Vliv methylace leukocytové DNA a diverzity mikroBIOME na obranné mechanismy hostitele během komunitní pneumonie (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Odůvodnění:

Komunitní pneumonie (CAP) představuje hlavní problém zdravotní péče a úmrtnost a nemocnost spojená s těžkou pneumonií zůstává značná, navzdory nejmodernější péči.

Zatímco úloha změněné metylace DNA u rakoviny byla široce studována, znalosti o jejím dopadu na antibakteriální obranu jsou velmi omezené. Nedávné předklinické studie navíc ukázaly, že střevní a respirační mikroflóra přispívá k obraně hostitele proti bakteriální pneumonii.

Tato studie si klade za cíl prozkoumat zcela novou výzkumnou oblast spojující rozsah metylace DNA v krevních leukocytech (monocytech a neutrofilech) a funkci střevní a respirační mikroflóry na vliv vrozených imunitních odpovědí a obrany hostitele proti CAP.

Primární cíle:

1. Získat přehled o úloze změněné metylace DNA v krevních leukocytech (monocytech a neutrofilech) ve vrozených imunitních odpovědích a obraně hostitele u pacientů s CAP.
2. Stanovit složení a funkci střevní a respirační mikroflóry u pacientů s CAP.

Sekundární cíl:

1. Posoudit vliv střevní mikroflóry na metylaci leukocytové DNA u pacientů s CAP

Studovat design:

Observační studie mezi pacienty s CAP na oddělení urgentního příjmu a interním oddělení Academic Medical Center Amsterdam

Studijní populace:

231 pacientů s CAP a 115 zdravých subjektů starších 18 let.

Metody:

Od výše uvedených pacientů a zdravých dobrovolníků bude odebráno maximálně 90 ml krve k analýze metylačních vzorců DNA purifikovaných monocytů a neutrofilů, které budou analyzovány v souvislosti s DNA metyltransferázou a deseti jedenácti translokační (TET) aktivitou, expresí genu RNA a výběr standardních testů funkce vrozené imunity. Izolované monocyty a neutrofily z přijatých vzorků budou navíc stimulovány in vitro pomocí Streptococcus pneumoniae a Klebsiella pneumoniae. Kromě toho budou odebrány rektální a nazofaryngeální výtěry pro zkoumání úlohy složení a funkce střevní a respirační mikroflóry. Materiál pacienta bude získán při zařazení a 28. den, kdy budou pacienti sledováni v ambulanci.

Povaha a rozsah zátěže a rizik spojených s participací, prospěchem a vztahem ke skupině:

Účast v této pozorovací studii nebude přínosem pro účastníky a zdravé dobrovolníky. Studie poskytne informace o vlivu methylace leukocytové DNA a také střevní a respirační mikroflóry na obranné mechanismy hostitele během CAP. Získané znalosti mohou v budoucnu potenciálně prospět pacientům s CAP tím, že poskytují alternativní imunomodulační léčebné možnosti, které modifikují odpověď hostitele. Zátěž a rizika pro pacienty účastnící se studie ELDER-BIOME jsou minimální. Vyšetřovatelé odeberou 90 ml krve, 4 rektální výtěry a 2 nazofaryngeální výtěry rozdělené do dvou časových bodů (den prezentace a den 28 po prezentaci). Zdraví dobrovolníci budou podrobeni jednomu odběru krve (70 ml) a 2 rektálním a 2 nasofaryngeálním výtěrům v jednom časovém bodě.