Исследование KEBI-Cyto — использование Biocartis Idylla

Достижения в области медицины привели к разработке специальных препаратов для лечения рака, вызывающего определенные мутации. Выявление мутаций рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), BRAF и KRAS (10-30%, 1-2%, 25% соответственно) при раке легкого и мутаций KRAS при 94% рака поджелудочной железы позволяет лечить этих пациентов с помощью более широкая когорта препаратов, потенциально приводящая к длительной выживаемости без прогрессирования, с более благоприятной переносимостью и меньшим количеством побочных эффектов по сравнению с химиотерапией.

У NHS England есть каталог тестов, в котором перечислены молекулярные тесты, которые фонды должны проводить для больных раком. В этом справочнике перечислены ЕГРФ, КРАС и БРАФ. Проверка использования Idylla позволит этому тресту эффективно проводить все эти молекулярные тесты. Рак легкого и рак поджелудочной железы проявляются на поздних стадиях заболевания, поэтому жизненно важно быстрое получение результатов анализов. В настоящее время лаборатории полагаются на использование образцов, залитых парафином, фиксированных формалином (FFPE), для тестирования EGFR.

Сгустки производятся в лаборатории, чтобы застыть все фрагменты ткани и клетки в одну твердую массу. Свернувшийся образец затем фиксируют в формалине и обрабатывают. Текущее время обработки и отчетности составляет 5 дней. Образцы жидкостной цитологии (LBC), полученные с помощью тех же процедур отбора проб, также готовятся в лаборатории и фиксируются с помощью фиксатора на основе метанола под названием Preservcyt. Предыдущее исследование было проведено, чтобы определить, можно ли использовать образцы LBC вместо образцов FFPE для обнаружения мутаций с благоприятными результатами. Переход на использование образцов LBC для анализа мутаций на Idylla устранит несколько этапов обработки и будет использовать остаточные образцы, которые в настоящее время выбрасываются, что оптимизирует количество тестов, которые мы можем проводить на небольших цитологических образцах, уменьшая вероятность повторения. процедуры для пациентов. Фиксация спиртом считается лучшим методом сохранения ДНК и РНК, поэтому будут видны лучшие молекулярные результаты.

Обнаружение мутаций циркулирующих опухолевых клеток может в будущем свести на нет потребность в инвазивных процедурах, поскольку для постановки диагноза пациентам потребуется простой анализ крови.

Цель исследования — определить, являются ли образцы LBC реальной и надежной альтернативой образцам FFPE для обнаружения мутаций в образцах LBC и крови с использованием платформы Idylla.

Гипотеза: мутации EFGR, KRAS и BRAF, выявленные с помощью образцов FFPE, будут обнаружены в образцах LBC и плазмы крови с использованием платформы Biocartis Idylla™.

Часть 1 исследования: (расширение предыдущего исследовательского проекта - номер IRAS: 261622) Будет использоваться остаточный материал из существующих цитологических образцов LBC, отправленных в лабораторию. Рутинное тестирование будет иметь приоритет. В случаях, идентифицированных как немелкоклеточная карцинома легкого, остаточный образец LBC будет протестирован на платформе Idylla на EGFR, KRAS и BRAF. Результаты мутаций EGFR, KRAS и BRAF, полученные с использованием стандартной диагностической процедуры (образцы FFPE), будут сравниваться с результатами, полученными с использованием образцов LBC.

Часть 2 этого исследования:

Будет включать тестирование архивных образцов сгустков FFPE от пациентов с подтвержденной аденокарциномой поджелудочной железы с 2014 года (примерно 20 случаев в год). Тестирование KRAS будет проводиться с использованием платформы Idylla, чтобы установить, присутствует ли мутация кодона 12 KRAS в 94% случаев, зарегистрированных в RCHT. Пациенты дадут согласие на использование своих тканей во время процедуры. Потенциально новым пациентам с диагнозом аденокарцинома поджелудочной железы будет проведено тестирование KRAS на сгустке FFPE в рамках рутинной диагностической работы и тестирование KRAS на образце LBC.

Часть 3 этого исследования:

Будет включать забор крови во время процедуры у пациентов, у которых есть клиническое подозрение на рак легких или поджелудочной железы. Один образец крови будет взят из канюли, вставленной для процедуры. Образец крови будет обрабатываться с использованием картриджей с циркулирующими опухолевыми клетками Biocartis Idylla™ (EFGR, KRAS и BRAF для легких и KRAS для поджелудочной железы).

Образцы для включения в исследование будут отобраны (членом бригады непосредственного ухода), работающим в отделении цитологии, который каждую неделю будет проводить компьютеризированный поиск и выявлять пациентов, у которых диагностирована немелкоклеточная карцинома легкого или аденокарцинома поджелудочной железы. Первоначальный лабораторный номер пациента будет введен в безопасную, защищенную паролем базу данных, после чего пациенту будет присвоен новый номер исследования. Доступ к этой базе данных и информации о пациентах будет иметь только старший научный сотрудник-биомедик, и они будут храниться в защищенном электронном файле в соответствии с принципами управления информацией и конфиденциальностью пациента. Образцы пациентов будут помечены номером исследования и исходным номером лаборатории, и вся информация о пациенте будет включена. Исследователь не будет иметь доступа к какой-либо информации о пациентах и ​​не сможет их идентифицировать. Старший научный сотрудник-биомедик сохранит анонимные результаты исследования в базе данных. Продолжительность обучения составит 24 месяца. За какое время предполагается, что будет протестировано следующее количество пациентов:

100 пациентов с немелкоклеточным раком легкого 60 ретроспективных образцов аденокарциномы поджелудочной железы 40 предполагаемых пациентов с аденокарциномой поджелудочной железы

Пациенты, посещающие ЭУЗИ (эндоскопическое ультразвуковое исследование) или ЭУЗИ (эндобронхиальное ультразвуковое исследование), выполняли тонкоигольную аспирацию с клиническим подозрением на немелкоклеточную карциному легкого или карциному поджелудочной железы многопрофильной командой. Образцы для включения в исследование будут определены старшим научным сотрудником-биомедиком (членом бригады непосредственного ухода), работающим в отделении цитологии, который будет еженедельно проводить компьютеризированный поиск и выявлять пациентов, у которых диагностирована немелкоклеточная карцинома легкого и рак поджелудочной железы. аденокарцинома. Первоначальный лабораторный номер пациента будет введен в безопасную, защищенную паролем базу данных, после чего пациенту будет присвоен новый номер исследования. Эта база данных и информация о пациентах будут доступны только старшему научному специалисту в области биомедицины и будут храниться в защищенном файле в соответствии с управлением информацией и конфиденциальностью пациентов. Образцы пациентов будут помечены номером исследования и исходным номером лаборатории, и вся информация о пациенте будет включена. Исследователь не будет иметь доступа к какой-либо информации о пациентах и ​​не сможет их идентифицировать. Образцы, не соответствующие критериям исследования, будут утилизированы в соответствии с лабораторным протоколом.

Все данные пациентов (включая образцы тканей и связанные с ними отчеты) будут анонимизированы до того, как они будут переданы основному исследователю. Идентифицируемые данные связаны номером лаборатории. Эта информация хранится в защищенной базе данных, доступ к которой имеет только член группы непосредственного ухода.

Вся информация хранится и резервируется на защищенных серверах в Королевской больнице Корнуолла. Все базы данных, имеющие отношение к исследованию, будут защищены паролем, и за этим следит ИТ-отдел РХТ. Расположение самих баз данных будет доступно только авторизованным пользователям.

Для этого исследования не требуется дальнейшего вмешательства пациента.

Если окажется, что образцы жидкостной цитологии (LBC) являются приемлемой альтернативой для тестирования на мутации EGFR, KRAS и BRAF, это может привести к:

• Более быстрое получение результатов в случаях однозначной аденокарциномы. Это обеспечит
• Более ранний доступ к лечению, обеспечивающий оптимальное ведение пациентов.
• Расширяет спектр молекулярных тестов, предоставляемых в доме в соответствии с рекомендациями библиотеки тестов NHS.
• Упрощение пробоподготовки в лаборатории
• Повышение эффективности использования материала может также предотвратить повторные процедуры отбора проб у пациентов.
• Использование образцов LBC может позволить получить лучшие результаты молекулярного тестирования (метанол лучше фиксатора, чем формалин).
• Поддерживает использование анализа образцов крови на наличие циркулирующих опухолевых клеток (менее инвазивный отбор). Это может определить, на какой стадии заболевания циркулирующие опухолевые клетки могут быть обнаружены в плазме крови, что может сделать его потенциальным будущим инструментом диагностической сортировки и последующего наблюдения.
• Поддерживает тестирование мутации KRAS для аденокарциномы поджелудочной железы и будущую разработку целевых методов лечения, специфичных для мутации кодона 12.