Studio KEBI-Cyto - Uso del Biocartis Idylla

I progressi della medicina hanno portato allo sviluppo di farmaci specifici per trattare i tumori che esprimono determinate mutazioni. Il rilevamento delle mutazioni del recettore del fattore di crescita epidermico (EGFR), BRAF e KRAS (rispettivamente 10-30%, 1-2%, 25%) nei tumori polmonari e delle mutazioni KRAS nel 94% dei tumori pancreatici consente a questi pazienti di essere trattati con un più ampia coorte di farmaci, potenzialmente con conseguente sopravvivenza libera da progressione, prolungata, con una tollerabilità più favorevole e meno effetti avversi rispetto alla chemioterapia.

NHS England ha una directory di test che elenca i test molecolari che i trust dovrebbero fornire ai malati di cancro. EGRF, KRAS e BRAF sono elencati in questa directory. La verifica dell'uso dell'Idylla consentirebbe a questa fiducia di fornire efficacemente tutti questi test molecolari. I tumori del polmone e del pancreas sono entrambi presenti in stati di malattia avanzati e quindi è vitale una rapida inversione dei risultati dei test. Attualmente i laboratori si affidano all'uso di campioni inclusi in paraffina fissati in formalina (FFPE) per i test EGFR.

I coaguli vengono prodotti in laboratorio per congelare tutti i frammenti di tessuto e le cellule in una massa solida. Il campione coagulato viene quindi fissato in formalina ed elaborato. L'attuale tempo di elaborazione e reporting è di 5 giorni. Anche i campioni per citologia su base liquida (LBC) ottenuti mediante le stesse procedure di campionamento vengono preparati in laboratorio e fissati utilizzando un fissativo a base di metanolo chiamato Preservcyt. Sono state condotte ricerche precedenti per determinare se i campioni LBC possono essere utilizzati al posto dei campioni FFPE per il rilevamento delle mutazioni con risultati favorevoli. Un passaggio all'uso di campioni LBC per l'analisi delle mutazioni sull'Idylla eliminerebbe più passaggi di elaborazione e utilizzerebbe campioni residui che sono attualmente scartati, il che ottimizza la quantità di test che possiamo eseguire su piccoli campioni citologici, riducendo la probabilità di ripetizione procedure per i pazienti. La fissazione dell'alcol è considerata un metodo superiore di conservazione del DNA e dell'RNA, pertanto si vedranno risultati molecolari migliori.

Il rilevamento di mutazioni delle cellule tumorali circolanti potrebbe in futuro annullare la necessità di procedure invasive, con pazienti che richiedono un semplice esame del sangue per la diagnosi.

Lo scopo dello studio è determinare se i campioni LBC sono un'alternativa fattibile e affidabile ai campioni FFPE per rilevare mutazioni nei campioni LBC e nel sangue utilizzando la piattaforma Idylla.

Ipotesi: le mutazioni EFGR, KRAS e BRAF identificate utilizzando campioni FFPE saranno rilevate in LBC e campioni di plasma sanguigno utilizzando la piattaforma Biocartis Idylla ™.

Parte 1 dello studio: (estensione del precedente progetto di ricerca - Numero IRAS: 261622) Utilizzerà materiale residuo da campioni di citologia LBC esistenti inviati al laboratorio. I test di routine avranno la priorità. I casi identificati come carcinoma polmonare non a piccole cellule avranno il campione LBC residuo testato sulla piattaforma Idylla per EGFR, KRAS e BRAF. I risultati delle mutazioni EGFR, KRAS e BRAF ottenuti utilizzando la procedura diagnostica di routine (campioni FFPE) saranno confrontati con quelli prodotti utilizzando i campioni LBC.

Parte 2 di questo studio:

Comporterà l'analisi di campioni di coaguli FFPE archiviati da pazienti con adenocarcinoma pancreatico confermato dal 2014 (circa 20 casi all'anno). Il test KRAS verrà eseguito utilizzando la piattaforma Idylla per stabilire se è presente una mutazione del codone 12 KRAS nel 94% dei casi riportati all'RCHT. I pazienti avranno acconsentito all'uso del loro tessuto al momento della procedura. In prospettiva, i nuovi pazienti con diagnosi di adenocarcinoma pancreatico verranno sottoposti a test KRAS sul coagulo FFPE effettuato come parte del lavoro diagnostico di routine e test KRAS sul campione LBC.

Parte 3 di questo studio:

Comporterà un prelievo di sangue al momento della procedura da pazienti che hanno un sospetto clinico di avere un cancro ai polmoni o al pancreas. Il singolo campione di sangue verrà prelevato dalla cannula inserita per la procedura. Il campione di sangue verrà elaborato utilizzando le cartucce di cellule tumorali circolanti Biocartis Idylla ™ (EFGR, KRAS e BRAF per il polmone e KRAS per il pancreas).

I campioni da includere nello studio saranno identificati da un (membro del team di assistenza diretta) che lavora nel dipartimento di citologia che eseguirà una ricerca computerizzata ogni settimana e identificherà i pazienti a cui è stato diagnosticato carcinoma polmonare non a piccole cellule o adenocarcinoma pancreatico. Il numero di laboratorio originale del paziente verrà inserito in un database sicuro e protetto da password e al paziente verrà quindi assegnato un nuovo numero di studio. Questo database e le informazioni sui pazienti saranno accessibili solo allo scienziato biomedico senior e saranno archiviati in un file elettronico sicuro in conformità con la governance delle informazioni e la riservatezza dei pazienti. I campioni dei pazienti saranno etichettati con il numero dello studio e il numero del laboratorio originale e tutte le informazioni sui pazienti saranno coperte. Il ricercatore non avrà accesso ad alcuna informazione del paziente e non sarà in grado di identificare alcun paziente. Lo scienziato biomedico senior memorizzerà i risultati anonimizzati dello studio nel database. La durata dello studio sarà di 24 mesi. In quale tempo si stima che verrà testato il seguente numero di pazienti:

100 pazienti per carcinoma polmonare non a piccole cellule 60 campioni retrospettivi di adenocarcinoma pancreatico 40 pazienti prospettici con adenocarcinoma pancreatico

Pazienti sottoposti a agoaspirato guidato da EUS (ecografia endoscopica) o EBUS (ecografia endobronchiale) con sospetto clinico di carcinoma polmonare non a piccole cellule o carcinoma pancreatico da parte di un team multidisciplinare. I campioni da includere nello studio saranno identificati da uno scienziato biomedico senior (membro del team di assistenza diretta) che lavora nel dipartimento di citologia che eseguirà una ricerca computerizzata ogni settimana e identificherà i pazienti a cui è stato diagnosticato carcinoma polmonare non a piccole cellule e carcinoma pancreatico adenocarcinoma. Il numero di laboratorio originale del paziente verrà inserito in un database sicuro e protetto da password e al paziente verrà quindi assegnato un nuovo numero di studio. Questo database e le informazioni sui pazienti saranno accessibili solo allo scienziato biomedico senior e saranno archiviati in un file sicuro in conformità con la governance delle informazioni e la riservatezza dei pazienti. I campioni dei pazienti saranno etichettati con il numero dello studio e il numero del laboratorio originale e tutte le informazioni sui pazienti saranno coperte. Il ricercatore non avrà accesso ad alcuna informazione del paziente e non sarà in grado di identificare alcun paziente. I campioni che non soddisfano i criteri dello studio verranno eliminati in conformità con il protocollo di laboratorio.

Tutti i dati dei pazienti (compresi i campioni di tessuto e i rapporti associati) saranno resi anonimi prima di essere rilasciati al ricercatore principale. I dati identificabili sono collegati da un numero di laboratorio. Queste informazioni sono archiviate in un database sicuro accessibile solo da un membro del team di assistenza diretta.

Tutte le informazioni vengono archiviate e salvate su server sicuri presso il Royal Cornwall Hospital. Tutti i database rilevanti per la ricerca saranno protetti da password e questo è monitorato dal dipartimento IT di RCHT. L'ubicazione dei database stessi sarà accessibile solo agli utenti autorizzati.

Nessun ulteriore intervento del paziente è richiesto per questa ricerca.

Se si scopre che i campioni di citologia su base liquida (LBC) sono un'alternativa fattibile per i test di mutazione EGFR, KRAS e BRAF, ciò potrebbe potenzialmente portare a:

• Tempi di consegna più rapidi dei risultati nei casi di adenocarcinoma inequivocabile. Questo fornirebbe
• Accesso anticipato al trattamento che consente una gestione ottimale del paziente.
• Amplia la gamma di test molecolari forniti internamente come raccomandato dalla libreria di test NHS.
• Preparazione del campione più semplice all'interno del laboratorio
• L'aumento dell'uso efficiente del materiale potrebbe anche impedire la ripetizione delle procedure di campionamento sui pazienti.
• L'uso di campioni LBC può consentire risultati migliori dai test molecolari (fissativo superiore al metanolo rispetto alla formalina).
• Supporti dell'uso del test del campione di sangue per le cellule tumorali circolanti (prelievo meno invasivo). Questo potrebbe identificare in quale stadio della malattia le cellule tumorali circolanti possono essere rilevate nel plasma sanguigno, il che lo renderebbe un potenziale futuro strumento diagnostico di triaging e follow-up.
• Supporta il test di mutazione KRAS per l'adenocarcinoma pancreatico e lo sviluppo futuro di terapie target specifiche per la mutazione del codone 12