KEBI-Cyto tanulmány – A Biocartis Idylla használata

Az orvostudomány fejlődése specifikus gyógyszerek kifejlesztését eredményezte bizonyos mutációkat kifejező rákos megbetegedések kezelésére. Az epidermális növekedési faktor receptor (EGFR), BRAF és KRAS mutációk (10-30%, 1-2%, 25%) kimutatása tüdőrákban és KRAS mutációk kimutatása a hasnyálmirigyrákok 94%-ában lehetővé teszi ezeknek a betegeknek a kezelését szélesebb gyógyszercsoport, amely potenciálisan progressziómentes, hosszabb túlélést, kedvezőbb tolerálhatóságot és kevésbé káros hatásokat eredményez a kemoterápiához képest.

Az angliai NHS tesztkönyvtárral rendelkezik, amely felsorolja azokat a molekuláris teszteket, amelyeket a trösztöknek biztosítaniuk kell a rákos betegek számára. Az EGRF, KRAS és BRAF szerepel ebben a könyvtárban. Az Idylla használatának ellenőrzése lehetővé tenné, hogy ez a bizalom hatékonyan elvégezze ezeket a molekuláris teszteket. Mind a tüdő-, mind a hasnyálmirigyrák előrehaladott kórállapotban jelentkezik, ezért létfontosságú a vizsgálati eredmények gyors megváltoztatása. Jelenleg a laboratóriumok formalin-fixált paraffinba ágyazott (FFPE) mintákat használnak az EGFR-vizsgálathoz.

A laboratóriumban vérrögöket állítanak elő annak érdekében, hogy az összes szövetdarabot és sejtet egyetlen szilárd masszává tömörítsék. Az alvadt mintát ezután formalinban rögzítik és feldolgozzák. A jelenlegi feldolgozási és jelentési idő 5 nap. Ugyanezen mintavételi eljárással nyert folyadékalapú citológiai (LBC) mintákat szintén a laboratóriumban készítik elő, és a Preservcyt nevű metanol alapú fixálóval rögzítik. Korábbi kutatásokat végeztek annak megállapítására, hogy az FFPE minták helyett használhatók-e LBC minták a mutációk kimutatására, kedvező eredménnyel. Az LBC-minták használatára való áttérés az Idylla mutációanalízisére több feldolgozási lépést eltávolítana, és a jelenleg eldobott maradék mintákat használná fel, ami optimalizálja a kis citológiai mintákon futtatható vizsgálatok mennyiségét, csökkentve az ismétlés valószínűségét. eljárások a betegek számára. Az alkoholos rögzítést a DNS- és RNS-megőrzés kiváló módszerének tekintik, így jobb molekuláris eredmények érhetők el.

A keringő tumorsejt-mutációk kimutatása a jövőben szükségtelenné teheti az invazív eljárások szükségességét, mivel a betegeknek egyszerű vérvizsgálatra lesz szükségük a diagnózishoz.

A tanulmány célja annak meghatározása, hogy az LBC-minták megvalósítható és megbízható alternatívái-e az FFPE-mintáknak az LBC-minták és a vér mutációinak kimutatására az Idylla platform segítségével.

Hipotézis: Az FFPE mintákkal azonosított EFGR, KRAS és BRAF mutációkat a Biocartis Idylla™ platform segítségével LBC és vérplazma mintákban lehet kimutatni.

A tanulmány 1. része: (korábbi kutatási projekt kiterjesztése – IRAS szám: 261622) A laboratóriumba küldött meglévő LBC citológiai minták maradékanyagát fogja felhasználni. A rutinvizsgálat elsőbbséget élvez. A nem kissejtes tüdőkarcinómaként azonosított esetekben a maradék LBC mintát az Idylla platformon tesztelik EGFR, KRAS és BRAF szempontjából. A rutin diagnosztikai eljárással (FFPE-minták) kapott EGFR-, KRAS- és BRAF-mutációs eredményeket összehasonlítják az LBC-minták felhasználásával kapott eredményekkel.

A tanulmány 2. része:

2014 óta igazolt hasnyálmirigy-adenokarcinómás betegek archivált FFPE-rögmintáinak tesztelését foglalja magában (évente körülbelül 20 eset). A KRAS-tesztet az Idylla platform segítségével végzik el annak megállapítására, hogy az RCHT-n jelentett esetek 94%-ában van-e KRAS 12-es kodonmutáció. A betegek az eljárás során beleegyeznek szöveteik használatába. A hasnyálmirigy-adenokarcinómával diagnosztizált leendő új betegeknél a rutin diagnosztikai munka részeként KRAS-tesztet végeznek az FFPE-rögön, és KRAS-tesztet végeznek az LBC-mintán.

A tanulmány 3. része:

Az eljárás során vérmintát vesznek olyan betegektől, akiknél fennáll a tüdő- vagy hasnyálmirigyrák klinikai gyanúja. Az egyetlen vérmintát az eljáráshoz behelyezett kanülből veszik. A vérmintát a Biocartis Idylla™ keringő tumorsejt-patronok (EFGR, KRAS és BRAF a tüdő és KRAS a hasnyálmirigy esetében) segítségével dolgozzák fel.

A vizsgálatba bevonandó mintákat a citológiai osztályon dolgozó (közvetlen gondozási csoport tagja) azonosítja, aki minden héten számítógépes keresést végez, és azonosítja azokat a betegeket, akiknél nem kissejtes tüdőkarcinómát vagy hasnyálmirigy-adenokarcinómát diagnosztizáltak. A páciens eredeti laboratóriumi száma bekerül egy biztonságos, jelszóval védett adatbázisba, majd új vizsgálati számot kap a páciens. Ehhez az adatbázishoz és a betegek információihoz csak a vezető orvosbiológus férhet hozzá, és biztonságos elektronikus fájlban tárolják az információszabályozás és a betegek bizalmas kezelésének megfelelően. A betegminták a vizsgálati számmal és az eredeti laboratóriumi számmal lesznek felcímkézve, és minden beteginformációt lefednek. A kutató nem fér hozzá semmilyen beteginformációhoz, és nem tud majd azonosítani egyetlen beteget sem. A vezető orvosbiológus a vizsgálat anonimizált eredményeit tárolja az adatbázisban. A tanulmányi idő 24 hónap lesz. A becslések szerint ez idő alatt a következő számú beteget vizsgálják meg:

100 nem kissejtes tüdőkarcinómás beteg 60 retrospektív hasnyálmirigy-adenocarcinoma minta 40 leendő pancreas adenocarcinoma beteg

Az EUS-re (endoszkópos ultrahangra) vagy EBUS-ra (endobronchiális ultrahangra) járó betegek nem-kissejtes tüdőkarcinóma vagy hasnyálmirigy-karcinóma klinikai gyanújával irányított finomtű-aspirációt, multidiszciplináris csapat által. A vizsgálatba bevonandó mintákat a citológiai osztályon dolgozó vezető orvosbiológus (a közvetlen gondozási csoport tagja) fogja azonosítani, aki hetente számítógépes keresést végez, és azonosítja azokat a betegeket, akiknél tüdő nem-kissejtes karcinómával és hasnyálmirigy-karcinómával diagnosztizáltak. adenokarcinóma. A páciens eredeti laboratóriumi száma bekerül egy biztonságos, jelszóval védett adatbázisba, majd új vizsgálati számot kap a páciens. Ehhez az adatbázishoz és a betegek információihoz csak a vezető orvosbiológus férhet hozzá, és biztonságos fájlban tárolják az információkezeléssel és a betegek bizalmas kezelésével összhangban. A betegminták a vizsgálati számmal és az eredeti laboratóriumi számmal lesznek felcímkézve, és minden beteginformációt lefednek. A kutató nem fér hozzá semmilyen beteginformációhoz, és nem tud majd azonosítani egyetlen beteget sem. Azokat a mintákat, amelyek nem felelnek meg a vizsgálati kritériumoknak, a laboratóriumi protokollnak megfelelően el kell dobni.

Minden betegadatot (beleértve a szövetmintákat és a kapcsolódó jelentéseket) anonimizálják, mielőtt azokat az elsődleges kutatónak kiadnák. Az azonosítható adatokat laboratóriumi szám köti össze. Ezeket az információkat egy biztonságos adatbázisban tárolják, amelyhez csak a közvetlen gondozási csoport tagja férhet hozzá.

Minden információt a Royal Cornwall Kórház biztonságos szerverein tárolnak és készítenek biztonsági másolatot. Minden, a kutatás szempontjából releváns adatbázis jelszóval védett lesz, és ezt az RCHT informatikai osztálya felügyeli. Maguk az adatbázisok helye csak az arra jogosult felhasználók számára lesz hozzáférhető.

Ehhez a kutatáshoz nincs szükség további páciens beavatkozásra.

Ha a folyadékalapú citológiai (LBC) minták az EGFR-, KRAS- és BRAF-mutáció-vizsgálat megvalósítható alternatívájának bizonyulnak, ez a következőket okozhatja:

• Egyértelmű adenokarcinóma esetén az eredmények gyorsabb átfutási ideje. Ez biztosítaná
• A kezeléshez való korábbi hozzáférés, amely lehetővé teszi a beteg optimális kezelését.
• Bővíti a házon belüli molekuláris vizsgálatok körét, az NHS tesztkönyvtár ajánlása szerint.
• Könnyebb minta-előkészítés a laboratóriumon belül
• Az anyagok hatékonyabb felhasználásának fokozása megakadályozhatja a betegeken végzett ismételt mintavételi eljárásokat.
• Az LBC-minták használata jobb eredményeket tesz lehetővé a molekuláris tesztelés során (a metanol kiváló fixálója a formalinhoz).
• Támogatja a keringő tumorsejtek vérminta-vizsgálatának alkalmazását (kevésbé invazív mintavétel). Ez meghatározhatja, hogy a keringő daganatsejtek milyen betegségi stádiumban mutathatók ki a vérplazmában, ami potenciális jövőbeni diagnosztikai vizsgálati és nyomon követési eszközzé tenné.
• Támogatja a hasnyálmirigy-adenokarcinóma KRAS mutációs tesztelését és a 12-es kodonmutációra specifikus célterápiák jövőbeli fejlesztését