Studie KEBI-Cyto - Použití Biocartis Idylla

Pokroky v medicíně vedly k vývoji specifických léků k léčbě rakoviny, které exprimují určité mutace. Detekce mutací receptoru epidermálního růstového faktoru (EGFR), BRAF a KRAS (10-30 %, 1-2 %, 25 %) u karcinomů plic a mutací KRAS u 94 % karcinomů pankreatu umožňuje těmto pacientům být léčen širší kohorta léků, což může vést k prodloužení doby přežití bez progrese, s příznivější snášenlivostí a menšími nežádoucími účinky ve srovnání s chemoterapií.

NHS England má adresář testů, který uvádí molekulární testy, které by trusty měly poskytovat pacientům s rakovinou. EGRF, KRAS a BRAF jsou uvedeny v tomto adresáři. Ověření použití Idyly by této důvěře umožnilo efektivně poskytovat všechny tyto molekulární testy. Rakovina plic a slinivky břišní se vyskytuje v pokročilých chorobných stavech, a proto je rychlý obrat výsledků testů životně důležitý. V současné době se laboratoře spoléhají na použití vzorků zalitých ve formalínu fixovaných v parafínu (FFPE) pro testování EGFR.

Sraženiny jsou produkovány v laboratoři, aby ztuhly všechny tkáňové fragmenty a buňky do jedné pevné hmoty. Sražený vzorek je poté fixován ve formalínu a zpracován. Aktuální doba zpracování a hlášení je 5 dní. Tekuté cytologické vzorky (LBC) získané stejnými odběrovými postupy jsou také připraveny v laboratoři a fixovány pomocí fixačního prostředku na bázi metanolu zvaného Preservcyt. Předchozí výzkum byl proveden s cílem zjistit, zda lze vzorky LBC použít místo vzorků FFPE pro detekci mutací s příznivými výsledky. Přechod na použití vzorků LBC pro analýzu mutací na Idylla by odstranil více kroků zpracování a využil zbytkové vzorky, které jsou v současné době vyřazeny, což optimalizuje množství testů, které můžeme provádět na malých cytologických vzorcích, čímž se snižuje pravděpodobnost opakování. procedury pro pacienty. Fixace alkoholu je považována za nejlepší způsob uchování DNA a RNA, a proto budou vidět lepší molekulární výsledky.

Detekce cirkulujících mutací nádorových buněk by v budoucnu mohla negovat potřebu invazivních postupů, kdy by pacienti potřebovali k diagnóze jednoduchý krevní test.

Cílem studie je zjistit, zda vzorky LBC jsou proveditelnou a spolehlivou alternativou vzorků FFPE pro detekci mutací ve vzorcích LBC a krvi pomocí platformy Idylla.

Hypotéza: Mutace EFGR, KRAS a BRAF identifikované pomocí vzorků FFPE budou detekovány ve vzorcích LBC a krevní plazmy pomocí platformy Biocartis Idylla™.

Část 1 studie: (rozšíření předchozího výzkumného projektu - číslo IRAS: 261622) Využije zbytkový materiál ze stávajících cytologických vzorků LBC odeslaných do laboratoře. Přednost bude mít rutinní testování. Případy identifikované jako nemalobuněčný karcinom plic budou mít reziduální vzorek LBC testován na platformě Idylla na EGFR, KRAS a BRAF. Výsledky mutací EGFR, KRAS a BRAF získané pomocí rutinního diagnostického postupu (vzorky FFPE) budou porovnány s výsledky získanými pomocí vzorků LBC.

Část 2 této studie:

Bude zahrnovat testování archivovaných vzorků sraženiny FFPE od pacientů s potvrzeným adenokarcinomem pankreatu od roku 2014 (přibližně 20 případů ročně). Testování KRAS bude provedeno pomocí platformy Idylla, aby se zjistilo, zda je v 94 % procent případů hlášených na RCHT přítomna mutace kodonu 12 KRAS. Pacienti budou souhlasit s použitím jejich tkáně v době zákroku. Prospektivně novým pacientům s diagnózou adenokarcinomu pankreatu bude provedeno vyšetření KRAS na sraženině FFPE v rámci rutinní diagnostické práce a vyšetření KRAS na vzorku LBC.

Část 3 této studie:

Bude zahrnovat vzorek krve odebraný v době výkonu od pacientů, kteří mají klinické podezření na rakovinu plic nebo slinivky břišní. Jediný vzorek krve bude odebrán z kanyly zavedené pro výkon. Vzorek krve bude zpracován pomocí Biocartis Idylla™ kazet s cirkulujícími nádorovými buňkami (EFGR, KRAS a BRAF pro plíce a KRAS pro slinivku).

Vzorky pro zařazení do studie budou identifikovány (členem týmu přímé péče) pracujícím na cytologickém oddělení, který bude každý týden provádět počítačové vyhledávání a identifikuje pacienty, u kterých byl diagnostikován nemalobuněčný karcinom plic nebo adenokarcinom slinivky břišní. Původní laboratorní číslo pacienta bude zadáno do zabezpečené databáze chráněné heslem a pacientovi bude poté přiděleno nové číslo studie. Tato databáze a informace o pacientech budou přístupné pouze vedoucímu biomedicínskému vědci a budou uloženy v zabezpečeném elektronickém souboru v souladu se správou informací a důvěrností pacienta. Vzorky pacientů budou označeny číslem studie a původním číslem laboratoře a budou pokryty všechny informace o pacientovi. Výzkumník nebude mít přístup k žádným informacím o pacientech a nebude schopen identifikovat žádné pacienty. Vedoucí biomedicínský vědec uloží anonymizované výsledky studie do databáze. Délka studia bude 24 měsíců. Během této doby se odhaduje, že bude testován následující počet pacientů:

100 pacientů pro nemalobuněčný karcinom plic 60 retrospektivních vzorků adenokarcinomu pankreatu 40 potenciálních pacientů s adenokarcinomem pankreatu

Pacienti docházející na EUS (Endoskopický ultrazvuk) nebo EBUS (Endobronchiální ultrazvuk) řídili aspirace tenkou jehlou s klinickým podezřením na nemalobuněčný karcinom plic nebo karcinom pankreatu multidisciplinárním týmem. Vzorky pro zařazení do studie určí vedoucí biomedicínský vědec (člen týmu přímé péče) pracující na cytologickém oddělení, který každý týden provede počítačové vyhledávání a identifikuje pacienty, u kterých byl diagnostikován nemalobuněčný karcinom plic a slinivky břišní. adenokarcinom. Původní laboratorní číslo pacienta bude zadáno do zabezpečené databáze chráněné heslem a pacientovi bude poté přiděleno nové číslo studie. Tato databáze a informace o pacientech budou přístupné pouze vedoucímu biomedicínskému vědci a budou uloženy v zabezpečeném souboru v souladu se správou informací a důvěrností pacienta. Vzorky pacientů budou označeny číslem studie a původním číslem laboratoře a budou pokryty všechny informace o pacientovi. Výzkumník nebude mít přístup k žádným informacím o pacientech a nebude schopen identifikovat žádné pacienty. Vzorky, které nesplňují kritéria studie, budou zlikvidovány v souladu s laboratorním protokolem.

Všechna data pacientů (včetně vzorků tkání a souvisejících zpráv) budou před zveřejněním primárnímu výzkumníkovi anonymizována. Identifikovatelné údaje jsou spojeny laboratorním číslem. Tyto informace jsou uloženy v zabezpečené databázi, ke které má přístup pouze člen týmu přímé péče.

Všechny informace jsou uloženy a zálohovány na zabezpečených serverech v Royal Cornwall Hospital. Všechny databáze relevantní pro výzkum budou chráněny heslem a toto je monitorováno IT oddělením RCHT. Umístění samotných databází bude přístupné pouze oprávněným uživatelům.

Tento výzkum nevyžaduje žádný další zásah pacienta.

Pokud se zjistí, že vzorky tekuté cytologie (LBC) jsou vhodnou alternativou pro testování mutací EGFR, KRAS a BRAF, může to vést k:

• Rychlejší doba obratu výsledků v případech jednoznačného adenokarcinomu. To by zajistilo
• Včasný přístup k léčbě umožňuje optimální management pacienta.
• Rozšiřuje rozsah molekulárních testů poskytovaných ve firmě podle doporučení testovací knihovny NHS.
• Jednodušší příprava vzorků v laboratoři
• Zvýšení efektivního využití materiálu by také mohlo zabránit opakovaným odběrům vzorků u pacientů.
• Použití vzorků LBC může umožnit lepší výsledky z molekulárního testování (methanol lepší fixativ než formalín).
• Podpora využití testování krevních vzorků pro cirkulující nádorové buňky (méně invazivní odběry). To může určit, při jakém stádiu onemocnění lze cirkulující nádorové buňky detekovat v krevní plazmě, což by z něj učinilo potenciální budoucí diagnostický nástroj pro třídění a sledování.
• Podporuje testování mutace KRAS na adenokarcinom pankreatu a budoucí vývoj cílových terapií specifických pro mutaci kodonu 12