口腔微生物组作为口腔恶性和癌前病变以及药物相关的颌骨坏死的预后工具
2020年1月14日 更新者:Irit Allon、Barzilai Medical Center
口腔鳞状细胞癌(OSCC)是头颈部最常见的恶性肿瘤,近年来发病率呈上升趋势。
目前治疗OSCC的主要方法是广泛手术,包括颈清扫术和化疗/放疗/靶向治疗,尽管近30年来化疗、放疗和靶向治疗取得了长足进步,但由于侵袭性局部侵袭和转移,OSCC的预后仍然很差。转移,从而导致复发。
术后肿瘤复发导致 OSCC 预后不良,生活质量差。
OSCC未复发患者的5年生存率超过90%,复发患者的5年生存率为30%,未复发患者的中位生存期为76.8个月,复发患者为42.5个月。
因此,确定可预测 OSCC 术后复发的生物标志物非常重要。
此外,一些 OSCC 之前有前驱病变。
在口腔中,被认为可能是恶性的最常见病变是白斑和红斑,但同样明显的是,多达 50% 的 OSCC 起源于临床上看似正常的粘膜。
单个病变的预后意义很难确定。
因此,目前评估口腔潜在恶性病变的金标准是对苏木精和伊红染色切片进行显微镜评估,以确定是否存在结构和细胞学变化,这些变化通常被称为口腔上皮发育不良 (OED)。
人类微生物组被定义为生活在人体内和体表的微生物(由细菌、噬菌体、真菌、原生动物和病毒组成)的集体基因组,每个人体细胞和基因大约有 10 个微生物和 100 个微生物基因分别。
随着下一代测序技术的出现,人类微生物组计划描述了与健康个体不同身体部位相关的健康微生物群落的组成,包括口腔 [人类微生物组联合体]。
与正常(健康)的微生物组相反,破坏的微生物组或生态失调代表缺乏平衡,并且假设与疾病有关。
有趣的是,随着时间的推移,健康的口腔微生物组表现出相对的个体内稳定性,这表明微生物组特征的差异可以作为识别疾病状态的有用工具。
工作假设是,在 OSCC 患者中,口腔微生物组与健康个体相比发生了变化,并且某些微生物特征是健康与疾病的特征。
此外,在前兆条件下,即口腔上皮发育不良 (OED),微生物组组成的部分改变可能预示着恶性肿瘤的进展。此外,在治疗期间,特定的微生物特征可能与不完全根除有关,局部复发或转移潜能的倾向。将寻求与根据临床病理相关性调整的局部复发 (LR)、远处转移 (DM) 或无病生存 (DFS) 的相关性。
在这项研究中,根据赫尔辛基协议,在签署知情同意书后,将从患有 OSCC、OED 的患者和健康个体收集口腔粘膜样本。
常规病理诊断由本中心病理科专家医师进行。
数据将与从医疗记录中获得的人口统计和临床数据相关联。
这将按照机构道德准则进行。
研究概览
研究类型
观察性的
注册 (预期的)
150
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
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-
Ashkelon、以色列
- 招聘中
- Barzilai Medical Center
-
接触:
- Irit Alon, MD, Phd
- 电话号码:972-52-3609727
- 邮箱:irital@bmc.gov.il
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参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
20年 至 90年 (成人、年长者)
接受健康志愿者
不
有资格学习的性别
全部
取样方法
非概率样本
研究人群
研究人群将从以色列阿什克伦 Barzilai 医疗中心的口腔颌面外科门诊诊所中选出
描述
纳入标准:
- OSCC 活检患者
- 活检有口腔癌前病变的患者
- 下颌骨坏死活检患者
- 因其他目的(如拔牙、反应性病变)到口腔颌面诊所就诊的健康年龄匹配患者
排除标准:
- 在过去 3 个月内接受过抗菌药物治疗的患者
- 接受放射治疗的患者
- 接受化疗/免疫治疗的患者
学习计划
本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:病例对照
- 时间观点:预期
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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口腔鳞状细胞癌
用于提取细菌 DNA 的口腔粘膜样本
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知情同意后和常规治疗前的口腔粘膜取样。 在 3、6、9、12 个月后进行类似的随访抽样。 从临床样本中提取的细菌 DNA(而非人类 DNA)将被测序并分析 16s rRNA(细菌核糖体)。 |
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口腔上皮发育不良
用于提取细菌 DNA 的口腔粘膜样本
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知情同意后和常规治疗前的口腔粘膜取样。 在 3、6、9、12 个月后进行类似的随访抽样。 从临床样本中提取的细菌 DNA(而非人类 DNA)将被测序并分析 16s rRNA(细菌核糖体)。 |
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对照:健康年龄匹配的患者
用于提取细菌 DNA 的口腔粘膜样本
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知情同意后和常规治疗前的口腔粘膜取样。 在 3、6、9、12 个月后进行类似的随访抽样。 从临床样本中提取的细菌 DNA(而非人类 DNA)将被测序并分析 16s rRNA(细菌核糖体)。 |
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颌骨坏死
用于提取细菌 DNA 的口腔粘膜样本
|
知情同意后和常规治疗前的口腔粘膜取样。 在 3、6、9、12 个月后进行类似的随访抽样。 从临床样本中提取的细菌 DNA(而非人类 DNA)将被测序并分析 16s rRNA(细菌核糖体)。 |
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基础疾病,无颌骨坏死
用于提取细菌 DNA 的口腔粘膜样本
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知情同意后和常规治疗前的口腔粘膜取样。 在 3、6、9、12 个月后进行类似的随访抽样。 从临床样本中提取的细菌 DNA(而非人类 DNA)将被测序并分析 16s rRNA(细菌核糖体)。 |
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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微生物组特征研究第 1 天
大体时间:每个参与者的第 1 天
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通过扩增 16s rRNA(细菌核糖体)的 V4 区对提取的细菌 DNA 进行测序。
样品将通过临床访问(第 1 天)时所有受试者的口腔粘膜拭子获得。
FLOQ 拭子 (Copan) 将擦拭在宏观上看起来正常的内颊粘膜上。
拭子将立即放入含有 1 毫升分子级 PBS 的 15 毫升聚丙烯管中。
样品将保存在 4oC,直到冷冻在 -80oC。
每个样本都将分配一个协议序列号,从受试者中去除身份信息。
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每个参与者的第 1 天
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研究第 3 个月的微生物组特征
大体时间:每个参与者的第 3 个月
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1 通过扩增 16s rRNA(细菌核糖体)的 V4 区对提取的细菌 DNA 进行测序。
样品将通过临床访问(第 3 个月)时所有受试者的口腔粘膜拭子获得。
FLOQ 拭子 (Copan) 将擦拭在宏观上看起来正常的内颊粘膜上。
拭子将立即放入含有 1 毫升分子级 PBS 的 15 毫升聚丙烯管中。
样品将保存在 4oC,直到冷冻在 -80oC。
每个样本都将分配一个协议序列号,从受试者中去除身份信息。
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每个参与者的第 3 个月
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研究第 6 个月的微生物组特征
大体时间:每个参与者的第 6 个月
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通过扩增 16s rRNA(细菌核糖体)的 V4 区对提取的细菌 DNA 进行测序。
样品将通过临床访问(第 6 个月)时所有受试者的口腔粘膜拭子获得。
FLOQ 拭子 (Copan) 将擦拭在宏观上看起来正常的内颊粘膜上。
拭子将立即放入含有 1 毫升分子级 PBS 的 15 毫升聚丙烯管中。
样品将保存在 4oC,直到冷冻在 -80oC。
每个样本都将分配一个协议序列号,从受试者中去除身份信息。
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每个参与者的第 6 个月
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研究第 9 个月的微生物组特征
大体时间:每个参与者的第 9 个月
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通过扩增 16s rRNA(细菌核糖体)的 V4 区对提取的细菌 DNA 进行测序。
样品将通过临床访问(第 9 个月)时所有受试者的口腔粘膜拭子获得。
FLOQ 拭子 (Copan) 将擦拭在宏观上看起来正常的内颊粘膜上。
拭子将立即放入含有 1 毫升分子级 PBS 的 15 毫升聚丙烯管中。
样品将保存在 4oC,直到冷冻在 -80oC。
每个样本都将分配一个协议序列号,从受试者中去除身份信息。
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每个参与者的第 9 个月
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研究第 12 个月的微生物组特征
大体时间:每个参与者的第 12 个月
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3. 通过扩增 16s rRNA(细菌核糖体)的 V4 区对提取的细菌 DNA 进行测序。
样品将通过临床访问(第 12 个月)时所有受试者的口腔粘膜拭子获得。
FLOQ 拭子 (Copan) 将擦拭在宏观上看起来正常的内颊粘膜上。
拭子将立即放入含有 1 毫升分子级 PBS 的 15 毫升聚丙烯管中。
样品将保存在 4oC,直到冷冻在 -80oC。
每个样本都将分配一个协议序列号,从受试者中去除身份信息。
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每个参与者的第 12 个月
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Human Microbiome Project Consortium. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. Nature. 2012 Jun 13;486(7402):207-14. doi: 10.1038/nature11234.
- D'Souza G, Kreimer AR, Viscidi R, Pawlita M, Fakhry C, Koch WM, Westra WH, Gillison ML. Case-control study of human papillomavirus and oropharyngeal cancer. N Engl J Med. 2007 May 10;356(19):1944-56. doi: 10.1056/NEJMoa065497.
- Speight PM. Update on oral epithelial dysplasia and progression to cancer. Head Neck Pathol. 2007 Sep;1(1):61-6. doi: 10.1007/s12105-007-0014-5. Epub 2007 Nov 30. No abstract available.
- Ding T, Schloss PD. Dynamics and associations of microbial community types across the human body. Nature. 2014 May 15;509(7500):357-60. doi: 10.1038/nature13178. Epub 2014 Apr 16.
- Bagan JV, Scully C. Recent advances in Oral Oncology 2007: epidemiology, aetiopathogenesis, diagnosis and prognostication. Oral Oncol. 2008 Feb;44(2):103-8. doi: 10.1016/j.oraloncology.2008.01.008.
- Camisasca DR, Silami MA, Honorato J, Dias FL, de Faria PA, Lourenco Sde Q. Oral squamous cell carcinoma: clinicopathological features in patients with and without recurrence. ORL J Otorhinolaryngol Relat Spec. 2011;73(3):170-6. doi: 10.1159/000328340. Epub 2011 May 27.
- Lindenblatt Rde C, Martinez GL, Silva LE, Faria PS, Camisasca DR, Lourenco Sde Q. Oral squamous cell carcinoma grading systems--analysis of the best survival predictor. J Oral Pathol Med. 2012 Jan;41(1):34-9. doi: 10.1111/j.1600-0714.2011.01068.x. Epub 2011 Sep 8.
- Dietert RR, Silbergeld EK. Biomarkers for the 21st century: listening to the microbiome. Toxicol Sci. 2015 Apr;144(2):208-16. doi: 10.1093/toxsci/kfv013. Epub 2015 Mar 20.
- Li K, Bihan M, Yooseph S, Methe BA. Analyses of the microbial diversity across the human microbiome. PLoS One. 2012;7(6):e32118. doi: 10.1371/journal.pone.0032118. Epub 2012 Jun 13.
- Meyer MS, Joshipura K, Giovannucci E, Michaud DS. A review of the relationship between tooth loss, periodontal disease, and cancer. Cancer Causes Control. 2008 Nov;19(9):895-907. doi: 10.1007/s10552-008-9163-4. Epub 2008 May 14.
- Fitzpatrick SG, Katz J. The association between periodontal disease and cancer: a review of the literature. J Dent. 2010 Feb;38(2):83-95. doi: 10.1016/j.jdent.2009.10.007. Epub 2009 Nov 4.
- Ahn J, Segers S, Hayes RB. Periodontal disease, Porphyromonas gingivalis serum antibody levels and orodigestive cancer mortality. Carcinogenesis. 2012 May;33(5):1055-8. doi: 10.1093/carcin/bgs112. Epub 2012 Feb 26.
- Yu G, Gail MH, Shi J, Klepac-Ceraj V, Paster BJ, Dye BA, Wang GQ, Wei WQ, Fan JH, Qiao YL, Dawsey SM, Freedman ND, Abnet CC. Association between upper digestive tract microbiota and cancer-predisposing states in the esophagus and stomach. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev. 2014 May;23(5):735-41. doi: 10.1158/1055-9965.EPI-13-0855. Epub 2014 Apr 3.
- Meurman JH, Uittamo J. Oral micro-organisms in the etiology of cancer. Acta Odontol Scand. 2008;66(6):321-6. doi: 10.1080/00016350802446527. Erratum In: Acta Odontol Scand. 2009;67(4):256.
- Meurman JH. Oral microbiota and cancer. J Oral Microbiol. 2010 Aug 10;2. doi: 10.3402/jom.v2i0.5195.
- Nagy KN, Sonkodi I, Szoke I, Nagy E, Newman HN. The microflora associated with human oral carcinomas. Oral Oncol. 1998 Jul;34(4):304-8.
- Pushalkar S, Ji X, Li Y, Estilo C, Yegnanarayana R, Singh B, Li X, Saxena D. Comparison of oral microbiota in tumor and non-tumor tissues of patients with oral squamous cell carcinoma. BMC Microbiol. 2012 Jul 20;12:144. doi: 10.1186/1471-2180-12-144.
- Schmidt BL, Kuczynski J, Bhattacharya A, Huey B, Corby PM, Queiroz EL, Nightingale K, Kerr AR, DeLacure MD, Veeramachaneni R, Olshen AB, Albertson DG. Changes in abundance of oral microbiota associated with oral cancer. PLoS One. 2014 Jun 2;9(6):e98741. doi: 10.1371/journal.pone.0098741. eCollection 2014. Erratum In: PLoS One. 2014;9(8):e106297. Muy-Teck The [removed].
- Ahn J, Chen CY, Hayes RB. Oral microbiome and oral and gastrointestinal cancer risk. Cancer Causes Control. 2012 Mar;23(3):399-404. doi: 10.1007/s10552-011-9892-7. Epub 2012 Jan 22.
- Guerrero-Preston R, Godoy-Vitorino F, Jedlicka A, Rodriguez-Hilario A, Gonzalez H, Bondy J, Lawson F, Folawiyo O, Michailidi C, Dziedzic A, Thangavel R, Hadar T, Noordhuis MG, Westra W, Koch W, Sidransky D. 16S rRNA amplicon sequencing identifies microbiota associated with oral cancer, human papilloma virus infection and surgical treatment. Oncotarget. 2016 Aug 9;7(32):51320-51334. doi: 10.18632/oncotarget.9710.
- Sedghizadeh PP, Yooseph S, Fadrosh DW, Zeigler-Allen L, Thiagarajan M, Salek H, Farahnik F, Williamson SJ. Metagenomic investigation of microbes and viruses in patients with jaw osteonecrosis associated with bisphosphonate therapy. Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2012 Dec;114(6):764-70. doi: 10.1016/j.oooo.2012.08.444.
- Kolenbrander PE, Andersen RN, Blehert DS, Egland PG, Foster JS, Palmer RJ Jr. Communication among oral bacteria. Microbiol Mol Biol Rev. 2002 Sep;66(3):486-505, table of contents. doi: 10.1128/MMBR.66.3.486-505.2002.
- Ribeiro GH, Chrun ES, Dutra KL, Daniel FI, Grando LJ. Osteonecrosis of the jaws: a review and update in etiology and treatment. Braz J Otorhinolaryngol. 2017 Jun 24;84(1):102-8. doi: 10.1016/j.bjorl.2017.05.008. Online ahead of print.
- Voss PJ, Poxleitner P, Schmelzeisen R, Stricker A, Semper-Hogg W. Update MRONJ and perspectives of its treatment. J Stomatol Oral Maxillofac Surg. 2017 Sep;118(4):232-235. doi: 10.1016/j.jormas.2017.06.012. Epub 2017 Jul 8.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2017年12月14日
初级完成 (预期的)
2021年12月31日
研究完成 (预期的)
2021年12月31日
研究注册日期
首次提交
2018年1月16日
首先提交符合 QC 标准的
2018年1月25日
首次发布 (实际的)
2018年2月1日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2020年1月18日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2020年1月14日
最后验证
2020年1月1日
更多信息
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