Mikrobiom jamy ustnej jako narzędzie prognostyczne w zmianach złośliwych i przednowotworowych jamy ustnej oraz w związanej z lekami martwicy kości szczęki

Rak kolczystokomórkowy jamy ustnej (OSCC) jest najczęstszym nowotworem złośliwym głowy i szyi, a częstość jego występowania wzrosła w ostatnich latach. Rozległa operacja z wycięciem szyi i chemioterapią/radioterapią/terapią celowaną jest obecnie stosowaną metodą leczenia OSCC i pomimo ogromnego postępu w chemioterapii, radioterapii i terapii celowanej w ostatnich trzech dekadach, rokowanie OSCC jest nadal złe ze względu na agresywną inwazję miejscową i przerzuty, które prowadzą do nawrotu. Pooperacyjny nawrót guza wiąże się ze złym rokowaniem w OSCC i niską jakością życia. 5-letni wskaźnik przeżycia wynosi ponad 90% u pacjentów z OSCC bez nawrotu i 30% u pacjentów z nawrotem, z medianą przeżycia 76,8 miesiąca u pacjentów bez nawrotu i 42,5 miesiąca u pacjentów z nawrotem. Dlatego ważne jest zidentyfikowanie biomarkerów, które mogą przewidywać pooperacyjny nawrót OSCC. Ponadto niektóre OSCC są poprzedzone zmianami prekursorowymi. W jamie ustnej najczęstszymi zmianami rozpoznawanymi jako potencjalnie złośliwe są leukoplakia i erytroplakia, ale wiadomo również, że aż 50% OSCC wywodzi się z pozornie prawidłowej klinicznie błony śluzowej. Znaczenie prognostyczne pojedynczej zmiany jest trudne do określenia. Dlatego obecnie złotym standardem oceny potencjalnie złośliwych zmian w jamie ustnej jest mikroskopowa ocena skrawków barwionych hematoksyliną i eozyną pod kątem obecności zmian architektonicznych i cytologicznych, które ogólnie określa się jako dysplazję nabłonka jamy ustnej (OED). Ludzki mikrobiom definiuje się jako zbiorcze genomy drobnoustrojów (składających się z bakterii, bakteriofagów, grzybów, pierwotniaków i wirusów), które żyją wewnątrz i na ciele ludzkim, a na każdą ludzką komórkę i gen przypada około 10 drobnoustrojów i 100 genów drobnoustrojów odpowiednio. Wraz z pojawieniem się technologii sekwencjonowania nowej generacji, projekt Human Microbiome Project nakreślił skład zdrowych społeczności drobnoustrojów związanych z różnymi miejscami ciała zdrowych osób, w tym z jamą ustną [konsorcjum Human Microbiome]. W przeciwieństwie do normalnego (zdrowego) mikrobiomu, zakłócony mikrobiom lub dysbioza oznacza brak równowagi i jest hipotetycznie związany z chorobą. Co ciekawe, zdrowy mikrobiom jamy ustnej wykazuje względną stabilność międzyosobniczą w czasie, co sugeruje, że różnice w profilach mikrobiomu mogą służyć jako przydatne narzędzia do identyfikacji stanów chorobowych. Hipoteza robocza jest taka, że ​​u pacjentów z OSCC mikrobiom jamy ustnej jest zmieniony w porównaniu z osobami zdrowymi, a pewne sygnatury mikrobiologiczne są charakterystyczne dla osób zdrowych i chorych. Ponadto w stanach prekursorowych, tj. dysplazji nabłonka jamy ustnej (OED), częściowa zmiana składu mikrobiomu może przewidywać progresję do nowotworu złośliwego. Również podczas leczenia może się zdarzyć, że określone sygnatury drobnoustrojów są związane z niepełną eradykacją, tendencja do wznowy miejscowej lub potencjału przerzutowego. Poszukiwane będą korelacje z wznową miejscową (LR), przerzutami odległymi (DM) lub przeżyciem wolnym od choroby (DFS) dostosowane do korelacji kliniczno-patologicznych. W tym badaniu próbki błony śluzowej policzka będą pobierane od pacjentów z OSCC, OED oraz od osób zdrowych, po wyrażeniu świadomej zgody, zgodnie z protokołem helsińskim. Rutynowa diagnostyka patologiczna zostanie przeprowadzona przez ekspertów patologów w naszym ośrodku. Dane będą skorelowane z danymi demograficznymi i klinicznymi uzyskanymi z dokumentacji medycznej. Zostanie to przeprowadzone zgodnie z instytucjonalnymi wytycznymi etycznymi.