KEBI-Cyto-undersøgelse - Brug af Biocartis Idylla

Fremskridt inden for medicin har resulteret i udviklingen af ​​specifikke lægemidler til behandling af kræftformer, der udtrykker visse mutationer. Påvisningen af ​​epidermal vækstfaktorreceptor (EGFR), BRAF- og KRAS-mutationer (henholdsvis 10-30 %, 1-2 %, 25 %) i lungecancere og KRAS-mutationer i 94 % af bugspytkirtelkræft tillader disse patienter at blive behandlet med en bredere kohorte af lægemidler, hvilket potentielt resulterer i progressionsfri, forlænget overlevelse, med en mere gunstig tolerabilitet og færre bivirkninger sammenlignet med kemoterapi.

NHS England har en testmappe, som viser de molekylære tests, som truster bør levere til kræftpatienter. EGRF, KRAS og BRAF er opført i denne mappe. Verifikation af brugen af ​​Idylla ville gøre det muligt for denne tillid at levere alle disse molekylære tests effektivt. Lunge- og bugspytkirtelkræft forekommer begge ved fremskredne sygdomstilstande, og derfor er en hurtig vending af testresultater afgørende. I øjeblikket er laboratorier afhængige af brugen af ​​formalinfikserede paraffinindlejrede (FFPE) prøver til EGFR-testning.

Blodpropper produceres i laboratoriet for at størkne alle vævsfragmenter og celler til en fast masse. Den koagulerede prøve fikseres derefter i formalin og behandles. Den nuværende behandlings- og indberetningstid er 5 dage. Væskebaserede cytologiprøver (LBC) opnået gennem de samme prøveudtagningsprocedurer fremstilles også i laboratoriet og fikseres ved hjælp af et methanolbaseret fikseringsmiddel kaldet Preservcyt. Tidligere forskning er blevet udført for at bestemme, om LBC-prøver kan bruges i stedet for FFPE-prøver til mutationsdetektion med gunstige resultater. Et skift til brug af LBC-prøver til mutationsanalyse på Idylla ville fjerne flere behandlingstrin og gøre brug af resterende prøver, der i øjeblikket kasseres, hvilket optimerer mængden af ​​test, som vi kan køre på små cytologiprøver, hvilket reducerer sandsynligheden for gentagelse procedurer for patienter. Alkoholfiksering betragtes som en overlegen metode til DNA- og RNA-konservering, og derfor vil der blive set bedre molekylære resultater.

Påvisning af cirkulerende tumorcellemutationer kan i fremtiden ophæve behovet for invasive procedurer, hvor patienter skal have en simpel blodprøve for diagnose.

Formålet med undersøgelsen er at afgøre, om LBC-prøver er et gennemførligt og pålideligt alternativ til FFPE-prøver til påvisning af mutationer i LBC-prøver og blod ved hjælp af Idylla-platformen.

Hypotese: EFGR-, KRAS- og BRAF-mutationer identificeret ved hjælp af FFPE-prøver vil blive påvist i LBC- og blodplasmaprøver ved hjælp af Biocartis Idylla™-platformen.

Del 1 af undersøgelsen: (udvidelse af tidligere forskningsprojekt - IRAS-nummer: 261622) Vil bruge restmateriale fra eksisterende LBC-cytologiprøver sendt til laboratoriet. Rutinetest vil have prioritet. Tilfælde identificeret som ikke-småcellet lungekarcinom vil få den resterende LBC-prøve testet på Idylla-platformen for EGFR, KRAS og BRAF. EGFR-, KRAS- og BRAF-mutationsresultaterne opnået ved hjælp af den rutinemæssige diagnostiske procedure (FFPE-prøver) vil blive sammenlignet med dem, der produceres ved hjælp af LBC-prøverne.

Del 2 af denne undersøgelse:

Vil indebære testning af arkiverede FFPE-koagelprøver fra bekræftede pancreas-adenokarcinompatienter siden 2014 (ca. 20 tilfælde pr. år). KRAS-testning vil blive udført ved hjælp af Idylla-platformen for at fastslå, om der er en KRAS-kodon 12-mutation til stede i 94 % procent af tilfældene rapporteret på RCHT. Patienterne vil have givet samtykke til brugen af ​​deres væv på tidspunktet for proceduren. Potentielt nye patienter diagnosticeret med bugspytkirteladenokarcinom vil få foretaget KRAS-test på FFPE-proppen som en del af den rutinemæssige diagnostiske oparbejdning og KRAS-testning på LBC-prøven.

Del 3 af denne undersøgelse:

Vil involvere, at der tages en blodprøve på tidspunktet for proceduren fra patienter, der har en klinisk mistanke om at have lunge- eller bugspytkirtelkræft. Den enkelte blodprøve tages fra den kanyle, der er indsat til proceduren. Blodprøven vil blive behandlet ved hjælp af Biocartis Idylla™ cirkulerende tumorcellepatroner (EFGR, KRAS og BRAF for lunge og KRAS for bugspytkirtel).

Prøver til inklusion i undersøgelsen vil blive identificeret af et (medlem af direkte plejeteam), der arbejder i cytologiafdelingen, som vil udføre en computeriseret søgning hver uge og identificere patienter, der er blevet diagnosticeret med ikke-småcellet lungekarcinom eller pancreasadenokarcinom. Patientens originale laboratorienummer vil blive indtastet i en sikker, adgangskodebeskyttet database, og patienten vil derefter blive tildelt et nyt undersøgelsesnummer. Denne database og patientinformation vil kun være tilgængelig for den senior biomedicinske videnskabsmand og vil blive opbevaret i en sikker elektronisk fil i overensstemmelse med informationsstyring og patientfortrolighed. Patientprøver vil blive mærket med undersøgelsesnummeret og det originale laboratorienummer, og alle patientoplysninger vil være dækket. Forskeren vil ikke have adgang til nogen patientinformation og vil ikke være i stand til at identificere nogen patienter. Den senior biomedicinske videnskabsmand vil gemme de anonymiserede resultater af undersøgelsen i databasen. Studiet vil vare 24 måneder. På hvilket tidspunkt det anslås, at følgende antal patienter vil blive testet:

100 patienter for ikke-småcellet lungekarcinom 60 retrospektive pancreas-adenokarcinomprøver 40 potentielle pancreas-adenokarcinompatienter

Patienter, der deltager i EUS (Endoskopisk ultralyd) eller EBUS (Endobronchial ultralyd) vejledte fine nåleaspirationer med en klinisk mistanke om ikke-småcellet lungekarcinom eller pancreascarcinom af multidisciplinært team. Prøver til inklusion i undersøgelsen vil blive identificeret af en senior biomedicinsk forsker (medlem af direkte plejeteam), der arbejder i cytologiafdelingen, som vil udføre en computeriseret søgning hver uge og identificere patienter, der er blevet diagnosticeret med ikke-småcellet lungekarcinom og pancreas. adenocarcinom. Patientens originale laboratorienummer vil blive indtastet i en sikker, adgangskodebeskyttet database, og patienten vil derefter blive tildelt et nyt undersøgelsesnummer. Denne database og patientinformation vil kun være tilgængelig for den senior biomedicinske videnskabsmand og vil blive opbevaret i en sikker fil i overensstemmelse med informationsstyring og patientfortrolighed. Patientprøver vil blive mærket med undersøgelsesnummeret og det originale laboratorienummer, og alle patientoplysninger vil være dækket. Forskeren vil ikke have adgang til nogen patientinformation og vil ikke være i stand til at identificere nogen patienter. Prøver, der ikke opfylder undersøgelseskriterierne, vil blive kasseret i overensstemmelse med laboratorieprotokollen.

Alle patientdata (inklusive vævsprøver og tilhørende rapporter) vil blive anonymiseret, inden de frigives til den primære forsker. De identificerbare data er forbundet med et laboratorienummer. Disse oplysninger lagres i en sikker database, som kun er tilgængelig for et medlem af det direkte plejeteam.

Alle oplysninger gemmes og sikkerhedskopieres på sikre servere på Royal Cornwall Hospital. Alle databaser, der er relevante for forskningen, vil være beskyttet med adgangskode, og dette overvåges af RCHT IT-afdelingen. Placeringen af ​​selve databaserne vil kun være tilgængelig for autoriserede brugere.

Der kræves ingen yderligere patientintervention til denne forskning.

Hvis væskebaserede cytologiprøver (LBC) viser sig at være et muligt alternativ til EGFR-, KRAS- og BRAF-mutationstestning, har dette potentiale til at resultere i:

• Hurtigere behandlingstid for resultater i tilfælde af utvetydigt adenokarcinom. Dette ville give
• Tidligere adgang til behandling giver mulighed for optimal patientbehandling.
• Udvider rækken af ​​molekylære tests, der leveres internt som anbefalet af NHS testbibliotek.
• Nemmere prøveforberedelse i laboratoriet
• Forøgelse af effektiv brug af materiale kan også forhindre gentagelse af prøveudtagningsprocedurer på patienter.
• Brug af LBC-prøver kan muliggøre bedre resultater fra molekylær testning (methanol overlegen fiksativ til formalin).
• Understøtter brugen af ​​blodprøvetestning til cirkulerende tumorceller (mindre invasiv prøvetagning). Dette kan identificere, ved hvilken sygdomsstadium cirkulerende tumorceller kan påvises i blodplasma, hvilket ville gøre det til et potentielt fremtidigt diagnostisk triaging- og opfølgningsværktøj.
• Understøtter KRAS-mutationstestning for bugspytkirtel-adenokarcinom og fremtidig udvikling af målterapier, der er specifikke for codon 12-mutationen