investigatori prenderanno 90 ml di sangue, 4 tamponi rettali e 2 tamponi nasofaringei divisi in due punti temporali (giorno della presentazione e giorno 28 dopo la presentazione). I volontari sani saranno sottoposti a un prelievo di sangue (70 ml) e 2 tamponi rettali e 2 nasofaringei alla volta.