Paesaggio della malattia febbrile in Cambogia attraverso il sequenziamento del patogeno metagenomico
Caratterizzazione del paesaggio delle malattie febbrili in Cambogia tramite sequenziamento metagenomico dei patogeni
Sfondo:
Le malattie trasmesse da vettori sono causate dal morso di una zanzara infetta, una mosca, una pulce, una zecca o un altro alimentatore di sangue. Queste malattie causano quasi 1 milione di morti all'anno. E sono in aumento, in particolare nel sud-est asiatico. I ricercatori pensano che queste malattie rappresentino circa il 10% delle febbri in Cambogia. Ma molte di queste malattie non vengono mai diagnosticate. Lo studio di queste malattie può aiutare a trovare nuovi modi per identificarle e curarle.
Obbiettivo:
Per trovare agenti patogeni nelle persone che hanno la febbre utilizzando piattaforme di sequenziamento dei patogeni metagenomici.
Eleggibilità:
Persone di età compresa tra 6 mesi e 65 anni con febbre di almeno 38 gradi Celsius che visitano l'ospedale di riferimento in Cambogia
Disegno:
I partecipanti verranno selezionati con la loro storia medica. I bambini verranno pesati per assicurarsi che siano abbastanza grandi da fornire campioni di sangue.
I partecipanti condivideranno dati sul loro sesso, età e dove vivono. Risponderanno ad altre domande sulla loro storia di salute. Risponderanno a domande su e su tutti i luoghi in cui hanno viaggiato di recente. Prenderanno un questionario. Faranno un esame del sangue.
I partecipanti di età pari o superiore a 2 anni che risultano positivi alla malaria avranno un altro esame del sangue.
La partecipazione durerà massimo 2 giorni....
Panoramica dello studio
Stato
Condizioni
Descrizione dettagliata
Le malattie trasmesse da vettori continuano a causare morbilità e mortalità globali significative, in particolare nel sud-est asiatico. Tuttavia, data la mancanza di diagnostica disponibile nei paesi poveri di risorse, molte malattie trasmesse da vettori non vengono mai diagnosticate e quindi il loro impatto è sottovalutato. Indagini retrospettive trasversali hanno rivelato una prevalenza anticorpale superiore al previsto per una serie di malattie, tra cui virus trasmessi dalle zanzare e malattie da rickettsie trasmesse da ectoparassiti.
Qui, miriamo a raccogliere campioni da individui febbrili per descrivere meglio il panorama delle malattie febbrili della Cambogia utilizzando nuove tecnologie genomiche (sequenziamento imparziale di nuova generazione) per indagare su possibili eziologie infettive di malattie di eziologia inspiegabile nei bambini e negli adulti cambogiani. Se il sequenziamento identifica un patogeno altamente trasmissibile di interesse per la salute pubblica, prenderemo un campione convalescente dall'individuo e vaglieremo i suoi contatti stretti con test sierologici per aggiungere un ulteriore livello di comprensione al carico della malattia. Con l'attuale aumento delle malattie trasmesse da vettori in tutto il mondo, speriamo che i risultati di questo studio contribuiscano a comprendere meglio l'epidemiologia e il carico delle malattie trasmesse da vettori in questa regione.
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Contatti e Sedi
Contatto studio
- Nome: Christina C Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
Luoghi di studio
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Chbar Mon, Cambogia
- Reclutamento
- Kampong Speu Referral Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh, Cambogia
- Reclutamento
- National Pediatric Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh, Cambogia
- Reclutamento
- Preah Kossomak Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh, Cambogia
- Reclutamento
- Kantha Bopha Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Phnom Penh, Cambogia
- Reclutamento
- Khmer-Soviet Friendship Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Takeo, Cambogia
- Reclutamento
- Takeo District Referral Hospital
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Contatto:
- Christina Yek, M.D.
- Numero di telefono: (202) 359-2641
- Email: christina.yek@nih.gov
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Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
- CRITERIO DI INCLUSIONE:
Per poter partecipare a questo studio, un individuo deve soddisfare tutti i seguenti criteri:
Fornitura del modulo di consenso informato firmato e datato.
Dichiarata disponibilità a rispettare tutte le procedure dello studio.
Maschio o femmina, di età compresa tra 6 mesi e 65 anni, con febbre documentata pari o superiore a 38 gradi Celsius nelle 24 ore precedenti.
Disponibilità a consentire l'archiviazione di campioni biologici per ricerche future e l'archiviazione di tutti i dati di sequenziamento metagenomico deidentificati in database accessibili al pubblico.
Soddisfa una delle seguenti definizioni di caso:
- Paziente febbrile: ha documentato febbre pari o superiore a 38 (Infinite)C nelle 24 ore precedenti.
- Contatto ravvicinato afebbrile: è un individuo afebbrile che viveva nella stessa famiglia o lavorava quotidianamente nello stesso spazio di lavoro chiuso con un iscritto febbrile nel momento in cui si è ammalato di un noto patogeno trasmissibile con bandiera rossa o gialla sul sequenziamento metagenomico.
Disponibilità a consentire l'archiviazione di campioni biologici per ricerche future e l'archiviazione di tutti i dati di sequenziamento metagenomico deidentificati in database accessibili al pubblico.
CRITERI DI ESCLUSIONE:
Qualsiasi condizione medica sottostante, cronica o attuale che, secondo il parere dello sperimentatore, interferirebbe con la partecipazione allo studio (ad es. incapacità o grande difficoltà nel prelievo di sangue).
Qualsiasi individuo febbrile che ha subito un intervento chirurgico nel mese precedente.
Qualsiasi individuo febbrile che si è arruolato ed è uscito da questo studio entro 30 giorni dal prelievo di sangue iniziale dello studio, o contatto stretto afebbrile che si è arruolato ed è uscito entro 14 giorni.
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Trasversale
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
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Contatto stretto afebbrile
Viveva nella stessa famiglia o lavorava quotidianamente nello stesso spazio di lavoro chiuso con un iscritto febbrile nel momento in cui si è ammalato di un noto agente patogeno altamente morboso e/o trasmissibile.
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Paziente febbrile
Pazienti di età compresa tra 2 mesi e 65 anni che si presentano con febbre o con diagnosi di un agente patogeno altamente morboso e/o trasmissibile mediante test clinicamente validati.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Identificazione delle sequenze dei patogeni
Lasso di tempo: Iscrizione (tra il giorno 0-2)
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Questo è un tentativo di caratterizzare quale frazione di malattie febbrili inspiegabili è trasmessa da vettori nella Cambogia periurbana.
I dati di questo studio verranno utilizzati per guidare gli studi futuri.
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Iscrizione (tra il giorno 0-2)
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Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Valutazione della reattività alla reattività dell'omogenato delle ghiandole salivari del vettore appropriato come rilevato mediante test ELISA o Western blot.
Lasso di tempo: Iscrizione (tra il giorno 0-2)
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La caratterizzazione dei profili di reattività delle proteine salivari del vettore (zanzare, zecche, pulci) nei cambogiani con malattie trasmesse da vettori è il primo passo per comprendere meglio i modelli di trasmissione, i vettori responsabili e il rischio di esposizione dei cambogiani a questi vettori.
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Iscrizione (tra il giorno 0-2)
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Collaboratori e investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Christina C Yek, M.D., National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Vong S, Khieu V, Glass O, Ly S, Duong V, Huy R, Ngan C, Wichmann O, Letson GW, Margolis HS, Buchy P. Dengue incidence in urban and rural Cambodia: results from population-based active fever surveillance, 2006-2008. PLoS Negl Trop Dis. 2010 Nov 30;4(11):e903. doi: 10.1371/journal.pntd.0000903.
- Gu W, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annu Rev Pathol. 2019 Jan 24;14:319-338. doi: 10.1146/annurev-pathmechdis-012418-012751. Epub 2018 Oct 24.
- Tabor A, Valle MR. Report from the 'One Health' 9th Tick and Tick-Borne Pathogen Conference and the 1st Asia-Pacific Rickettsia Conference, Cairns, Australia, 27th August-1st September 2017. Vet Sci. 2018 Oct 2;5(4):85. doi: 10.3390/vetsci5040085.
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Inizio studio (Effettivo)
Completamento primario (Stimato)
Completamento dello studio (Stimato)
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Effettivo)
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
Altri numeri di identificazione dello studio
- 999919109
- 19-I-N109
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