表征从 COVID-19 中恢复过来的个体的 SARS-CoV-2 特异性免疫力

没有因 COVID-19 而住院、没有第 3 组中指定的临床谱或结果的人

• 1A：无症状感染者，年龄在 18 至 55 岁之间，包括
• 1B：无症状感染者，年龄＞55岁
• 1C：18 至 55 岁有症状感染（即 COVID-19）的人
• 1D：有症状感染者（即 COVID-19），年龄 > 55 岁

• 可选的鼻标本
• 采血

以前因 COVID-19 而住院但没有第 3 组中指定的临床谱或结果的人

• 2A：18 至 55 岁的人
• 2B：> 55 岁的人

• 可选的鼻标本
• 采血

• 可选的鼻标本
• 采血

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每块板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性截止值（将由实验室提供），则每个访视的阳性反应将被判定。 MFI减去空白（或净MFI）用于总结给定时间点的反应强度。

该表总结了访视1、2、3时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和入组组别细分。

对参与者在访视1（第0个月，基线）的样本以及随访访视（第2、4个月）中可用的样本进行了BAMA测定。 在Bio-Plex仪器（Bio-Rad）上测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每块板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果在每次访视时，MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表格总结了通过结合抗体多重测定（BAMA IgG1）在访视1、2、3时，整体以及按地区和入组组别划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

对参与者访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中对SARS-CoV-2抗原的SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同种型、抗原和稀释度特异性截止值（将由实验室提供），则每次访视的阳性反应将被判定。 MFI减去空白（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中访视1、访视2、总体以及按地区和入组组别的通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 若MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表格总结了美国队列中访视1、2时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体、按地区和入组组别的情况。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中，通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）在访视1、访视2、总体以及按地区和入组组别划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果在每次访视时，MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表格总结了美国队列中访视1、访视2、总体以及按地区和入组组别划分的通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

所有HIV阴性样本中针对SARS冠状病毒的中和抗体均在293T/ACE2细胞中测定。 同时测定MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限LLOD）或MPI介于10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同检测方法——VSV假病毒中和试验进行测定。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）中是否观察到任何中和现象，且MPI介于10%-50%之间。 对于阳性但中和未达到50%或80%的情况，ID50/ID80滴度首先通过Prism软件估算。

该表汇总了美国队列（仅限美国和秘鲁）在访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测定的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况、按地区和入组分组的结果。

针对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限），或MPI介于10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI介于10%-50%之间。 对于阳性但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了美国队列（仅限美国和秘鲁）中，在访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括整体情况以及按地区和入组组别的细分。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限（LLOD））或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了非洲队列中，在访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况、按地区和入组组别分类的结果。

所有HIV阴性样本中针对SARS冠状病毒的中和抗体均在293T/ACE2细胞中进行测量。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测方法的下限检测值（LLOD））或MPI介于10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过另一种检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI介于10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，ID50/ID80滴度首先通过Prism进行估算。

该表总结了非洲队列中通过中和抗体检测（NAb）在访视1、2、3、4时，以及总体、按地区和入组组别划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

将使用ADCC测定法在1:500稀释度下测量抗体依赖性NK细胞脱颗粒。 两个读数将是感染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞。 如果背景扣除% CD107A+的值分别≥4.07和≥5.27（感染细胞和转染细胞），则判定为阳性反应。 这些阈值分别由SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 CD107a+ NK细胞百分比是反应幅度。

该表总结了在访视1时，通过抗体依赖性细胞毒性测定法（ADCC）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，总体以及按地区和入组组别在美洲队列（仅限美国和秘鲁）中的情况。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定法在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将是感染细胞的背景扣除后CD107A+ NK细胞百分比和转染细胞的背景扣除后CD107A+ NK细胞百分比。 如果背景扣除后CD107A+百分比分别≥4.07和≥5.27（感染细胞和转染细胞），则视为阳性反应。 这些阈值分别根据SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 CD107a+ NK细胞百分比是反应幅度。

该表总结了美国队列中通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）第1次访视时SARS-CoV-2特异性抗体结合反应幅度，包括总体、按地区和入组组别的情况。

采用流式细胞术，通过细胞内细胞因子染色（ICS）检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞应答。 所有标记物的阳性判定将使用Fisher精确阳性检验。 反应强度以表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比表示。

该表总结了美洲队列（仅美国和秘鲁）在访视1时，通过流式细胞术检测的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞应答率，包括总体情况以及按地区和入组组别分类的结果。

使用细胞内细胞因子染色（ICS）技术，通过流式细胞术检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 所有标志物的阳性判定将采用Fisher精确阳性检验。 数值为表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比。

该表格总结了美洲队列阳性应答者（美国和秘鲁）在访视1时，通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应强度，包括总体情况、按地区和入组组别分类的数据。

使用荧光标记的重组Env蛋白（S6P和RBD）结合流式细胞术抗体组，对入组访视（V1）所有可用样本中的SARS-CoV-2特异性B细胞应答和B细胞表型数据进行了识别和表征。 B细胞表型数据没有阳性判定。 幅度为B细胞亚群频率。

该表格总结了美洲队列（仅限美国和秘鲁）在访视1时通过流式细胞术检测的SARS-CoV-2特异性记忆B细胞应答幅度，包括总体情况以及按地区和入组组别分类的数据。

对参与者第1次访视（第0个月，基线）及后续访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中针对SARS-CoV-2抗原的特异性IgA、IgG1、IgG3反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 若MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定该访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）中通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）在第1、2、3次访视时，以及整体、按地区和COVID-19严重程度划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）的样本以及随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的一个空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果在每个访视点，MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）中，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）在访视1、2、3时，总体、按地区以及按COVID-19严重程度划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

对参与者在访视1（第0个月，基线）及后续访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度值。 若MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（由实验室提供），则判定该访视为阳性反应。 使用MFI减去空白值（或净MFI）来总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）在访视1、访视2、总体及各地区和COVID-19严重程度分层的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率（通过结合抗体多重检测BAMA IgG3测定）。

对参与者在访视1（第0月，基线）和随访访视（第2、4月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性截断值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结给定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）中通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）在访视1、2、总体及按地区和COVID-19严重程度分层的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）及随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每块板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 使用MFI减去空白值（或净MFI）来总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）在访视1、2时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况以及按地区和COVID-19严重程度分层的结果。

所有HIV阴性样本中针对SARS冠状病毒的中和抗体均在293T/ACE2细胞中进行测量。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限（LLOD））或MPI介于10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过另一种检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI介于10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先使用Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和COVID-19严重程度划分的情况。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限（LLOD））或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于在整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表总结了美国队列中，在第1、2、3、4次访视时，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况以及按地区和COVID-19严重程度分组的结果。

所有HIV阴性样本均在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。同时测量MPI（最大抑制百分比）。阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。对于阳性但中和未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了第1、2、3、4次访视时，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况、按地区和COVID-19严重程度分类的结果。

所有HIV阴性样本中针对SARS冠状病毒的中和抗体均在293T/ACE2细胞中测量。同时测量MPI（最大抑制百分比）。阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限），或MPI介于10%-50%之间。所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）是否观察到任何中和作用，且MPI介于10%-50%之间。对于阳性结果但中和作用未达到50%或80%的情况，ID50/ID80滴度首先通过Prism进行估算。

该表格总结了非洲队列中，通过中和抗体检测（NAb）在第1、2、3、4次访视时，以及总体、按地区和COVID-19严重程度划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将分别是感染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞。 如果感染细胞和转染细胞的背景扣除后% CD107A+值分别≥4.07和≥5.27，则判定为阳性反应。 这些截断值分别根据SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 % CD107a+ NK细胞是反应强度指标。

该表总结了在访视1时，通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，整体以及按地区和COVID-19严重程度分层，基于美洲队列（美国和秘鲁）

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将是感染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞。 如果背景扣除% CD107A+的值分别≥4.07和≥5.27（针对感染细胞和转染细胞），则判定为阳性反应。 截断值分别根据SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 CD107a+ NK细胞百分比是反应幅度。

该表格总结了通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应幅度（访视1），包括总体情况以及按地区和COVID-19严重程度划分的American Cohort（美国和秘鲁）数据。

采用流式细胞术，通过细胞内细胞因子染色（ICS）检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 所有标志物的阳性判定将使用Fisher精确阳性检验进行。 幅度为表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比。

该表格总结了美洲队列（美国和秘鲁）在访视1时，通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应率，包括总体情况、按地区分组以及按COVID-19严重程度分组的结果。

使用细胞内细胞因子染色法（ICS），通过流式细胞术检测了SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 所有标记物的阳性判定将采用Fisher精确阳性检验。 反应强度以表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比表示。

该表格总结了美国队列中访视1时通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应强度，包括总体情况、按地区分组以及按COVID-19严重程度分组的结果。

使用荧光标记的重组Env蛋白（S6P和RBD）结合流式细胞术抗体组合，对所有可用入组访视（V1）样本中的SARS-CoV-2特异性B细胞反应和B细胞表型数据进行了鉴定和表征。 仅当样本中IgD- B细胞数量大于或等于1000时，该样本才会被纳入分析。

该表总结了访视1时通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性记忆B细胞反应强度，包括总体情况、按地区划分以及美国队列（美国和秘鲁）内按COVID-19严重程度划分的情况。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性截断值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）在访视1、2、3时，整体以及按地区和自SARS-CoV-2诊断后天数分组的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）及随访访视（第2、4个月）时的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度值。 若MFI减去空白值≥同型、抗原及稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定该访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中，通过BAMA IgG1检测的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，按访视1、2、3总体情况，以及按地区和自SARS-CoV-2确诊后天数分组的情况。

对参与者在访视1（第0月，基线）的样本以及随访访视（第2、4月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每个板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则在每次访视时将判定为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）在访视1、访视2、总体以及按地区和自SARS-CoV-2诊断以来的天数分组的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 使用MFI减去空白（或净MFI）来总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中访视1、2时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况、按地区和自SARS-CoV-2诊断后天数分组的结果。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表格总结了美国队列中访视1、访视2、总体以及按地区和自SARS-CoV-2诊断天数分组的通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在第1次访视（第0个月，基线）的样本以及随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列中第1、2次访视时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况、按区域分组以及按SARS-CoV-2确诊后天数分组的情况。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性结果但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了美洲队列中，在访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体、按地区和按SARS-CoV-2诊断后天数分组的情况。

针对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程中（起始稀释度为1:20）是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，ID50/ID80滴度首先通过Prism软件进行估算。

该表格总结了美国队列中，通过中和抗体检测（NAb）在访视1、2、3、4时，总体及按地区和自SARS-CoV-2诊断天数分组的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

针对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法（VSV假病毒中和检测）进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先使用Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了非洲队列中，通过中和抗体检测（NAb）在访视1、2、3、4时，以及总体、按地区和按SARS-CoV-2诊断后天数分组的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表总结了非洲队列中，在访视1、2、3、4时，以及总体、按地区和SARS-CoV-2诊断后天数分组，通过中和抗体检测（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将分别是感染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞。 如果感染细胞和转染细胞的背景扣除后% CD107A+值分别≥4.07和≥5.27，将被判定为阳性反应。 这些截断值分别根据SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 % CD107a+ NK细胞是反应强度指标。

该表总结了美洲队列（美国和秘鲁）在访视1时，通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）测定的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和SARS-CoV-2诊断后天数分组的情况。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将使用ADCC测定在1:500稀释度下测量。 两个读数将分别是感染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除后% CD107A+ NK细胞。 如果背景扣除后% CD107A+的值分别≥4.07和≥5.27（针对感染细胞和转染细胞），则将被判定为阳性反应。 这些截断值分别根据SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 % CD107a+ NK细胞为反应幅度。

该表总结了美国队列中SARS-CoV-2特异性抗体结合反应幅度，通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）第1次访视，按总体、地区和自SARS-CoV-2诊断以来的天数分组。

采用流式细胞术，通过细胞内细胞因子染色（ICS）检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 将使用Fisher精确阳性检验对所有标记物进行阳性判定。 反应强度以表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比表示。

该表格总结了美国队列中，在访视1时通过流式细胞术检测的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应率，包括总体情况、按地区分组以及按SARS-CoV-2确诊后天数分组的情况。

采用流式细胞术，通过细胞内细胞因子染色（ICS）检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 所有标记物将使用Fisher精确阳性检验进行阳性判定。 反应强度以表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比表示。

该表总结了美国队列中，在访视1时通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应强度，包括总体情况以及按地区和SARS-CoV-2诊断后天数分组的情况。

使用荧光标记的重组Env蛋白（S6P和RBD）结合流式细胞术抗体面板，对所有可用入组访视（V1）样本中的SARS-CoV-2特异性B细胞反应及B细胞表型数据进行鉴定和表征。 只有当样本中IgD- B细胞数量等于或大于1000时，该样本才会被纳入分析。

该表格总结了美国队列中按地区和自SARS-CoV-2确诊后天数分组的SARS-CoV-2特异性记忆B细胞反应强度（B细胞）

对参与者第1次访视（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中针对SARS-CoV-2抗原的特异性IgA、IgG1、IgG3反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每块板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表格总结了美国队列中第1、2、3次访视时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和共病组别分层的结果。

对参与者在访视1（第0个月，基线）及随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中对SARS-CoV-2抗原的特异性IgA、IgG1、IgG3反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 若MFI减去空白值≥同型、抗原及稀释度特异性阈值（由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgG1）在访视1、2、3时，整体及按地区和共病组划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

BAMA检测对参与者在访视1（第0个月，基线）及随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了分析。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 若MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定该次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）在访视1、2时SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和合并症组别分类的结果。

对参与者在访视1（第0个月，基线）和随访访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释特异性阈值（将由实验室提供），则每次访视的阳性反应将被判定。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结给定时间点的反应强度。

该表格总结了美国队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgG3）在访视1、2时，总体及按地区和合并症组别的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

对参与者在访视1（第0月，基线）的样本以及随访访视（第2月、第4月）中的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中针对SARS-CoV-2抗原的SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每个板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果在每次访视时，MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性截断值（将由实验室提供），则判定为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）在访视1、访视2、总体以及按地区和合并症组划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对参与者在第1次访视（第0个月，基线）和后续访视（第2、4个月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度为1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度。 如果MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释特异性截断值（由实验室提供），则判定每次访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美洲队列中通过结合抗体多重检测（BAMA IgA）在第1、2次访视时SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体、按地区和合并症分组的情况。

针对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判断标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判断基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性结果但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表总结了美洲队列中，通过中和抗体检测（NAb）在访视1、2、3、4时，以及总体、按地区和合并症组别的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值大于20（检测的下限检测值）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过另一种检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表总结了美国队列在访视1、2、3、4时，通过中和抗体试验（NAb）测量的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况以及按地区和合并症组别细分的结果。

对所有HIV阴性样本，在293T/ACE2细胞中测量针对SARS冠状病毒的中和抗体。 同时测量MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限）或MPI在10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测量。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI在10%-50%之间。 对于阳性判定但中和作用未达到50%或80%的情况，ID50/ID80滴度首先通过Prism进行估算。

该表格总结了非洲队列中，在访视1、2、3、4时，通过中和抗体检测（NAb）测得的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率，包括总体情况以及按地区和合并症组别分类的结果。

所有HIV阴性样本中的SARS冠状病毒中和抗体均在293T/ACE2细胞中检测。 同时测定MPI（最大抑制百分比）。 阳性判定标准为ID50/ID80（50%和80%抑制剂量）值>20（检测下限（LLOD））或MPI介于10%-50%之间。 所有HIV阳性样本的中和抗体ID50/ID80通过不同的检测方法——VSV假病毒中和试验进行测定。 阳性判定基于整个滴定过程（起始稀释度为1:20）中是否观察到任何中和作用，且MPI介于10%-50%之间。 对于阳性但中和作用未达到50%或80%的情况，首先通过Prism估算ID50/ID80滴度。

该表格总结了非洲队列中，按中和抗体检测（NAb）在访视1、2、3、4时，总体以及按地区和合并症分组的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定法在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将是感染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景扣除% CD107A+ NK细胞。 如果背景扣除% CD107A+的值分别≥4.07和≥5.27（感染细胞和转染细胞），则将被视为阳性反应。 截止值分别由SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 % CD107a+ NK细胞是反应幅度。

该表总结了美国队列中，通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）在访问1时，总体及按地区和合并症组别划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应率。

抗体依赖性NK细胞脱颗粒将通过ADCC测定法在1:500稀释度下进行测量。 两个读数将是感染细胞的背景减去% CD107A+ NK细胞和转染细胞的背景减去% CD107A+ NK细胞。 如果感染细胞和转染细胞的背景减去% CD107A+值分别≥4.07和≥5.27，则视为阳性反应。 阈值分别由SARS-CoV-2阴性对照的平均值+2SD确定。 % CD107a+ NK细胞为反应幅度。

该表总结了通过抗体依赖性细胞毒性测定（ADCC）在第1次访视时，针对美国队列整体、按地区和合并症组划分的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应幅度。

采用流式细胞术，通过细胞内细胞因子染色（ICS）检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞应答。 所有标记物将使用Fisher精确阳性检验进行阳性判定。 幅度为表达IFN-γ/IL-2的T细胞百分比。

该表总结了美国队列中，在访视1时通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞应答率，包括整体情况以及按地区和共病组别分层的结果。

使用细胞内细胞因子染色（ICS）通过流式细胞术检测SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应。 对于所有标记物，将使用Fisher精确阳性检验进行阳性判定。 数值为表达IFN-g/IL-2的T细胞百分比。

该表格总结了美国队列中访视1时通过流式细胞术测得的SARS-CoV-2特异性CD4+和CD8+ T细胞反应强度，包括总体情况以及按地区和合并症组别划分的情况。

使用荧光标记的重组Env蛋白（S6P和RBD）结合流式细胞术抗体组合，对所有入组访视（V1）的可用样本进行了SARS-CoV-2特异性B细胞反应和B细胞表型数据的识别与表征。 只有当样本的IgD- B细胞数量等于或大于1000时，该样本才会被纳入分析。

该表格总结了访视1时通过流式细胞术测量的SARS-CoV-2特异性记忆B细胞反应强度，包括总体情况以及按地区和合并症组别划分的美国队列数据。

对参与者在访视1（第0月，基线）及随访访视（第2、4月）的可用样本进行了BAMA检测。 使用Bio-Plex仪器（Bio-Rad）测量了血清中SARS-CoV-2特异性IgA、IgG1、IgG3对SARS-CoV-2抗原的反应（稀释度1:50）。 Bioplex软件提供两种读数：背景扣除的平均荧光强度（MFI），其中背景指板级对照（即每板上运行的空白孔），以及基于标准曲线的浓度值。 若MFI减去空白值≥同型、抗原和稀释度特异性阈值（将由实验室提供），则判定该访视为阳性反应。 MFI减去空白值（或净MFI）用于总结特定时间点的反应强度。

该表总结了美国队列在访视1、2、3时，通过结合抗体多重检测（BAMA IgA鼻腔样本）测定的SARS-CoV-2特异性抗体结合反应强度，包括总体情况以及按地区和入组组别分层的结果。