KEBI-Cyto-tutkimus - Biocartis Idyllan käyttö

Lääketieteen kehitys on johtanut tiettyjen lääkkeiden kehittämiseen tiettyjä mutaatioita ilmentävien syöpien hoitoon. Epidermaalisen kasvutekijäreseptorin (EGFR), BRAF- ja KRAS-mutaatioiden (10-30 %, 1-2 % ja 25 % vastaavasti) havaitseminen keuhkosyövissä ja KRAS-mutaatioiden havaitseminen 94 %:ssa haimasyövistä mahdollistaa näiden potilaiden hoidon laajempi lääkeryhmä, mikä saattaa johtaa taudin etenemiseen, pidentyneeseen eloonjäämiseen, edullisemmalla siedettävyydellä ja vähemmän haittavaikutuksilla verrattuna kemoterapiaan.

Englannin NHS:llä on testihakemisto, jossa luetellaan molekyylitestit, joita trustien tulisi tarjota syöpäpotilaille. EGRF, KRAS ja BRAF on lueteltu tässä hakemistossa. Idyllan käytön varmentaminen antaisi tälle luottamukselle mahdollisuuden tarjota kaikki nämä molekyylitestit tehokkaasti. Sekä keuhko- että haimasyöpiä esiintyy edenneissä sairaustiloissa, ja siksi testitulosten nopea käännös on elintärkeää. Tällä hetkellä laboratoriot luottavat formaliiniin kiinnitettyjen parafiiniin upotettujen (FFPE) näytteiden käyttöön EGFR-testauksessa.

Laboratoriossa tuotetaan hyytymiä kaikkien kudosfragmenttien ja solujen jähmettämiseksi yhdeksi kiinteäksi massaksi. Hyytynyt näyte kiinnitetään sitten formaliiniin ja käsitellään. Nykyinen käsittely- ja raportointiaika on 5 päivää. Samoilla näytteenottomenetelmillä saadut nestepohjaiset sytologianäytteet (LBC) valmistetaan myös laboratoriossa ja kiinnitetään Preservcyt-nimisellä metanolipohjaisella kiinnitysaineella. Aikaisempia tutkimuksia on tehty sen selvittämiseksi, voidaanko LBC-näytteitä käyttää FFPE-näytteiden sijasta mutaatioiden havaitsemiseen suotuisin tuloksin. Siirtyminen LBC-näytteiden käyttöön Idylla-mutaatioanalyysissä poistaisi useita prosessointivaiheita ja käyttäisi tällä hetkellä hylättyjä jäännösnäytteitä, mikä optimoi pienillä sytologisilla näytteillä suoritettavien testien määrän, mikä vähentää toistumisen todennäköisyyttä. menettelyt potilaille. Alkoholikiinnitystä pidetään ylivoimaisena DNA:n ja RNA:n säilytysmenetelmänä, joten parempia molekyylituloksia nähdään.

Kiertävien kasvainsolumutaatioiden havaitseminen voisi tulevaisuudessa tehdä tyhjäksi invasiivisten toimenpiteiden tarpeen, jolloin potilaat tarvitsevat yksinkertaisen verikokeen diagnoosia varten.

Tutkimuksen tavoitteena on selvittää, ovatko LBC-näytteet käyttökelpoinen ja luotettava vaihtoehto FFPE-näytteille mutaatioiden havaitsemiseen LBC-näytteistä ja verestä Idylla-alustan avulla.

Hypoteesi: FFPE-näytteillä tunnistetut EFGR-, KRAS- ja BRAF-mutaatiot havaitaan LBC- ja veriplasmanäytteistä Biocartis Idylla™ -alustan avulla.

Tutkimuksen osa 1: (aiemman tutkimusprojektin laajennus - IRAS-numero: 261622) Käyttää jäännösmateriaalia olemassa olevista laboratorioon lähetetyistä LBC-sytologisista näytteistä. Rutiinitestit ovat etusijalla. Tapauksista, jotka on tunnistettu ei-pienisoluiseksi keuhkokarsinoomaksi, jäljellä oleva LBC-näyte testataan Idylla-alustalla EGFR:n, KRAS:n ja BRAF:n varalta. Rutiininomaisella diagnostisella menettelyllä saatuja EGFR-, KRAS- ja BRAF-mutaatiotuloksia (FFPE-näytteet) verrataan LBC-näytteitä käyttämällä saatuihin tuloksiin.

Tämän tutkimuksen osa 2:

Sisältää arkistoitujen FFPE-hyytymänäytteiden testaamisen vahvistetuilta haimaadenokarsinoomapotilailta vuodesta 2014 lähtien (noin 20 tapausta vuodessa). KRAS-testaus suoritetaan Idylla-alustalla sen selvittämiseksi, onko KRAS-kodoni 12 -mutaatio läsnä 94 %:ssa RCHT:ssa raportoiduista tapauksista. Potilaat ovat antaneet suostumuksensa kudoksensa käyttöön toimenpiteen aikana. Mahdollisesti uusille potilaille, joilla on diagnosoitu haiman adenokarsinooma, tehdään KRAS-testi FFPE-hyytymälle osana rutiinidiagnostista työtä ja KRAS-testi LBC-näytteestä.

Tämän tutkimuksen osa 3:

Siihen liittyy verinäyte toimenpiteen aikana potilailta, joilla on kliininen epäily keuhko- tai haimasyövästä. Yksittäinen verinäyte otetaan toimenpidettä varten asetetusta kanyylistä. Verinäyte käsitellään Biocartis Idylla™ -kasvainsoluilla (EFGR, KRAS ja BRAF keuhkoihin ja KRAS haimaan).

Tutkimukseen sisällytettävät näytteet tunnistaa sytologian osastolla työskentelevä (suoran hoitoryhmän jäsen), joka suorittaa tietokoneistetun haun joka viikko ja tunnistaa potilaat, joilla on diagnosoitu ei-pienisoluinen keuhkosyöpä tai haiman adenokarsinooma. Potilaan alkuperäinen laboratorionumero syötetään suojattuun, salasanalla suojattuun tietokantaan ja potilaalle annetaan sitten uusi tutkimusnumero. Tämä tietokanta ja potilastiedot ovat vain vanhemman biolääketieteen tutkijan käytettävissä, ja ne tallennetaan suojattuun sähköiseen tiedostoon tiedonhallintaa ja potilaiden luottamuksellisuutta noudattaen. Potilasnäytteet merkitään tutkimuksen numerolla ja alkuperäisellä laboratorion numerolla ja kaikki potilastiedot peitetään. Tutkijalla ei ole pääsyä potilastietoihin, eikä hän voi tunnistaa potilaita. Vanhempi biolääketieteellinen tutkija tallentaa tutkimuksen anonymisoidut tulokset tietokantaan. Opintojen kesto on 24 kuukautta. Mihin aikaan on arvioitu, että seuraava määrä potilaita testataan:

100 potilasta ei-pienisoluiseen keuhkosyöpään 60 retrospektiivistä haiman adenokarsinoomanäytettä 40 mahdollista haimaadenokarsinoomapotilasta

Potilaat, jotka osallistuvat EUS- (Endoskooppinen ultraääni) tai EBUS- (Endobronkiaalinen ultraääni) -tutkimukseen, monitieteinen tiimi ohjasi hienon neulan aspiraatiota, kun epäiltiin kliinisesti ei-pienisoluista keuhkosyöpää tai haimasyöpää. Tutkimukseen sisällytettävät näytteet tunnistaa sytologian osastolla työskentelevä vanhempi biolääketieteellinen tutkija (suoran hoitoryhmän jäsen), joka suorittaa tietokoneistetun haun joka viikko ja tunnistaa potilaat, joilla on diagnosoitu keuhkojen ei-pienisolusyöpä ja haimasyöpä. adenokarsinooma. Potilaan alkuperäinen laboratorionumero syötetään suojattuun, salasanalla suojattuun tietokantaan ja potilaalle annetaan sitten uusi tutkimusnumero. Tämä tietokanta ja potilastiedot ovat vain vanhemman biolääketieteen tutkijan käytettävissä, ja ne tallennetaan suojattuun tiedostoon tietojen hallintaa ja potilaiden luottamuksellisuutta noudattaen. Potilasnäytteet merkitään tutkimuksen numerolla ja alkuperäisellä laboratorion numerolla ja kaikki potilastiedot peitetään. Tutkijalla ei ole pääsyä potilastietoihin, eikä hän voi tunnistaa potilaita. Näytteet, jotka eivät täytä tutkimuskriteerejä, hylätään laboratoriokäytännön mukaisesti.

Kaikki potilastiedot (mukaan lukien kudosnäytteet ja niihin liittyvät raportit) anonymisoidaan ennen kuin ne luovutetaan ensisijaiselle tutkijalle. Tunnistettavat tiedot on yhdistetty laboratorionumerolla. Nämä tiedot tallennetaan suojattuun tietokantaan, johon pääsee vain hoitotyöryhmän jäsen.

Kaikki tiedot tallennetaan ja varmuuskopioidaan Royal Cornwallin sairaalan suojatuille palvelimille. Kaikki tutkimuksen kannalta merkitykselliset tietokannat suojataan salasanalla ja tätä valvoo RCHT:n IT-osasto. Itse tietokantojen sijainti on vain valtuutettujen käyttäjien käytettävissä.

Tämä tutkimus ei vaadi potilaan lisätoimia.

Jos nestepohjaisten sytologianäytteiden (LBC) todetaan olevan käyttökelpoinen vaihtoehto EGFR-, KRAS- ja BRAF-mutaatiotestaukseen, tämä voi johtaa:

• Nopeampi tulosten läpimenoaika yksiselitteisen adenokarsinooman tapauksissa. Tämä tarjoaisi
• Aikaisempi pääsy hoitoon mahdollistaa optimaalisen potilaan hallinnan.
• Laajentaa talossa tarjottavien molekyylitestien valikoimaa NHS-testikirjaston suosittelemalla tavalla.
• Helpompi näytteen valmistelu laboratoriossa
• Materiaalin tehokkaan käytön lisääminen voisi myös estää potilaiden toistuvan näytteenoton.
• LBC-näytteiden käyttö voi mahdollistaa parempien tulosten molekyylitestauksen (metanolin ylivoimainen kiinnitysaine formaliiniin).
• Tukee verinäytteen testauksen käyttöä kiertävien kasvainsolujen osalta (vähemmän invasiivinen näytteenotto). Tämä voi määrittää, missä taudin vaiheissa kiertävät kasvainsolut voidaan havaita veriplasmassa, mikä tekisi siitä mahdollisen tulevan diagnostisen tutkimisen ja seurantatyökalun.
• Tukee KRAS-mutaatiotestausta haiman adenokarsinooman varalta ja kodoni 12 -mutaatiolle spesifisten kohdehoitojen tulevaa kehittämistä