KEBI-Cyto 研究 - Biocartis Idylla 的使用

医学的进步导致了特定药物的开发，以治疗表达某些突变的癌症。 通过检测肺癌中的表皮生长因子受体 (EGFR)、BRAF 和 KRAS 突变（分别为 10-30%、1-2%、25%）和 94% 的胰腺癌中的 KRAS 突变，这些患者可以接受更广泛的药物队列，可能导致无进展、延长的生存期，与化疗相比具有更好的耐受性和更少的不良反应。

NHS England 有一个测试目录，其中列出了信托机构应该为癌症患者提供的分子测试。 EGRF、KRAS 和 BRAF 列在此目录中。 验证 Idylla 的使用将使这种信任能够有效地提供所有这些分子测试。 肺癌和胰腺癌都处于晚期疾病状态，因此检测结果的快速周转至关重要。 目前实验室依靠使用福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 样本进行 EGFR 检测。

凝块在实验室中产生，以将所有组织碎片和细胞凝结成一个固体块。 然后将凝结的样本固定在福尔马林中并进行处理。 当前的处理和报告时间为 5 天。 通过相同取样程序获得的液基细胞学 (LBC) 标本也在实验室中制备，并使用称为 Preservcyt 的甲醇基固定剂固定。 之前的研究已经进行，以确定是否可以使用 LBC 样本代替 FFPE 样本进行突变检测，并获得良好的结果。 改用 LBC 样本对 Idylla 进行突变分析将删除多个处理步骤并利用目前丢弃的残留样本，这优化了我们可以在小细胞学样本上运行的测试量，减少重复的可能性病人的程序。 酒精固定被认为是一种更好的 DNA 和 RNA 保存方法，因此可以看到更好的分子结果。

循环肿瘤细胞突变的检测在未来可能会消除对侵入性手术的需要，患者需要进行简单的血液检测才能进行诊断。

该研究的目的是确定 LBC 样本是否是 FFPE 样本的可行且可靠的替代品，用于使用 Idylla 平台检测 LBC 样本和血液中的突变。

假设：使用 FFPE 样本鉴定的 EFGR、KRAS 和 BRAF 突变将使用 Biocartis Idylla ™ 平台在 LBC 和血浆样本中检测到。

研究的第 1 部分：（先前研究项目的扩展 - IRAS 编号：261622）将使用来自发送到实验室的现有 LBC 细胞学样本的残留材料。 例行测试将优先进行。 确定为非小细胞肺癌的病例将在 Idylla 平台上对残留的 LBC 样本进行 EGFR、KRAS 和 BRAF 检测。 使用常规诊断程序（FFPE 样品）获得的 EGFR、KRAS 和 BRAF 突变结果将与使用 LBC 样品产生的结果进行比较。

本研究的第 2 部分：

将涉及测试自 2014 年以来确诊的胰腺癌患者的存档 FFPE 凝块样本（每年约 20 例）。 KRAS 测试将使用 Idylla 平台进行，以确定 RCHT 报告的 94% 的病例中是否存在 KRAS 密码子 12 突变。 患者将同意在手术时使用他们的组织。 被诊断患有胰腺癌的前瞻性新患者将对 FFPE 凝块进行 KRAS 检测，作为常规诊断工作的一部分，并对 LBC 样本进行 KRAS 检测。

本研究的第 3 部分：

将涉及在手术时从临床怀疑患有肺癌或胰腺癌的患者身上采集血样。 单个血样将从为手术插入的插管中采集。 血液样本将使用 Biocartis Idylla ™循环肿瘤细胞盒（EFGR、KRAS 和 BRAF 用于肺，KRAS 用于胰腺）进行处理。

纳入研究的样本将由在细胞学部门工作的（直接护理团队的成员）确定，他将每周进行一次计算机化搜索，并确定已被诊断患有非小细胞肺癌或胰腺癌的患者。 患者的原始实验室编号将被输入到一个安全的、受密码保护的数据库中，然后患者将被分配一个新的研究编号。 该数据库和患者信息只能由高级生物医学科学家访问，并将存储在符合信息管理和患者保密规定的安全电子文件中。 患者样本将标有研究编号和原始实验室编号，所有患者信息都将被覆盖。 研究人员将无法访问任何患者信息，也无法识别任何患者。 高级生物医学科学家会将研究的匿名结果存储到数据库中。 学习期限为24个月。 预计届时将对以下数量的患者进行检测：

100 例非小细胞肺癌患者 60 例回顾性胰腺癌样本 40 例前瞻性胰腺癌患者

由多学科团队参加 EUS（内窥镜超声）或 EBUS（支气管内超声）引导的细针穿刺，临床怀疑非小细胞肺癌或胰腺癌的患者。 纳入研究的样本将由在细胞学部门工作的高级生物医学科学家（直接护理团队成员）确定，他将每周进行一次计算机化搜索，并确定已被诊断患有肺非小细胞癌和胰腺癌的患者腺癌。 患者的原始实验室编号将被输入到一个安全的、受密码保护的数据库中，然后患者将被分配一个新的研究编号。 该数据库和患者信息只能由高级生物医学科学家访问，并将存储在符合信息管理和患者保密规定的安全文件中。 患者样本将标有研究编号和原始实验室编号，所有患者信息都将被覆盖。 研究人员将无法访问任何患者信息，也无法识别任何患者。 不符合研究标准的样本将根据实验室规程丢弃。

所有患者数据（包括组织样本和相关报告）在发布给主要研究人员之前将被匿名化。 可识别的数据由实验室编号链接。 此信息存储在一个安全的数据库中，只有直接护理团队的成员才能访问。

所有信息都存储在皇家康沃尔医院的安全服务器上并进行备份。 所有与研究相关的数据库都将受到密码保护，并由 RCHT IT 部门监控。 数据库本身的位置只能由授权用户访问。

本研究不需要进一步的患者干预。

如果发现液基细胞学 (LBC) 样本是 EGFR、KRAS 和 BRAF 突变检测的可行替代方案，则这有可能导致：

• 在明确的腺癌病例中，结果的周转时间更快。 这将提供
• 尽早获得治疗可实现最佳患者管理。
• 根据 NHS 测试库的建议，扩大内部提供的分子测试范围。
• 更容易在实验室内制备样品
• 提高材料的使用效率也可以防止对患者重复取样程序。
• 使用 LBC 样品可能会从分子检测中获得更好的结果（甲醇固定剂优于福尔马林）。
• 支持使用血样检测循环肿瘤细胞（微创取样）。 这可以确定在什么疾病阶段可以在血浆中检测到循环肿瘤细胞，这将使其成为未来潜在的诊断分类和后续工具。
• 支持胰腺癌的 KRAS 突变检测和针对密码子 12 突变的靶向治疗的未来开发