KEBI-Cyto Studie - Gebruik van de Biocartis Idylla

Vooruitgang in de geneeskunde heeft geresulteerd in de ontwikkeling van specifieke geneesmiddelen voor de behandeling van kankers die bepaalde mutaties tot uiting brengen. De detectie van epidermale groeifactorreceptor (EGFR), BRAF- en KRAS-mutaties (respectievelijk 10-30%, 1-2%, 25%) bij longkanker en KRAS-mutaties bij 94% van de pancreaskankers maakt het mogelijk deze patiënten te behandelen met een breder cohort van geneesmiddelen, mogelijk resulterend in progressievrije, verlengde overleving, met een gunstigere verdraagbaarheid en minder nadelige effecten in vergelijking met chemotherapie.

NHS England heeft een testdirectory met de moleculaire tests die trusts zouden moeten bieden aan kankerpatiënten. EGRF, KRAS en BRAF worden in deze directory vermeld. Verificatie van het gebruik van de Idylla zou dit vertrouwen in staat stellen om al deze moleculaire tests effectief uit te voeren. Long- en alvleesklierkanker zijn beide aanwezig in een vergevorderd stadium van de ziekte en daarom is een snelle ommekeer van de testresultaten van vitaal belang. Momenteel vertrouwen laboratoria op het gebruik van in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) monsters voor EGFR-testen.

In het laboratorium worden stolsels geproduceerd om alle weefselfragmenten en cellen tot één vaste massa te laten stollen. Het gestolde monster wordt vervolgens gefixeerd in formaline en verwerkt. De huidige verwerkings- en rapportagetijd is 5 dagen. Cytologiemonsters op vloeistofbasis (LBC) die via dezelfde bemonsteringsprocedures zijn verkregen, worden ook in het laboratorium geprepareerd en gefixeerd met behulp van een op methanol gebaseerd fixeermiddel genaamd Preservcyt. Eerder onderzoek is uitgevoerd om te bepalen of LBC-monsters kunnen worden gebruikt in plaats van FFPE-monsters voor mutatiedetectie met gunstige resultaten. Een overstap naar het gebruik van LBC-stalen voor mutatieanalyse op de Idylla zou meerdere verwerkingsstappen wegnemen en gebruik maken van reststalen die momenteel worden weggegooid, wat de hoeveelheid testen die we kunnen uitvoeren op kleine cytologiestalen optimaliseert, waardoor de kans op herhaling afneemt procedures voor patiënten. Alcoholfixatie wordt beschouwd als een superieure methode voor het bewaren van DNA en RNA, daarom zullen betere moleculaire resultaten worden gezien.

Detectie van circulerende tumorcelmutaties zou in de toekomst de noodzaak van invasieve procedures teniet kunnen doen, waarbij patiënten een eenvoudige bloedtest nodig hebben voor de diagnose.

Het doel van de studie is om te bepalen of LBC-stalen een haalbaar en betrouwbaar alternatief zijn voor FFPE-stalen voor het detecteren van mutaties in LBC-stalen en bloed met behulp van het Idylla-platform.

Hypothese: EFGR-, KRAS- en BRAF-mutaties geïdentificeerd met behulp van FFPE-stalen zullen worden gedetecteerd in LBC- en bloedplasmastalen met behulp van het Biocartis Idylla™-platform.

Deel 1 van de studie: (uitbreiding van eerder onderzoeksproject - IRAS-nummer: 261622) Zal restmateriaal gebruiken van bestaande LBC-cytologiemonsters die naar het laboratorium zijn gestuurd. Routinematig testen krijgt voorrang. Gevallen geïdentificeerd als niet-kleincellig longcarcinoom zullen het resterende LBC-monster laten testen op het Idylla-platform voor EGFR, KRAS en BRAF. De EGFR-, KRAS- en BRAF-mutatieresultaten die zijn verkregen met behulp van de routinematige diagnostische procedure (FFPE-monsters) zullen worden vergeleken met die geproduceerd met behulp van de LBC-monsters.

Deel 2 van deze studie:

Het omvat het testen van gearchiveerde FFPE-stolselmonsters van bevestigde pancreasadenocarcinoompatiënten sinds 2014 (ongeveer 20 gevallen per jaar). KRAS-testen zullen worden uitgevoerd met behulp van het Idylla-platform om vast te stellen of er een KRAS-codon 12-mutatie aanwezig is in 94% procent van de gevallen gerapporteerd bij RCHT. Patiënten zullen op het moment van de procedure hebben ingestemd met het gebruik van hun weefsel. Toekomstige nieuwe patiënten met de diagnose adenocarcinoom van de alvleesklier zullen KRAS-testen ondergaan op het FFPE-stolsel dat is gemaakt als onderdeel van het routinematige diagnostische onderzoek en KRAS-testen op het LBC-monster.

Deel 3 van deze studie:

Tijdens de ingreep wordt bloed afgenomen bij patiënten bij wie een klinisch vermoeden bestaat dat ze long- of alvleesklierkanker hebben. Het enkele bloedmonster wordt genomen uit de canule die voor de procedure is ingebracht. Het bloedmonster zal worden verwerkt met behulp van de Biocartis Idylla ™ circulerende tumorcelpatronen (EFGR, KRAS en BRAF voor long en KRAS voor pancreas).

Monsters voor opname in het onderzoek zullen worden geïdentificeerd door een (lid van het directe zorgteam) die op de afdeling cytologie werkt en die elke week een gecomputeriseerde zoekopdracht uitvoert en patiënten identificeert bij wie de diagnose niet-kleincellig longcarcinoom of adenocarcinoom van de pancreas is gesteld. Het oorspronkelijke laboratoriumnummer van de patiënt wordt ingevoerd in een beveiligde, met een wachtwoord beveiligde database en de patiënt krijgt vervolgens een nieuw studienummer toegewezen. Deze database en patiëntinformatie zijn alleen toegankelijk voor de senior biomedische wetenschapper en worden opgeslagen in een beveiligd elektronisch bestand in overeenstemming met het informatiebeheer en de vertrouwelijkheid van de patiënt. Patiëntmonsters worden gelabeld met het studienummer en het originele laboratoriumnummer en alle patiëntinformatie wordt afgedekt. De onderzoeker heeft geen toegang tot patiëntgegevens en kan geen patiënten identificeren. De senior biomedische wetenschapper slaat de geanonimiseerde resultaten van het onderzoek op in de database. De duur van de studie zal 24 maanden zijn. In welke tijd wordt geschat dat het volgende aantal patiënten zal worden getest:

100 patiënten voor niet-kleincellig longcarcinoom 60 retrospectieve pancreasadenocarcinoommonsters 40 prospectieve pancreasadenocarcinoompatiënten

Patiënten die aanwezig waren voor EUS (Endoscopische echografie) of EBUS (Endobronchiale echografie) geleiden fijne naaldaspiraties met een klinisch vermoeden van niet-kleincellig longcarcinoom of pancreascarcinoom door een multidisciplinair team. Monsters voor opname in het onderzoek zullen worden geïdentificeerd door een senior biomedische wetenschapper (lid van het directe zorgteam) die op de afdeling cytologie werkt en die elke week een gecomputeriseerde zoekopdracht zal uitvoeren en patiënten zal identificeren bij wie de diagnose niet-kleincellig longcarcinoom en alvleesklierkanker is gesteld. adenocarcinoom. Het oorspronkelijke laboratoriumnummer van de patiënt wordt ingevoerd in een beveiligde, met een wachtwoord beveiligde database en de patiënt krijgt vervolgens een nieuw studienummer toegewezen. Deze database en patiëntinformatie zijn alleen toegankelijk voor de senior biomedische wetenschapper en worden opgeslagen in een beveiligd bestand in overeenstemming met het informatiebeheer en de vertrouwelijkheid van de patiënt. Patiëntmonsters worden gelabeld met het studienummer en het originele laboratoriumnummer en alle patiëntinformatie wordt afgedekt. De onderzoeker heeft geen toegang tot patiëntgegevens en kan geen patiënten identificeren. Monsters die niet voldoen aan de onderzoekscriteria zullen worden weggegooid in overeenstemming met het laboratoriumprotocol.

Alle patiëntgegevens (inclusief weefselmonsters en bijbehorende rapporten) worden geanonimiseerd voordat ze worden vrijgegeven aan de primaire onderzoeker. De identificeerbare gegevens zijn gekoppeld door een laboratoriumnummer. Deze informatie wordt opgeslagen in een beveiligde database die alleen toegankelijk is voor een lid van het directe zorgteam.

Alle informatie wordt opgeslagen en geback-upt op beveiligde servers in het Royal Cornwall Hospital. Alle voor het onderzoek relevante databases worden met een wachtwoord beveiligd en dit wordt gecontroleerd door de IT-afdeling van RCHT. De locatie van de databases zelf zal alleen toegankelijk zijn voor geautoriseerde gebruikers.

Voor dit onderzoek is geen verdere tussenkomst van de patiënt vereist.

Als op vloeistof gebaseerde cytologie (LBC) monsters een haalbaar alternatief blijken te zijn voor EGFR-, KRAS- en BRAF-mutatietesten, kan dit resulteren in:

• Snellere doorlooptijd van resultaten in gevallen van ondubbelzinnig adenocarcinoom. Dit zou voorzien
• Eerdere toegang tot behandeling voor optimaal patiëntenbeheer.
• Breidt het scala aan moleculaire tests uit dat intern wordt geleverd, zoals aanbevolen door de NHS-testbibliotheek.
• Eenvoudigere monstervoorbereiding in het laboratorium
• Toename van efficiënt gebruik van materiaal zou ook herhaalde bemonsteringsprocedures bij patiënten kunnen voorkomen.
• Het gebruik van LBC-monsters kan zorgen voor betere resultaten van moleculaire testen (methanol superieur fixeermiddel ten opzichte van formaline).
• Ondersteunt het gebruik van bloedmonstertesten voor circulerende tumorcellen (minder invasieve monstername). Dit kan identificeren bij welke ziektestadia circulerende tumorcellen kunnen worden gedetecteerd in bloedplasma, wat het een mogelijk toekomstig hulpmiddel voor diagnostische triage en follow-up zou maken.
• Ondersteunt KRAS-mutatietesten voor pancreasadenocarcinoom en toekomstige ontwikkeling van doeltherapieën die specifiek zijn voor de codon 12-mutatie