Effekten av leukocytt-Dna-metylering og mikrobiommangfold på vertsforsvarsmekanismer under fellesskapservervet lungebetennelse (ELDER-BIOME) (ELDER-BIOME)

Begrunnelse:

Samfunnservervet lungebetennelse (CAP) representerer et stort helseproblem, og dødelighet og sykelighet forbundet med alvorlig lungebetennelse er fortsatt betydelig, til tross for toppmoderne behandling.

Mens rollen til endret DNA-metylering i kreft har blitt mye studert, er kunnskapen om dens innvirkning på antibakterielt forsvar svært begrenset. I tillegg viste nyere prekliniske studier at tarm- og respiratorisk mikrobiota bidrar til vertens forsvar mot bakteriell lungebetennelse.

Denne studien tar sikte på å utforske et helt nytt forskningsområde som forbinder omfanget av DNA-metylering i blodleukocytter (monocytter og nøytrofiler) og funksjonen til tarm- og luftveismikrobiota på påvirkningen av medfødte immunresponser på og vertsforsvar mot CAP.

Primære mål:

1. For å få innsikt i rollen til endret DNA-metylering i blodleukocytter (monocytter og nøytrofiler) i medfødte immunresponser og vertsforsvar hos pasienter med CAP.
2. For å bestemme sammensetningen og funksjonen til tarm- og luftveismikrobiota hos pasienter med CAP.

Sekundært mål:

1. Å vurdere påvirkningen av tarmmikrobiotaen på leukocytt-DNA-metylering hos pasienter med CAP

Studere design:

Observasjonsstudie blant pasienter med CAP ved akuttmottaket og internmedisinsk avdeling ved Academic Medical Center Amsterdam

Studiepopulasjon:

231 CAP-pasienter og 115 friske personer over 18 år.

Metoder:

Fra ovenfor nevnte pasienter og friske frivillige vil det bli tappet maksimalt 90 ml blod for å analysere DNA-metyleringsmønstre av rensede monocytter og nøytrofiler, som vil bli analysert i forbindelse med DNA-metyltransferase og tenelleve translokasjons (TET) aktivitet, RNA-genekspresjon og et utvalg standard medfødte immunfunksjonstester. Dessuten vil isolerte monocytter og nøytrofiler fra inntaksprøver bli stimulert in vitro med Streptococcus pneumoniae og Klebsiella pneumoniae. I tillegg vil rektale og nasofaryngeale vattpinner bli innhentet for å undersøke rollen til sammensetningen og funksjonen av tarm- og respiratoriske mikrobiota. Pasientmateriale vil bli innhentet ved inkludering og på dag 28, da pasienter vil bli tilstede i poliklinikken for oppfølging.

Arten og omfanget av byrden og risikoen knyttet til deltakelse, nytte og gruppetilknytning:

Deltakelse i denne observasjonsstudien vil ikke være til fordel for deltakerne og friske frivillige. Studien vil gi informasjon om påvirkningen av leukocytt-DNA-metylering samt tarm- og luftveismikrobiota på vertens forsvarsmekanismer under CAP. Kunnskapen som er oppnådd kan potensielt være til nytte for CAP-pasienter i fremtiden ved å tilby alternative immunmodulerende behandlingsalternativer som modifiserer vertsresponsen. Byrden og risikoen for pasienter som deltar i ELDER-BIOME-studien er minimal. Undersøkerne vil ta 90 ml blod, 4 rektale vattpinner og 2 nasofaryngeale vattpinner fordelt på to tidspunkter (presentasjonsdag og dag 28 etter presentasjon). Friske frivillige vil bli utsatt for én blodprøve (70 ml) og 2 rektale - og 2 nasofaryngeale vattpinner på ett tidspunkt.