Etude KEBI-Cyto - Utilisation du Biocartis Idylla

Les progrès de la médecine ont abouti au développement de médicaments spécifiques pour traiter les cancers qui expriment certaines mutations. La détection des mutations du récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR), BRAF et KRAS (10-30%, 1-2%, 25% respectivement) dans les cancers du poumon et des mutations KRAS dans 94% des cancers du pancréas permet de traiter ces patients avec un cohorte plus large de médicaments, entraînant potentiellement une survie sans progression et prolongée, avec une tolérance plus favorable et moins d'effets indésirables par rapport à la chimiothérapie.

Le NHS England a un répertoire de tests qui répertorie les tests moléculaires que les fiducies devraient fournir aux patients atteints de cancer. EGRF, KRAS et BRAF sont répertoriés dans ce répertoire. La vérification de l'utilisation de l'Idylla permettrait à cette fiducie de fournir efficacement tous ces tests moléculaires. Les cancers du poumon et du pancréas sont tous deux présents à des stades avancés de la maladie et, par conséquent, un retour rapide des résultats des tests est vital. Actuellement, les laboratoires s'appuient sur l'utilisation d'échantillons inclus dans la paraffine fixée au formol (FFPE) pour les tests EGFR.

Des caillots sont produits en laboratoire pour congeler tous les fragments de tissu et les cellules en une seule masse solide. L'échantillon coagulé est ensuite fixé dans du formol et traité. Le délai actuel de traitement et de déclaration est de 5 jours. Les échantillons de cytologie en milieu liquide (LBC) obtenus par les mêmes procédures d'échantillonnage sont également préparés en laboratoire et fixés à l'aide d'un fixateur à base de méthanol appelé Preservcyt. Des recherches antérieures ont été menées pour déterminer si les échantillons LBC peuvent être utilisés à la place des échantillons FFPE pour la détection des mutations avec des résultats favorables. Un passage à l'utilisation d'échantillons LBC pour l'analyse des mutations sur l'Idylla supprimerait plusieurs étapes de traitement et utiliserait des échantillons résiduels qui sont actuellement rejetés, ce qui optimise la quantité de tests que nous pouvons effectuer sur de petits échantillons de cytologie, réduisant ainsi la probabilité de répétition. procédures pour les patients. La fixation de l'alcool est considérée comme une méthode supérieure de conservation de l'ADN et de l'ARN, donc de meilleurs résultats moléculaires seront observés.

La détection des mutations des cellules tumorales circulantes pourrait à l'avenir éliminer le besoin de procédures invasives, les patients nécessitant un simple test sanguin pour le diagnostic.

L'objectif de l'étude est de déterminer si les échantillons LBC sont une alternative faisable et fiable aux échantillons FFPE pour détecter les mutations dans les échantillons LBC et le sang à l'aide de la plateforme Idylla.

Hypothèse : Les mutations EFGR, KRAS et BRAF identifiées à l'aide d'échantillons FFPE seront détectées dans des échantillons de LBC et de plasma sanguin à l'aide de la plateforme Biocartis Idylla™.

Partie 1 de l'étude : (extension du projet de recherche précédent - numéro IRAS : 261622) Utilisera du matériel résiduel d'échantillons de cytologie LBC existants envoyés au laboratoire. Les tests de routine seront prioritaires. Les cas identifiés comme carcinome pulmonaire non à petites cellules verront l'échantillon résiduel de LBC testé sur la plateforme Idylla pour EGFR, KRAS et BRAF. Les résultats de mutation EGFR, KRAS et BRAF obtenus à l'aide de la procédure de diagnostic de routine (échantillons FFPE) seront comparés à ceux produits à l'aide des échantillons LBC.

Partie 2 de cette étude :

Impliquera le test d'échantillons de caillots FFPE archivés provenant de patients confirmés atteints d'adénocarcinome pancréatique depuis 2014 (environ 20 cas par an). Les tests KRAS seront effectués à l'aide de la plateforme Idylla pour établir s'il existe une mutation du codon 12 de KRAS présente dans 94 % des cas signalés au RCHT. Les patients auront consenti à l'utilisation de leurs tissus au moment de la procédure. Prospectivement, les nouveaux patients diagnostiqués avec un adénocarcinome pancréatique subiront des tests KRAS sur le caillot FFPE dans le cadre du diagnostic de routine et des tests KRAS sur l'échantillon LBC.

Partie 3 de cette étude :

Impliquera un échantillon de sang prélevé au moment de la procédure chez des patients chez qui on soupçonne cliniquement d'avoir un cancer du poumon ou du pancréas. L'échantillon de sang unique sera prélevé de la canule insérée pour la procédure. L'échantillon de sang sera traité à l'aide des cartouches de cellules tumorales circulantes Biocartis Idylla ™ (EFGR, KRAS et BRAF pour le poumon et KRAS pour le pancréas).

Les échantillons à inclure dans l'étude seront identifiés par un (membre de l'équipe de soins directs) travaillant dans le service de cytologie qui effectuera une recherche informatisée chaque semaine et identifiera les patients chez qui un carcinome pulmonaire non à petites cellules ou un adénocarcinome pancréatique a été diagnostiqué. Le numéro de laboratoire d'origine du patient sera saisi dans une base de données sécurisée et protégée par un mot de passe et le patient se verra alors attribuer un nouveau numéro d'étude. Cette base de données et les informations sur les patients ne seront accessibles que par le scientifique biomédical senior et seront stockées dans un fichier électronique sécurisé conformément à la gouvernance de l'information et à la confidentialité des patients. Les échantillons de patients seront étiquetés avec le numéro d'étude et le numéro de laboratoire d'origine et toutes les informations sur les patients seront couvertes. Le chercheur n'aura accès à aucune information sur les patients et ne pourra identifier aucun patient. Le scientifique biomédical principal stockera les résultats anonymisés de l'étude dans la base de données. La durée de l'étude sera de 24 mois. Au cours de laquelle on estime que le nombre suivant de patients seront testés :

100 patients atteints de carcinome pulmonaire non à petites cellules 60 échantillons rétrospectifs d'adénocarcinome pancréatique 40 patients potentiels atteints d'adénocarcinome pancréatique

Les patients se présentant pour EUS (échographie endoscopique) ou EBUS (échographie endobronchique) ont guidé des aspirations à l'aiguille fine avec une suspicion clinique de carcinome pulmonaire non à petites cellules ou de carcinome pancréatique par une équipe multidisciplinaire. Les échantillons à inclure dans l'étude seront identifiés par un scientifique biomédical senior (membre de l'équipe de soins directs) travaillant dans le service de cytologie qui effectuera une recherche informatisée chaque semaine et identifiera les patients chez qui un carcinome pulmonaire non à petites cellules et un cancer du pancréas ont été diagnostiqués. adénocarcinome. Le numéro de laboratoire d'origine du patient sera saisi dans une base de données sécurisée et protégée par un mot de passe et le patient se verra alors attribuer un nouveau numéro d'étude. Cette base de données et les informations sur les patients ne seront accessibles que par le scientifique biomédical senior et seront stockées dans un fichier sécurisé conformément à la gouvernance de l'information et à la confidentialité des patients. Les échantillons de patients seront étiquetés avec le numéro d'étude et le numéro de laboratoire d'origine et toutes les informations sur les patients seront couvertes. Le chercheur n'aura accès à aucune information sur les patients et ne pourra identifier aucun patient. Les échantillons qui ne répondent pas aux critères de l'étude seront éliminés conformément au protocole du laboratoire.

Toutes les données des patients (y compris les échantillons de tissus et les rapports associés) seront anonymisées avant d'être communiquées au chercheur principal. Les données identifiables sont liées par un numéro de laboratoire. Ces informations sont stockées dans une base de données sécurisée accessible uniquement par un membre de l'équipe de soins directs.

Toutes les informations sont stockées et sauvegardées sur des serveurs sécurisés à l'Hôpital Royal de Cornwall. Toutes les bases de données pertinentes pour la recherche seront protégées par un mot de passe et cela est contrôlé par le service informatique du RCHT. L'emplacement des bases de données elles-mêmes ne sera accessible qu'aux utilisateurs autorisés.

Aucune autre intervention du patient n'est requise pour cette recherche.

Si les échantillons de cytologie en milieu liquide (LBC) s'avèrent être une alternative réalisable pour les tests de mutation EGFR, KRAS et BRAF, cela pourrait entraîner :

• Délai d'obtention des résultats plus rapide en cas d'adénocarcinome non équivoque. Cela fournirait
• Un accès plus précoce au traitement permettant une prise en charge optimale du patient.
• Élargit la gamme de tests moléculaires fournis en interne, comme recommandé par la bibliothèque de tests NHS.
• Préparation simplifiée des échantillons au sein du laboratoire
• L'augmentation de l'utilisation efficace du matériel pourrait également empêcher la répétition des procédures d'échantillonnage sur les patients.
• L'utilisation d'échantillons LBC peut permettre de meilleurs résultats à partir de tests moléculaires (méthanol fixateur supérieur au formol).
• Soutient l'utilisation de tests d'échantillons sanguins pour les cellules tumorales circulantes (échantillonnage moins invasif). Cela pourrait identifier à quel stade de la maladie les cellules tumorales en circulation peuvent être détectées dans le plasma sanguin, ce qui en ferait un futur outil de diagnostic et de suivi potentiel.
• Prend en charge les tests de mutation KRAS pour l'adénocarcinome pancréatique et le développement futur de thérapies cibles spécifiques à la mutation du codon 12