Kuumetautien maisema Kambodžassa metagenomisen patogeenisekvensoinnin kautta
Kambodžan kuumetautimaiseman karakterisointi metagenomisen patogeenisekvensoinnin avulla
Tausta:
Vektorivälitteiset sairaudet johtuvat tartunnan saaneen hyttysen, kärpäsen, kirppun, punkin tai muun veren ruokkijan puremasta. Nämä sairaudet aiheuttavat lähes miljoonan kuoleman vuosittain. Ja ne ovat nousussa, erityisesti Kaakkois-Aasiassa. Tutkijat uskovat, että nämä sairaudet muodostavat noin 10 prosenttia Kambodžan kuumeista. Mutta monia näistä sairauksista ei koskaan diagnosoida. Näiden sairauksien tutkiminen voi auttaa löytämään uusia tapoja tunnistaa ja hoitaa niitä.
Tavoite:
Patogeenien löytäminen ihmisistä, joilla on kuume, käyttämällä metagenomisia patogeenien sekvensointialustoja.
Kelpoisuus:
6 kuukauden - 65 vuoden ikäiset henkilöt, joilla on vähintään 38 celsiusasteinen kuume, jotka vierailevat lähetesairaalassa Kambodžassa
Design:
Osallistujat seulotaan heidän sairaushistoriansa perusteella. Lapset punnitaan sen varmistamiseksi, että he ovat tarpeeksi suuria ottamaan verinäytteitä.
Osallistujat jakavat tietoja sukupuolestaan, ikänsä ja asuinpaikastaan. He vastaavat lisää kysymyksiin heidän nummihistoriastaan. He vastaavat kysymyksiin ja kaikista paikoista, joissa he ovat äskettäin matkustaneet. He täyttävät kyselylomakkeen. Heille tehdään verikoe.
Yli 2-vuotiaille osallistujille, joiden malariatulos on positiivinen, tehdään vielä yksi verikoe.
Osallistuminen kestää jopa 2 päivää....
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Vektorivälitteiset taudit aiheuttavat edelleen merkittävää maailmanlaajuista sairastuvuutta ja kuolleisuutta erityisesti Kaakkois-Aasiassa. Koska resurssiköyhissä maissa ei ole saatavilla diagnostiikkaa, monia vektorivälitteisiä sairauksia ei kuitenkaan koskaan diagnosoida, ja siksi niiden vaikutusta aliarvioida. Poikkileikkausretrospektiiviset tutkimukset ovat paljastaneet odotettua suuremman vasta-aineiden esiintyvyyden useille sairauksille, mukaan lukien hyttysten levittämät virukset ja ulkoloisten levittämät riketsiataudit.
Tässä pyrimme keräämään näytteitä kuumeisista yksilöistä kuvaamaan paremmin Kambodžan kuumetautimaisemaa käyttämällä uusia genomiikkateknologioita (puolueton seuraavan sukupolven sekvensointi) tutkiaksemme kambodžalaisten lasten ja aikuisten selittämättömän etiologian sairauksien mahdollisia tarttuvia etiologioita. Jos sekvensointi tunnistaa erittäin tarttuvan kansanterveyteen liittyvän patogeenin, otamme yksilöstä toipilaan näytteen ja seulomme hänen läheiset kontaktinsa serologisiin määrityksiin lisätäksemme lisätietoa sairauden aiheuttamasta taakasta. Koska vektorivälitteiset sairaudet lisääntyvät tällä hetkellä ympäri maailmaa, toivomme, että tämän tutkimuksen tulokset auttavat ymmärtämään paremmin vektorivälitteisten tautien epidemiologiaa ja taakkaa tällä alueella.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Christina C Yek, M.D.
- Puhelinnumero: (202) 359-2641
- Sähköposti: christina.yek@nih.gov
Opiskelupaikat
-
-
-
Chbar Mon, Kambodža
- Rekrytointi
- Kampong Speu Referral Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Christina Yek, M.D.
- Puhelinnumero: (202) 359-2641
- Sähköposti: christina.yek@nih.gov
-
Phnom Penh, Kambodža
- Rekrytointi
- National Pediatric Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Christina Yek, M.D.
- Puhelinnumero: (202) 359-2641
- Sähköposti: christina.yek@nih.gov
-
Phnom Penh, Kambodža
- Rekrytointi
- Preah Kossomak Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Christina Yek, M.D.
- Puhelinnumero: (202) 359-2641
- Sähköposti: christina.yek@nih.gov
-
Takeo, Kambodža
- Rekrytointi
- Takeo District Referral Hospital
-
Ottaa yhteyttä:
- Christina Yek, M.D.
- Puhelinnumero: (202) 359-2641
- Sähköposti: christina.yek@nih.gov
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
- SISÄLLYTTÄMISKRITEERIT:
Voidakseen osallistua tähän tutkimukseen henkilön on täytettävä kaikki seuraavat kriteerit:
Allekirjoitetun ja päivätyn tietoisen suostumuslomakkeen toimittaminen.
Ilmoitettu halu noudattaa kaikkia opintomenettelyjä.
Mies tai nainen, iältään 6 kuukautta - 65 vuotta, joilla on dokumentoitu kuume vähintään 38 celsiusastetta edellisten 24 tunnin aikana.
Haluan sallia biologisten näytteiden tallentamisen tulevaa tutkimusta varten ja kaikkien de-identifioitujen metagenomien sekvensointitietojen tallentamisen julkisiin tietokantoihin.
Täyttää yhden seuraavista tapausmääritelmistä:
- Kuumeinen potilas: hänellä on dokumentoitu kuume 38 (ääretön) C tai korkeampi edellisen 24 tunnin aikana.
- Kuumeen läheinen kontakti: on kuumeinen henkilö, joka asui samassa taloudessa tai työskenteli päivittäin samassa suljetussa työtilassa kuumeisen rekisteröidyn kanssa silloin, kun he sairastuivat metagenomisen sekvensoinnin perusteella tunnetun punaisen tai keltaisen lipun tarttuvaan patogeeniin.
Haluan sallia biologisten näytteiden tallentamisen tulevaa tutkimusta varten ja kaikkien de-identifioitujen metagenomien sekvensointitietojen tallentamisen julkisiin tietokantoihin.
POISTAMISKRITEERIT:
Mikä tahansa taustalla oleva, krooninen tai nykyinen sairaus, joka tutkijan mielestä häiritsisi tutkimukseen osallistumista (esim. kyvyttömyys tai suuret verenottovaikeudet).
Jokainen kuumeinen henkilö, jolle on tehty leikkaus edellisen kuukauden aikana.
Kaikki kuumeiset henkilöt, jotka ilmoittautuivat tähän tutkimukseen ja poistuivat tutkimuksesta 30 päivän sisällä ensimmäisestä tutkimuksesta, tai kuumeinen lähikontakti, joka ilmoittautui tutkimukseen ja poistui 14 päivän kuluessa.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Havaintomallit: Kohortti
- Aikanäkymät: Poikkileikkaus
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Afebrile lähikontakti
Asuivat samassa taloudessa tai työskentelivät päivittäin samassa suljetussa työtilassa kuumeisen oppilaan kanssa, kun he sairastuivat tunnettuun erittäin sairaaseen ja/tai tarttuvaan taudinaiheuttajaan.
|
|
Kuumeinen potilas
2 kuukauden ja 65 vuoden ikäiset potilaat, joilla on kuumetta tai joilla on kliinisesti validoiduilla testeillä diagnosoitu erittäin sairas ja/tai tarttuva patogeeni.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Patogeenisekvenssien tunnistaminen
Aikaikkuna: Ilmoittautuminen (päivä 0-2)
|
Tämä on yritys luonnehtia, kuinka suuri osa selittämättömästä kuumeisesta sairaudesta on vektorivälitteinen Kambodžan esikaupunkialueella.
Tämän tutkimuksen tietoja käytetään ohjaamaan tulevia tutkimuksia.
|
Ilmoittautuminen (päivä 0-2)
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Sopivan vektorin reaktiivisuuden arviointi sylkirauhashomogenaatin reaktiivisuuden suhteen ELISA- tai Western blot -määrityksillä havaittuna.
Aikaikkuna: Ilmoittautuminen (päivä 0-2)
|
Vektorin sylkiproteiinien reaktiivisuusprofiilien (hyttyset, punkit, kirput) karakterisointi kambodžalaisilla, joilla on vektorin välityksellä leviävä tauti, on ensimmäinen askel ymmärtää paremmin tartuntamalleja, vastuullisia vektoreita ja kambodžalaisten riskiä altistua näille vektoreille.
|
Ilmoittautuminen (päivä 0-2)
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Christina C Yek, M.D., National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Vong S, Khieu V, Glass O, Ly S, Duong V, Huy R, Ngan C, Wichmann O, Letson GW, Margolis HS, Buchy P. Dengue incidence in urban and rural Cambodia: results from population-based active fever surveillance, 2006-2008. PLoS Negl Trop Dis. 2010 Nov 30;4(11):e903. doi: 10.1371/journal.pntd.0000903.
- Gu W, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annu Rev Pathol. 2019 Jan 24;14:319-338. doi: 10.1146/annurev-pathmechdis-012418-012751. Epub 2018 Oct 24.
- Tabor A, Valle MR. Report from the 'One Health' 9th Tick and Tick-Borne Pathogen Conference and the 1st Asia-Pacific Rickettsia Conference, Cairns, Australia, 27th August-1st September 2017. Vet Sci. 2018 Oct 2;5(4):85. doi: 10.3390/vetsci5040085.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 999919109
- 19-I-N109
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Vektorien välityksellä leviävät sairaudet
-
University Clinical Research Center, MaliEi vielä rekrytointia