Estudio KEBI-Cyto - Uso de Biocartis Idylla

Los avances en medicina han resultado en el desarrollo de medicamentos específicos para tratar cánceres que expresan ciertas mutaciones. La detección de mutaciones del receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR), BRAF y KRAS (10-30%, 1-2%, 25% respectivamente) en cánceres de pulmón y mutaciones de KRAS en el 94% de los cánceres de páncreas permite tratar a estos pacientes con una cohorte más amplia de fármacos, lo que podría dar lugar a una supervivencia prolongada y libre de progresión, con una tolerabilidad más favorable y menos efectos adversos en comparación con la quimioterapia.

NHS England tiene un directorio de pruebas que enumera las pruebas moleculares que los fideicomisos deben proporcionar a los pacientes con cáncer. EGRF, KRAS y BRAF se enumeran en este directorio. La verificación del uso de Idylla permitiría que este fideicomiso proporcione todas estas pruebas moleculares de manera efectiva. Tanto el cáncer de pulmón como el de páncreas se presentan en estados de enfermedad avanzados y, por lo tanto, es vital obtener resultados rápidos de las pruebas. Actualmente, los laboratorios confían en el uso de muestras embebidas en parafina y fijadas con formalina (FFPE) para las pruebas de EGFR.

Los coágulos se producen en el laboratorio para congelar todos los fragmentos de tejido y células en una masa sólida. A continuación, la muestra coagulada se fija en formalina y se procesa. El tiempo actual de procesamiento y presentación de informes es de 5 días. Las muestras de citología en base líquida (LBC) obtenidas a través de los mismos procedimientos de muestreo también se preparan en el laboratorio y se fijan con un fijador a base de metanol llamado Preservcyt. Se han realizado investigaciones anteriores para determinar si las muestras LBC se pueden usar en lugar de las muestras FFPE para la detección de mutaciones con resultados favorables. Un cambio al uso de muestras LBC para el análisis de mutaciones en el Idylla eliminaría múltiples pasos de procesamiento y haría uso de muestras residuales que actualmente se descartan, lo que optimiza la cantidad de pruebas que podemos realizar en muestras de citología pequeñas, lo que reduce la probabilidad de repetición. procedimientos para pacientes. La fijación con alcohol se considera un método superior de conservación de ADN y ARN, por lo que se observarán mejores resultados moleculares.

En el futuro, la detección de mutaciones de células tumorales circulantes podría anular la necesidad de procedimientos invasivos, y los pacientes necesitarían un simple análisis de sangre para el diagnóstico.

El objetivo del estudio es determinar si las muestras LBC son una alternativa factible y fiable a las muestras FFPE para detectar mutaciones en muestras LBC y sangre utilizando la plataforma Idylla.

Hipótesis: Las mutaciones de EFGR, KRAS y BRAF identificadas mediante muestras FFPE se detectarán en LBC y muestras de plasma sanguíneo utilizando la plataforma Biocartis Idylla ™.

Parte 1 del estudio: (extensión del proyecto de investigación anterior - Número IRAS: 261622) Utilizará material residual de muestras de citología LBC existentes enviadas al laboratorio. Las pruebas de rutina tendrán prioridad. En los casos identificados como carcinoma de pulmón de células no pequeñas, la muestra de LBC residual se analizará en la plataforma Idylla para EGFR, KRAS y BRAF. Los resultados de mutación de EGFR, KRAS y BRAF obtenidos con el procedimiento de diagnóstico de rutina (muestras FFPE) se compararán con los producidos con las muestras de LBC.

Parte 2 de este estudio:

Implicará analizar muestras de coágulos FFPE archivadas de pacientes con adenocarcinoma pancreático confirmado desde 2014 (aproximadamente 20 casos por año). Las pruebas de KRAS se realizarán utilizando la plataforma Idylla para establecer si hay una mutación del codón 12 de KRAS presente en el 94 % de los casos informados en el RCHT. Los pacientes habrán dado su consentimiento para el uso de su tejido en el momento del procedimiento. A los nuevos pacientes prospectivos diagnosticados con adenocarcinoma de páncreas se les realizarán pruebas de KRAS en el coágulo FFPE como parte del trabajo de diagnóstico de rutina y pruebas de KRAS en la muestra de LBC.

Parte 3 de este estudio:

Implicará la toma de muestra de sangre en el momento del procedimiento a pacientes que tengan sospecha clínica de cáncer de pulmón o de páncreas. La muestra de sangre única se tomará de la cánula insertada para el procedimiento. La muestra de sangre se procesará utilizando los cartuchos de células tumorales circulantes Biocartis Idylla ™ (EFGR, KRAS y BRAF para pulmón y KRAS para páncreas).

Las muestras para su inclusión en el estudio serán identificadas por un (miembro del equipo de atención directa) que trabaja en el departamento de citología, quien realizará una búsqueda computarizada todas las semanas e identificará a los pacientes que hayan sido diagnosticados con carcinoma de pulmón de células no pequeñas o adenocarcinoma pancreático. El número de laboratorio original del paciente se ingresará en una base de datos segura y protegida con contraseña y luego se le asignará al paciente un nuevo número de estudio. Esta base de datos y la información del paciente solo serán accesibles para el científico biomédico senior y se almacenarán en un archivo electrónico seguro de conformidad con el gobierno de la información y la confidencialidad del paciente. Las muestras de pacientes se etiquetarán con el número de estudio y el número de laboratorio original y se cubrirá toda la información del paciente. El investigador no tendrá acceso a ninguna información del paciente y no podrá identificar a ningún paciente. El científico biomédico sénior almacenará los resultados anónimos del estudio en la base de datos. La duración del estudio será de 24 meses. En cuyo tiempo se estima que el siguiente número de pacientes serán evaluados:

100 pacientes de carcinoma de pulmón de células no pequeñas 60 muestras retrospectivas de adenocarcinoma de páncreas 40 pacientes prospectivos de adenocarcinoma de páncreas

Pacientes que acuden para USE (Ultrasonido Endoscópico) o EBUS (Ultrasonido Endobronquial) guiados por aspiración con aguja fina con sospecha clínica de carcinoma de pulmón de células no pequeñas o carcinoma de páncreas por equipo multidisciplinar. Las muestras para su inclusión en el estudio serán identificadas por un científico biomédico sénior (miembro del equipo de atención directa) que trabaja en el departamento de citología, quien realizará una búsqueda computarizada todas las semanas e identificará a los pacientes a los que se les haya diagnosticado carcinoma de células no pequeñas de pulmón y cáncer de páncreas. adenocarcinoma. El número de laboratorio original del paciente se ingresará en una base de datos segura y protegida con contraseña y luego se le asignará al paciente un nuevo número de estudio. Esta base de datos y la información del paciente solo serán accesibles para el científico biomédico sénior y se almacenarán en un archivo seguro de conformidad con el gobierno de la información y la confidencialidad del paciente. Las muestras de pacientes se etiquetarán con el número de estudio y el número de laboratorio original y se cubrirá toda la información del paciente. El investigador no tendrá acceso a ninguna información del paciente y no podrá identificar a ningún paciente. Las muestras que no cumplan con los criterios del estudio se descartarán de acuerdo con el protocolo del laboratorio.

Todos los datos de los pacientes (incluidas las muestras de tejido y los informes asociados) se anonimizarán antes de ser entregados al investigador principal. Los datos identificables están vinculados por un número de laboratorio. Esta información se almacena en una base de datos segura a la que solo puede acceder un miembro del equipo de atención directa.

Toda la información se almacena y respalda en servidores seguros en el Royal Cornwall Hospital. Todas las bases de datos relevantes para la investigación estarán protegidas con contraseña y esto es supervisado por el departamento de TI de RCHT. La ubicación de las propias bases de datos solo será accesible para usuarios autorizados.

No se requiere más intervención del paciente para esta investigación.

Si se determina que las muestras de citología de base líquida (LBC) son una alternativa factible para las pruebas de mutación de EGFR, KRAS y BRAF, esto tiene el potencial de resultar en:

• Tiempo de respuesta más rápido de resultados en casos de adenocarcinoma inequívoco. Esto proporcionaría
• Acceso más temprano al tratamiento que permite un manejo óptimo del paciente.
• Amplía la gama de pruebas moleculares proporcionadas internamente según lo recomendado por la biblioteca de pruebas del NHS.
• Preparación de muestras más sencilla en el laboratorio
• El aumento en el uso eficiente del material también podría evitar repetir los procedimientos de muestreo en los pacientes.
• El uso de muestras de LBC puede permitir obtener mejores resultados de las pruebas moleculares (el metanol es un fijador superior a la formalina).
• Apoya el uso de análisis de muestras de sangre para células tumorales circulantes (muestreo menos invasivo). Esto puede identificar en qué etapa de la enfermedad se pueden detectar células tumorales circulantes en el plasma sanguíneo, lo que lo convertiría en una posible herramienta futura de evaluación y seguimiento de diagnóstico.
• Admite las pruebas de mutación KRAS para el adenocarcinoma pancreático y el desarrollo futuro de terapias diana específicas para la mutación del codón 12