Estudo KEBI-Cyto - Uso do Biocartis Idylla

Os avanços na medicina resultaram no desenvolvimento de medicamentos específicos para tratar cânceres que expressam certas mutações. A detecção do receptor do fator de crescimento epidérmico (EGFR), mutações BRAF e KRAS (10-30%, 1-2%, 25% respectivamente) em cânceres de pulmão e mutações KRAS em 94% dos cânceres pancreáticos permite que esses pacientes sejam tratados com um coorte mais ampla de drogas, potencialmente resultando em sobrevida prolongada livre de progressão, com uma tolerabilidade mais favorável e menos efeitos adversos em comparação com a quimioterapia.

O NHS England tem um diretório de testes que lista os testes moleculares que as instituições de saúde devem fornecer para pacientes com câncer. EGRF, KRAS e BRAF estão listados neste diretório. A verificação do uso do Idylla permitiria que esta confiança fornecesse todos esses testes moleculares de forma eficaz. Os cânceres de pulmão e pâncreas estão presentes em estados avançados da doença e, portanto, uma rápida recuperação dos resultados dos testes é vital. Atualmente, os laboratórios contam com o uso de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFPE) para testes de EGFR.

Os coágulos são produzidos em laboratório para congelar todos os fragmentos de tecido e células em uma massa sólida. A amostra coagulada é então fixada em formalina e processada. O tempo atual de processamento e relatório é de 5 dias. As amostras de citologia líquida (LBC) obtidas através dos mesmos procedimentos de amostragem também são preparadas no laboratório e fixadas usando um fixador à base de metanol chamado Preservcyt. Pesquisas anteriores foram realizadas para determinar se amostras LBC podem ser usadas em vez de amostras FFPE para detecção de mutação com resultados favoráveis. Uma mudança para o uso de amostras LBC para análise de mutação no Idylla removeria várias etapas de processamento e usaria amostras residuais que são atualmente descartadas, o que otimiza a quantidade de testes que podemos executar em pequenas amostras de citologia, reduzindo a probabilidade de repetição procedimentos para pacientes. A fixação com álcool é considerada um método superior de preservação de DNA e RNA, portanto, melhores resultados moleculares serão observados.

A detecção de mutações de células tumorais circulantes pode, no futuro, negar a necessidade de procedimentos invasivos, com pacientes exigindo um simples exame de sangue para o diagnóstico.

O objetivo do estudo é determinar se as amostras de LBC são uma alternativa viável e confiável às amostras de FFPE para detectar mutações em amostras de LBC e sangue usando a plataforma Idylla.

Hipótese: As mutações EFGR, KRAS e BRAF identificadas usando amostras FFPE serão detectadas em amostras de LBC e plasma sanguíneo usando a plataforma Biocartis Idylla ™.

Parte 1 do estudo: (extensão do projeto de pesquisa anterior - Número IRAS: 261622) Usará material residual de amostras de citologia de LBC existentes enviadas ao laboratório. Os testes de rotina terão prioridade. Os casos identificados como carcinoma pulmonar de células não pequenas terão a amostra residual de LBC testada na plataforma Idylla para EGFR, KRAS e BRAF. Os resultados das mutações EGFR, KRAS e BRAF obtidos com o procedimento de diagnóstico de rotina (amostras FFPE) serão comparados com aqueles produzidos com as amostras LBC.

Parte 2 deste estudo:

Envolverá o teste de amostras de coágulos FFPE arquivadas de pacientes com adenocarcinoma pancreático confirmado desde 2014 (aproximadamente 20 casos por ano). O teste de KRAS será realizado usando a plataforma Idylla para estabelecer se há uma mutação do códon 12 do KRAS presente em 94% dos casos relatados no RCHT. Os pacientes terão consentido com o uso de seus tecidos no momento do procedimento. Novos pacientes prospectivamente diagnosticados com adenocarcinoma pancreático terão teste de KRAS no coágulo FFPE feito como parte do diagnóstico de rotina e teste de KRAS na amostra de LBC.

Parte 3 deste estudo:

Envolverá uma amostra de sangue sendo coletada no momento do procedimento de pacientes com suspeita clínica de câncer de pulmão ou pâncreas. A única amostra de sangue será retirada da cânula inserida para o procedimento. A amostra de sangue será processada usando os cartuchos de células tumorais circulantes Biocartis Idylla ™ (EFGR, KRAS e BRAF para pulmão e KRAS para pâncreas).

As amostras para inclusão no estudo serão identificadas por um (membro da equipe de atendimento direto) que trabalha no departamento de citologia, que realizará uma pesquisa computadorizada todas as semanas e identificará os pacientes diagnosticados com carcinoma pulmonar de células não pequenas ou adenocarcinoma pancreático. O número original do laboratório do paciente será inserido em um banco de dados seguro e protegido por senha e o paciente receberá um novo número de estudo. Este banco de dados e as informações do paciente serão acessíveis apenas pelo cientista biomédico sênior e serão armazenados em um arquivo eletrônico seguro em conformidade com a governança de informações e a confidencialidade do paciente. As amostras dos pacientes serão rotuladas com o número do estudo e o número do laboratório original e todas as informações do paciente serão cobertas. O pesquisador não terá acesso a nenhuma informação do paciente e não poderá identificar nenhum paciente. O cientista biomédico sênior armazenará os resultados anônimos do estudo no banco de dados. A duração do estudo será de 24 meses. Nesse tempo, estima-se que o seguinte número de pacientes será testado:

100 pacientes para carcinoma pulmonar de células não pequenas 60 amostras retrospectivas de adenocarcinoma pancreático 40 pacientes prospectivos de adenocarcinoma pancreático

Pacientes atendidos por EUS (ultrassom endoscópico) ou EBUS (ultrassonografia endobrônquica) guiados por aspirações com agulha fina com suspeita clínica de carcinoma pulmonar de células não pequenas ou carcinoma pancreático por equipe multidisciplinar. As amostras para inclusão no estudo serão identificadas por um cientista biomédico sênior (membro da equipe de atendimento direto) trabalhando no departamento de citologia, que realizará uma pesquisa computadorizada todas as semanas e identificará os pacientes que foram diagnosticados com carcinoma de células não pequenas do pulmão e pâncreas adenocarcinoma. O número original do laboratório do paciente será inserido em um banco de dados seguro e protegido por senha e o paciente receberá um novo número de estudo. Este banco de dados e as informações do paciente serão acessíveis apenas pelo cientista biomédico sênior e serão armazenados em um arquivo seguro em conformidade com a governança de informações e a confidencialidade do paciente. As amostras dos pacientes serão rotuladas com o número do estudo e o número do laboratório original e todas as informações do paciente serão cobertas. O pesquisador não terá acesso a nenhuma informação do paciente e não poderá identificar nenhum paciente. As amostras que não atenderem aos critérios do estudo serão descartadas de acordo com o protocolo do laboratório.

Todos os dados do paciente (incluindo amostras de tecido e relatórios associados) serão anonimizados antes de serem liberados para o pesquisador principal. Os dados identificáveis ​​são vinculados por um número de laboratório. Essas informações são armazenadas em um banco de dados seguro, acessível apenas por um membro da equipe de atendimento direto.

Todas as informações são armazenadas e copiadas em servidores seguros no Royal Cornwall Hospital. Todas as bases de dados relevantes para a pesquisa serão protegidas por senha e isso é monitorado pelo departamento de TI da RCHT. A localização dos próprios bancos de dados só será acessível a usuários autorizados.

Nenhuma outra intervenção do paciente é necessária para esta pesquisa.

Se amostras de citologia líquida (LBC) forem consideradas uma alternativa viável para testes de mutação EGFR, KRAS e BRAF, isso pode resultar em:

• Tempo de resposta mais rápido de resultados em casos de adenocarcinoma inequívoco. Isso forneceria
• Acesso antecipado ao tratamento, permitindo o gerenciamento ideal do paciente.
• Expande a gama de testes moleculares fornecidos internamente, conforme recomendado pela biblioteca de testes do NHS.
• Preparação de amostras mais fácil dentro do laboratório
• O aumento no uso eficiente de material também pode evitar a repetição de procedimentos de amostragem em pacientes.
• O uso de amostras de LBC pode permitir melhores resultados de testes moleculares (fixador de metanol superior à formalina).
• Suportes do uso de teste de amostra de sangue para células tumorais circulantes (amostragem menos invasiva). Isso pode identificar em qual estágio da doença as células tumorais circulantes podem ser detectadas no plasma sanguíneo, o que o tornaria uma potencial ferramenta futura de triagem e acompanhamento de diagnóstico.
• Suporta teste de mutação KRAS para adenocarcinoma pancreático e desenvolvimento futuro de terapias-alvo específicas para a mutação do códon 12