通过宏基因组病原体测序了解柬埔寨的发热性疾病情况
通过宏基因组病原体测序表征柬埔寨的温病景观
背景:
媒介传播的疾病是由受感染的蚊子、苍蝇、跳蚤、蜱或其他吸血动物叮咬引起的。 这些疾病每年导致近 100 万人死亡。 他们正在崛起,尤其是在东南亚。 研究人员认为,这些疾病约占柬埔寨发烧的 10%。 但其中许多疾病从未被诊断出来。 研究这些疾病可以帮助找到识别和治疗它们的新方法。
客观的:
使用宏基因组病原体测序平台在发烧人群中寻找病原体。
合格:
到柬埔寨转诊医院就诊的 6 个月至 65 岁发烧至少 38 摄氏度的人
设计:
参与者将接受他们的病史筛查。 孩子们将被称重以确保他们足够大以提供血液样本。
参与者将分享有关他们的性别、年龄和居住地的数据。 他们将回答更多关于他们健康史的问题。 他们将回答有关他们最近去过的任何地方的问题。 他们会做问卷调查。 他们将进行血液检查。
疟疾检测呈阳性的 2 岁或 2 岁以上的参与者将再进行一次血液检测。
参与将持续长达 2 天....
研究概览
详细说明
病媒传播的疾病继续导致严重的全球发病率和死亡率,尤其是在东南亚。 然而,由于资源匮乏的国家缺乏可用的诊断方法,许多病媒传播的疾病从未得到诊断,因此它们的影响未得到充分认识。 横断面回顾性调查显示,许多疾病的抗体流行率高于预期,包括蚊媒病毒和外寄生虫传播的立克次体病。
在这里,我们的目标是收集发热个体的标本,以使用新型基因组学技术(无偏下一代测序)更好地描述柬埔寨的发热性疾病情况,以调查柬埔寨儿童和成人不明原因疾病的可能传染性病因。 如果测序鉴定出一种引起公共卫生关注的高度传染性病原体,我们将从该个体身上采集一份恢复期样本,并通过血清学检测筛选他/她的密切接触者,以增加对疾病负担的了解。 随着目前全球范围内媒介传播疾病的兴起,我们希望这项研究的结果有助于更好地了解该地区媒介传播疾病的流行病学和负担。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Christina C Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
学习地点
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Chbar Mon、柬埔寨
- 招聘中
- Kampong Speu Referral Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、柬埔寨
- 招聘中
- National Pediatric Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、柬埔寨
- 招聘中
- Preah Kossomak Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、柬埔寨
- 招聘中
- Kantha Bopha Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh、柬埔寨
- 招聘中
- Khmer-Soviet Friendship Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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Takeo、柬埔寨
- 招聘中
- Takeo District Referral Hospital
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接触:
- Christina Yek, M.D.
- 电话号码:(202) 359-2641
- 邮箱:christina.yek@nih.gov
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
- 纳入标准:
为了有资格参加这项研究,个人必须满足以下所有标准:
提供签署并注明日期的知情同意书。
表示愿意遵守所有研究程序。
年龄在 6 个月至 65 岁之间的男性或女性,在过去 24 小时内有记录的发烧等于或大于 38 摄氏度。
愿意为未来的研究存储生物样本,并允许将所有去标识化的宏基因组测序数据存储在可公开访问的数据库中。
符合以下案例定义之一:
- 发热患者:在过去 24 小时内记录到等于或大于 38(无限)C 的发烧。
- 非发热密切接触者:是指在宏基因组测序中感染已知红旗或黄旗传染性病原体时,每天与发热登记者住在同一家庭或在同一封闭工作空间工作的非发热个体。
愿意为未来的研究存储生物样本,并允许将所有去标识化的宏基因组测序数据存储在可公开访问的数据库中。
排除标准:
研究者认为会干扰参与研究的任何潜在的、慢性的或当前的医疗状况(例如 无法或很难抽血)。
上个月做过手术的任何发热者。
在初始研究抽血后 30 天内登记并退出本研究的任何发热个体,或在 14 天内登记并退出的非发热密切接触者。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:队列
- 时间观点:横截面
队列和干预
团体/队列 |
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无发热密切接触者
每天与发烧的登记者住在同一个家庭或在同一个封闭的工作空间中工作,当时他们患有已知的高病态和/或传染性病原体。
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发热病人
2 个月至 65 岁之间出现发烧症状的患者,或通过临床验证的测试诊断出患有高度致病和/或传染性病原体的患者。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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病原体序列的鉴定
大体时间:注册(第 0-2 天)
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这是试图描述柬埔寨城郊地区不明原因发热性疾病中媒介传播的比例。
这项研究的数据将用于指导未来的研究。
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注册(第 0-2 天)
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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通过 ELISA 或蛋白质印迹分析检测到的适当载体对唾液腺匀浆反应性的评估。
大体时间:注册(第 0-2 天之间)
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表征患有媒介传播疾病的柬埔寨人的媒介唾液蛋白反应性特征(蚊子、蜱、跳蚤)是更好地了解传播模式、责任媒介和柬埔寨人接触这些媒介的风险的第一步。
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注册(第 0-2 天之间)
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Christina C Yek, M.D.、National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
出版物和有用的链接
一般刊物
- Vong S, Khieu V, Glass O, Ly S, Duong V, Huy R, Ngan C, Wichmann O, Letson GW, Margolis HS, Buchy P. Dengue incidence in urban and rural Cambodia: results from population-based active fever surveillance, 2006-2008. PLoS Negl Trop Dis. 2010 Nov 30;4(11):e903. doi: 10.1371/journal.pntd.0000903.
- Gu W, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annu Rev Pathol. 2019 Jan 24;14:319-338. doi: 10.1146/annurev-pathmechdis-012418-012751. Epub 2018 Oct 24.
- Tabor A, Valle MR. Report from the 'One Health' 9th Tick and Tick-Borne Pathogen Conference and the 1st Asia-Pacific Rickettsia Conference, Cairns, Australia, 27th August-1st September 2017. Vet Sci. 2018 Oct 2;5(4):85. doi: 10.3390/vetsci5040085.
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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