KEBI-Cyto-studie - Bruk av Biocartis Idylla

Fremskritt innen medisin har resultert i utviklingen av spesifikke medisiner for å behandle kreft som uttrykker visse mutasjoner. Påvisningen av epidermal vekstfaktorreseptor (EGFR), BRAF og KRAS-mutasjoner (henholdsvis 10-30 %, 1-2 %, 25 %) i lungekreft og KRAS-mutasjoner i 94 % av kreft i bukspyttkjertelen gjør at disse pasientene kan behandles med en bredere kohort av legemidler, som potensielt kan resultere i progresjonsfri, forlenget overlevelse, med en mer gunstig toleranse og mindre bivirkninger sammenlignet med kjemoterapi.

NHS England har en testkatalog som viser de molekylære testene som truster bør tilby for kreftpasienter. EGRF, KRAS og BRAF er oppført i denne katalogen. Verifisering av bruken av Idylla vil gjøre det mulig for denne tilliten å gi alle disse molekylære testene effektivt. Lunge- og bukspyttkjertelkreft forekommer begge ved avanserte sykdomstilstander, og derfor er en rask behandling av testresultatene avgjørende. For tiden er laboratorier avhengige av bruk av formalinfikserte parafininnstøpte (FFPE) prøver for EGFR-testing.

Blodpropper produseres i laboratoriet for å stivne alle vevsfragmentene og cellene til en fast masse. Den koagulerte prøven fikseres deretter i formalin og behandles. Gjeldende behandlings- og rapporteringstid er 5 dager. Væskebaserte cytologiprøver (LBC) oppnådd gjennom de samme prøvetakingsprosedyrene blir også preparert i laboratoriet og fiksert med et metanolbasert fiksativ kalt Preservcyt. Tidligere forskning har blitt utført for å avgjøre om LBC-prøver kan brukes i stedet for FFPE-prøver for mutasjonsdeteksjon med gunstige resultater. En overgang til bruk av LBC-prøver for mutasjonsanalyse på Idylla vil fjerne flere behandlingstrinn og gjøre bruk av gjenværende prøver som for øyeblikket er forkastet, noe som optimerer mengden testing som vi kan kjøre på små cytologiprøver, og reduserer sannsynligheten for gjentakelse prosedyrer for pasienter. Alkoholfiksering anses som en overlegen metode for DNA- og RNA-konservering, derfor vil bedre molekylære resultater bli sett.

Påvisning av sirkulerende tumorcellemutasjoner kan i fremtiden eliminere behovet for invasive prosedyrer, med pasienter som trenger en enkel blodprøve for diagnose.

Målet med studien er å finne ut om LBC-prøver er et gjennomførbart og pålitelig alternativ til FFPE-prøver for å påvise mutasjoner i LBC-prøver og blod ved hjelp av Idylla-plattformen.

Hypotese: EFGR-, KRAS- og BRAF-mutasjoner identifisert ved bruk av FFPE-prøver vil bli oppdaget i LBC- og blodplasmaprøver ved bruk av Biocartis Idylla™-plattformen.

Del 1 av studien: (utvidelse av tidligere forskningsprosjekt - IRAS-nummer: 261622) Vil bruke restmateriale fra eksisterende LBC-cytologiprøver sendt til laboratoriet. Rutinemessig testing vil ha prioritet. Tilfeller identifisert som ikke-småcellet lungekarsinom vil få den gjenværende LBC-prøven testet på Idylla-plattformen for EGFR, KRAS og BRAF. EGFR-, KRAS- og BRAF-mutasjonsresultatene oppnådd ved bruk av den rutinemessige diagnostiske prosedyren (FFPE-prøver) vil bli sammenlignet med de som er produsert ved bruk av LBC-prøvene.

Del 2 av denne studien:

Vil innebære testing av arkiverte FFPE-proppprøver fra bekreftede pankreasadenokarsinompasienter siden 2014 (omtrent 20 tilfeller per år). KRAS-testing vil bli utført ved hjelp av Idylla-plattformen for å fastslå om det er en KRAS-kodon 12-mutasjon tilstede i 94 % prosent av tilfellene rapportert ved RCHT. Pasienter vil ha samtykket til bruk av vevet deres på prosedyretidspunktet. Prospektivt nye pasienter diagnostisert med bukspyttkjerteladenokarsinom vil få KRAS-testing på FFPE-proppen utført som en del av den rutinemessige diagnostiske opparbeidingen og KRAS-testing på LBC-prøven.

Del 3 av denne studien:

Vil innebære at det tas en blodprøve ved inngrepet fra pasienter som har en klinisk mistanke om å ha lunge- eller bukspyttkjertelkreft. Enkeltblodprøven vil bli tatt fra kanylen som er satt inn for prosedyren. Blodprøven vil bli behandlet med Biocartis Idylla ™ sirkulerende tumorcellekassetter (EFGR, KRAS og BRAF for lunge og KRAS for bukspyttkjertel).

Prøver for inkludering i studien vil bli identifisert av et (medlem av direkte omsorgsteam) som arbeider i cytologiavdelingen som vil utføre et datastyrt søk hver uke og identifisere pasienter som har blitt diagnostisert med ikke-småcellet lungekarsinom eller pankreasadenokarsinom. Pasientens originale laboratorienummer vil bli lagt inn i en sikker, passordbeskyttet database og pasienten vil deretter bli tildelt et nytt studienummer. Denne databasen, og pasientinformasjon, vil kun være tilgjengelig for senior biomedisinsk vitenskapsmann og vil bli lagret i en sikker elektronisk fil i samsvar med informasjonsstyring og pasientkonfidensialitet. Pasientprøver vil bli merket med studienummeret og det originale laboratorienummeret, og all pasientinformasjon vil bli dekket. Forskeren vil ikke ha tilgang til noen pasientinformasjon og vil ikke kunne identifisere noen pasienter. Den senior biomedisinske forskeren vil lagre de anonymiserte resultatene av studien i databasen. Studietiden vil være 24 måneder. I løpet av denne tiden er det anslått at følgende antall pasienter vil bli testet:

100 pasienter for ikke-småcellet lungekarsinom 60 retrospektive pankreasadenokarsinomprøver 40 potensielle pankreasadenokarsinompasienter

Pasienter som deltar på EUS (endoskopisk ultralyd) eller EBUS (endobronkial ultralyd) veiledet finnålsaspirasjoner med en klinisk mistanke om ikke-småcellet lungekarsinom eller bukspyttkjertelkarsinom av multidisiplinært team. Prøver for inkludering i studien vil bli identifisert av en senior biomedisinsk forsker (medlem av direkte omsorgsteam) som jobber i cytologiavdelingen som vil utføre et datastyrt søk hver uke og identifisere pasienter som har blitt diagnostisert med ikke-småcellet lungekarsinom og bukspyttkjertel. adenokarsinom. Pasientens originale laboratorienummer vil bli lagt inn i en sikker, passordbeskyttet database og pasienten vil deretter bli tildelt et nytt studienummer. Denne databasen, og pasientinformasjon, vil kun være tilgjengelig for senior biomedisinsk forsker og vil bli lagret i en sikker fil i samsvar med informasjonsstyring og pasientkonfidensialitet. Pasientprøver vil bli merket med studienummeret og det originale laboratorienummeret, og all pasientinformasjon vil bli dekket. Forskeren vil ikke ha tilgang til noen pasientinformasjon og vil ikke kunne identifisere noen pasienter. Prøver som ikke oppfyller studiekriteriene vil bli kastet i henhold til laboratorieprotokollen.

Alle pasientdata (inkludert vevsprøver og tilhørende rapporter) vil anonymiseres før de frigis til primærforskeren. De identifiserbare dataene er knyttet til et laboratorienummer. Denne informasjonen lagres i en sikker database som kun er tilgjengelig for et medlem av det direkte omsorgsteamet.

All informasjon lagres og sikkerhetskopieres på sikre servere ved Royal Cornwall Hospital. Alle databaser som er relevante for forskningen vil være passordbeskyttet og dette overvåkes av RCHT IT-avdeling. Plasseringen av selve databasene vil kun være tilgjengelig for autoriserte brukere.

Ingen ytterligere pasientintervensjon er nødvendig for denne forskningen.

Hvis væskebaserte cytologiprøver (LBC) viser seg å være et mulig alternativ for EGFR-, KRAS- og BRAF-mutasjonstesting, har dette potensialet til å resultere i:

• Raskere behandlingstid for resultater i tilfeller av utvetydig adenokarsinom. Dette ville gi
• Tidligere tilgang til behandling gir optimal pasientbehandling.
• Utvider rekkevidden av molekylær testing som tilbys i huset som anbefalt av NHS testbibliotek.
• Enklere prøveforberedelse i laboratoriet
• Økning i effektiv bruk av materiale kan også forhindre gjentatte prøvetakingsprosedyrer på pasienter.
• Bruk av LBC-prøver kan gi bedre resultater fra molekylær testing (metanol overlegen fiksativ til formalin).
• Støtter bruk av blodprøvetesting for sirkulerende tumorceller (mindre invasiv prøvetaking). Dette kan identifisere ved hvilken sykdomsstadium sirkulerende tumorceller kan påvises i blodplasma, noe som vil gjøre det til et potensielt fremtidig diagnostisk triaging- og oppfølgingsverktøy.
• Støtter KRAS-mutasjonstesting for adenokarsinom i bukspyttkjertelen og fremtidig utvikling av målterapier spesifikke for kodon 12-mutasjonen