KEBI-Cyto-studie - Användning av Biocartis Idylla

Framsteg inom medicinen har resulterat i utvecklingen av specifika läkemedel för att behandla cancer som uttrycker vissa mutationer. Detekteringen av epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR), BRAF- och KRAS-mutationer (10-30 %, 1-2 %, 25 % respektive) i lungcancer och KRAS-mutationer i 94 % av pankreascancer gör att dessa patienter kan behandlas med en bredare kohort av läkemedel, vilket potentiellt kan resultera i progressionsfri, förlängd överlevnad, med en mer gynnsam tolerabilitet och mindre negativa effekter jämfört med kemoterapi.

NHS England har en testkatalog som listar de molekylära tester som förtroende bör tillhandahålla cancerpatienter. EGRF, KRAS och BRAF listas i denna katalog. Verifiering av användningen av Idylla skulle göra det möjligt för detta förtroende att tillhandahålla alla dessa molekylära tester effektivt. Lung- och bukspottkörtelcancer förekommer båda vid avancerade sjukdomstillstånd och därför är en snabb vändning av testresultaten avgörande. För närvarande förlitar sig laboratorier på användningen av formalinfixerade paraffininbäddade (FFPE) prover för EGFR-testning.

Blodproppar produceras i laboratoriet för att stelna alla vävnadsfragment och celler till en fast massa. Det koagulerade provet fixeras sedan i formalin och bearbetas. Den aktuella handläggnings- och rapporteringstiden är 5 dagar. Vätskebaserade cytologiprover (LBC) erhållna genom samma provtagningsförfaranden prepareras också i laboratoriet och fixeras med ett metanolbaserat fixativ som kallas Preservcyt. Tidigare forskning har utförts för att avgöra om LBC-prover kan användas istället för FFPE-prover för mutationsdetektion med gynnsamt resultat. En övergång till användning av LBC-prover för mutationsanalys på Idylla skulle ta bort flera bearbetningssteg och använda sig av restprover som för närvarande kasseras, vilket optimerar mängden testning som vi kan köra på små cytologiprover, vilket minskar sannolikheten för upprepning rutiner för patienter. Alkoholfixering anses vara en överlägsen metod för DNA- och RNA-konservering, därför kommer bättre molekylära resultat att ses.

Detektering av mutationer i cirkulerande tumörceller skulle i framtiden kunna eliminera behovet av invasiva procedurer, med patienter som kräver ett enkelt blodprov för diagnos.

Syftet med studien är att avgöra om LBC-prover är ett genomförbart och tillförlitligt alternativ till FFPE-prover för att detektera mutationer i LBC-prover och blod med hjälp av Idylla-plattformen.

Hypotes: EFGR-, KRAS- och BRAF-mutationer identifierade med FFPE-prover kommer att detekteras i LBC- och blodplasmaprover med hjälp av Biocartis Idylla™-plattformen.

Del 1 av studien: (förlängning av tidigare forskningsprojekt - IRAS-nummer: 261622) Kommer att använda restmaterial från befintliga LBC-cytologiprover som skickas till laboratoriet. Rutinmässiga tester kommer att ha prioritet. Fall som identifieras som icke-småcelligt lungkarcinom kommer att få det kvarvarande LBC-provet testat på Idylla-plattformen för EGFR, KRAS och BRAF. EGFR-, KRAS- och BRAF-mutationsresultaten som erhållits med den rutindiagnostiska proceduren (FFPE-prover) kommer att jämföras med de som produceras med LBC-proverna.

Del 2 av denna studie:

Kommer att innebära att testa arkiverade FFPE-proppprover från bekräftade pankreasadenokarcinompatienter sedan 2014 (Cirka 20 fall per år). KRAS-testning kommer att utföras med hjälp av Idylla-plattformen för att fastställa om det finns en KRAS-kodon 12-mutation närvarande i 94 % procent av fallen som rapporterats vid RCHT. Patienterna kommer att ha samtyckt till användningen av deras vävnad vid tidpunkten för ingreppet. Prospektivt nya patienter som diagnostiserats med bukspottkörteladenokarcinom kommer att få KRAS-test på FFPE-koageln som en del av rutindiagnostiken och KRAS-testning på LBC-provet.

Del 3 av denna studie:

Kommer att innebära att ett blodprov tas vid tidpunkten för ingreppet från patienter som har en klinisk misstanke om att ha lung- eller pankreascancer. Det enda blodprovet kommer att tas från kanylen som sätts in för proceduren. Blodprovet kommer att behandlas med hjälp av Biocartis Idylla™ cirkulerande tumörcellspatroner (EFGR, KRAS och BRAF för lungor och KRAS för bukspottkörteln).

Prover för inkludering i studien kommer att identifieras av en (medlem i direktvårdsteamet) som arbetar på cytologiavdelningen som kommer att utföra en datoriserad sökning varje vecka och identifiera patienter som har diagnostiserats med icke-småcelligt lungkarcinom eller pankreasadenokarcinom. Patientens ursprungliga laboratorienummer kommer att föras in i en säker, lösenordsskyddad databas och patienten kommer sedan att tilldelas ett nytt studienummer. Denna databas och patientinformation kommer endast att vara tillgänglig för den seniora biomedicinska forskaren och kommer att lagras i en säker elektronisk fil i enlighet med informationsstyrning och patientsekretess. Patientprover kommer att märkas med studienumret och det ursprungliga laboratorienumret och all patientinformation kommer att täckas. Forskaren kommer inte att ha tillgång till någon patientinformation och kommer inte att kunna identifiera några patienter. Den seniora biomedicinska forskaren kommer att lagra de anonymiserade resultaten av studien i databasen. Studietiden kommer att vara 24 månader. Under vilken tid det beräknas att följande antal patienter kommer att testas:

100 patienter för icke-småcelligt lungkarcinom 60 retrospektiva pankreasadenokarcinomprover 40 potentiella pankreasadenokarcinompatienter

Patienter som går för EUS (Endoskopiskt ultraljud) eller EBUS (Endobronkialt ultraljud) vägledde finnålsaspirationer med en klinisk misstanke om icke-småcelligt lungkarcinom eller pankreascancer av multidisciplinärt team. Prover för inkludering i studien kommer att identifieras av en senior biomedicinsk forskare (medlem i direktvårdsteamet) som arbetar på cytologiavdelningen som kommer att utföra en datoriserad sökning varje vecka och identifiera patienter som har diagnostiserats med icke-småcelligt lungkarcinom och pankreas. adenokarcinom. Patientens ursprungliga laboratorienummer kommer att föras in i en säker, lösenordsskyddad databas och patienten kommer sedan att tilldelas ett nytt studienummer. Denna databas och patientinformation kommer endast att vara tillgänglig för den seniora biomedicinska forskaren och kommer att lagras i en säker fil i enlighet med informationsstyrning och patientsekretess. Patientprover kommer att märkas med studienumret och det ursprungliga laboratorienumret och all patientinformation kommer att täckas. Forskaren kommer inte att ha tillgång till någon patientinformation och kommer inte att kunna identifiera några patienter. Prover som inte uppfyller studiekriterierna kommer att kasseras i enlighet med laboratorieprotokoll.

Alla patientdata (inklusive vävnadsprover och tillhörande rapporter) kommer att anonymiseras innan de släpps till den primära forskaren. De identifierbara uppgifterna är länkade med ett laboratorienummer. Denna information lagras i en säker databas som endast är tillgänglig för en medlem av direktvårdsteamet.

All information lagras och säkerhetskopieras på säkra servrar på Royal Cornwall Hospital. Alla databaser som är relevanta för forskningen kommer att vara lösenordsskyddade och detta övervakas av RCHT IT-avdelning. Platsen för själva databaserna kommer endast att vara tillgänglig för behöriga användare.

Ingen ytterligare patientintervention krävs för denna forskning.

Om vätskebaserade cytologiprover (LBC) visar sig vara ett genomförbart alternativ för EGFR-, KRAS- och BRAF-mutationstestning har detta potential att resultera i:

• Snabbare behandlingstid för resultat i fall av otvetydigt adenokarcinom. Detta skulle ge
• Tidigare tillgång till behandling möjliggör optimal patienthantering.
• Utökar utbudet av molekylära tester som tillhandahålls internt enligt rekommendationerna av NHS testbibliotek.
• Enklare provberedning inom laboratoriet
• Ökad effektiv användning av material skulle också kunna förhindra upprepade provtagningsprocedurer på patienter.
• Användning av LBC-prover kan ge bättre resultat från molekylär testning (metanol överlägset fixativ till formalin).
• Stöder användning av blodprovstestning för cirkulerande tumörceller (mindre invasiv provtagning). Detta kan identifiera vid vilken sjukdomsstadium cirkulerande tumörceller kan detekteras i blodplasma, vilket skulle göra det till ett potentiellt framtida diagnostiskt triaging- och uppföljningsverktyg.
• Stöder KRAS-mutationstestning för pankreasadenokarcinom och framtida utveckling av målterapier specifika för kodon 12-mutationen