Caracterizando a imunidade específica do SARS-CoV-2 em indivíduos que se recuperaram do COVID-19

Pessoas não hospitalizadas por COVID-19, sem espectro clínico ou desfechos especificados no grupo 3

• 1A: Pessoas com infecção assintomática, de 18 a 55 anos, inclusive
• 1B: Pessoas com infecção assintomática, idade > 55
• 1C: Pessoas com infecção sintomática (ou seja, COVID-19) de 18 a 55 anos
• 1D: Pessoas com infecção sintomática (ou seja, COVID-19), idade > 55

• Espécimes nasais opcionais
• Coleta de sangue

Pessoas previamente hospitalizadas por COVID-19, sem espectro clínico ou desfechos especificados no grupo 3

• 2A: Pessoas de 18 a 55 anos de idade
• 2B: Pessoas > 55 anos de idade

• Espécimes nasais opcionais
• Coleta de sangue

• Espécimes nasais opcionais
• Coleta de sangue

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de acompanhamento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ o corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o valor em branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e grupo de inscrição.

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras dos participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios do SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ o ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, no geral e por região e grupo de inscrição

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de acompanhamento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos os valores em branco forem ≥ ao limite específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquida) são usadas para resumir a magnitude num dado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específica para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, no geral e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4).
As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad).
O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão.
As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos o branco forem ≥ ao ponto de corte específico do isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório).
Os MFI menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de acompanhamento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ o ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, no geral e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana.

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2). As respostas séricas específicas de IgA, IgG1, IgG3 para SARS-CoV-2 (diluição 1:50) aos antigénios do SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFI menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos do SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana.

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização de pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização em toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas, mas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, no geral e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana (apenas EUA e Peru)

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização de pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas, mas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana (apenas EUA e Peru)

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O IPM (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LID) do ensaio) ou o IPM está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização de pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização durante toda a titulação (diluição inicial 1:20) com IPM entre 10%-50%. Para as chamadas positivas, mas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos do SARS-CoV-2 por ensaio de anticorpo neutralizante (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte África.

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras de HIV negativas. O MPI (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras de HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização por pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização em toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de inscrição na coorte de África.

A degranulação de células NK dependente de anticorpos será medida através do ensaio ADCC numa diluição de 1:500. Dois resultados serão registados: a percentagem de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células infetadas e a percentagem de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da percentagem de CD107A+ subtraída do fundo forem ≥ 4,07 e ≥ 5,27 para as células infetadas e transfectadas, respetivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2SD, respetivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a taxa de resposta de ligação de anticorpos específicos para SARS-CoV-2 através do ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e grupo de inscrição na coorte americana (apenas EUA e Peru).

A desgranulação das células NK dependente de anticorpos será medida através do ensaio ADCC a uma diluição de 1:500. Dois resultados serão as % de células NK CD107A+ subtraídas do fundo para as células infetadas e as % de células NK CD107A+ subtraídas do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da % CD107A+ subtraída do fundo forem ≥ 4,07 e ≥5,27 para as células infetadas e transfectadas, respectivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respectivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) Visita 1, no geral e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana.

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas específicas das células T CD4+ e CD8+ para o SARS-CoV-2 usando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As determinações positivas serão feitas usando o teste de positividade exato de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-g/IL-2.

A tabela resume a taxa de resposta das células T CD4+ e CD8+ específicas para o SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana (apenas EUA e Peru)

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas das células T CD4+ e CD8+ específicas para o SARS-CoV-2, utilizando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As determinações positivas serão feitas utilizando o teste exato de positividade de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-γ/IL-2.

A tabela resume a magnitude da resposta das células T CD4+ e CD8+ específicas para o SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e grupo de inscrição entre os respondedores positivos da Coorte da América (EUA e Peru)

As respostas das células B específicas para o SARS-CoV-2 e os dados fenotípicos das células B foram identificados e caracterizados utilizando proteínas Env recombinantes marcadas com fluorescência (S6P e RBD) em combinação com um painel de anticorpos de citometria de fluxo em todas as amostras disponíveis da visita de inscrição (V1). Não existe uma chamada de positividade para os dados fenotípicos das células B. A magnitude é a frequência do subconjunto de células B.

A tabela resume a Magnitude da Resposta das Células B de Memória Específicas para o SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e grupo de inscrição na Coorte Americana (apenas EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios do SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo de nível de placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos os valores em branco forem ≥ o ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 entre a Coorte Americana (EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras dos participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e para amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) a antigénios de SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ o limite específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específica para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, no geral e por região e gravidade da COVID-19 na Coorte Americana (EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios do SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo a nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos os valores em branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 entre a Coorte Americana (EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo a nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ do que o ponto de corte específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num dado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de ligação de anticorpos (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 na coorte americana (EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis em visitas de acompanhamento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) a antigénios do SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos branco forem ≥ ao ponto de corte específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 entre a Coorte da América (EUA e Peru)

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O IPM (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o IPM está entre 10%-50%. O ID50/ID80 do anticorpo neutralizante de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização do pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com IPM entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e gravidade da COVID-19

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras de HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras de HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se em se é observada ou não qualquer neutralização em toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas mas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 por ensaio de anticorpo neutralizante (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 na Coorte Americana

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização durante toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas, mas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, no geral e por região e gravidade da COVID-19.

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras negativas para o VIH. O MPI (inibição percentual máxima) também é medido. As determinações de positividade são um valor de ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras positivas para o VIH é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização por pseudovírus VSV. As determinações de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as determinações positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específica para o SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 na Coorte Africana

A desgranulação das células NK dependente de anticorpos será medida através do ensaio ADCC numa diluição de 1:500. Dois resultados serão as % de células NK CD107A+ subtraídas do fundo para as células infetadas e as % de células NK CD107A+ subtraídas do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da % CD107A+ subtraída do fundo forem ≥ 4,07 e ≥ 5,27 para as células infetadas e transfectadas, respectivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respectivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a taxa de resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 entre a coorte americana (EUA e Peru)

A desgranulação de células NK dependente de anticorpos será medida utilizando o ensaio ADCC numa diluição de 1:500. Duas leituras serão o % de células NK CD107A+ subtraído do fundo para as células infetadas e o % de células NK CD107A+ subtraído do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores do % CD107A+ subtraído do fundo forem ≥ 4,07 e ≥5,27 para as células infetadas e transfectadas, respetivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respetivamente, a partir dos controlos negativos para SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 na coorte americana (EUA e Peru)

A citometria de fluxo foi usada para examinar as respostas específicas de células T CD4+ e CD8+ ao SARS-CoV-2 usando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As chamadas positivas serão feitas usando o teste exato de positividade de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-g/IL-2.

A tabela resumiu a taxa de resposta de células T CD4+ e CD8+ específicas ao SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, no geral e por região e gravidade da COVID-19 na coorte americana (EUA e Peru)

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas específicas de células T CD4+ e CD8+ ao SARS-CoV-2 através de uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As determinações positivas serão feitas utilizando o teste exato de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-γ/IL-2.

A tabela resume a magnitude da resposta de células T CD4+ e CD8+ específicas ao SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, no geral e por região e gravidade da COVID-19 na coorte americana.

A resposta específica das células B ao SARS-CoV-2 e os dados fenotípicos das células B foram identificados e caracterizados utilizando proteínas Env recombinantes marcadas fluorescentemente (S6P e RBD) em combinação com um painel de anticorpos de citometria de fluxo em todas as amostras disponíveis da visita de inscrição (V1). A amostra será incluída na análise apenas se o número de células B IgD- for igual ou superior a 1000 para essa amostra.

A tabela resume a Magnitude da Resposta das Células B de Memória Específicas para SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e gravidade da COVID-19 entre a Coorte Americana (EUA e Peru)

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis em visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos o branco forem ≥ o ponto de corte específico do isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de ligação de anticorpos (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana.

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos o branco forem ≥ que o ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquida) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específica para SARS-CoV-2 por BAMA IgG1 na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e dias desde o grupo de diagnóstico de SARS-CoV-2 na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo de nível de placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos o branco forem ≥ o ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos específica para SARS-CoV-2 pelo ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, no geral e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 (diluição 1:50) a antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde fundo se refere a um controlo de nível de placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num dado ponto temporal.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no Grupo da Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de ligação de anticorpos (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos o branco forem ≥ o corte específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específica para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O IPM (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o IPM está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização de pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com IPM entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio de anticorpo neutralizante (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização por pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização durante toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no Grupo da Coorte Americana.

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (inibição percentual máxima) também é medido. As determinações de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O ID50/ID80 de anticorpos neutralizantes de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As determinações de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as determinações positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no Grupo da Coorte de África

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Africana.

A desgranulação de células NK dependente de anticorpos será medida através do ensaio ADCC numa diluição de 1:500. Dois resultados serão considerados: a percentagem de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células infetadas e a percentagem de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da percentagem subtraída do fundo de CD107A+ forem ≥ 4,07 e ≥5,27 para as células infetadas e transfectadas, respetivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respetivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a taxa de resposta de ligação de anticorpos específicos para SARS-CoV-2 através do ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da coorte americana (EUA e Peru).

A desgranulação das células NK dependente de anticorpos será medida utilizando o ensaio ADCC a uma diluição de 1:500. Duas leituras serão a % de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células infetadas e a % de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da % de CD107A+ subtraída do fundo forem ≥ 4,07 e ≥5,27 para as células infetadas e transfectadas, respetivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respetivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específica para SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da coorte americana.

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas específicas de células T CD4+ e CD8+ para o SARS-CoV-2 através de uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As chamadas positivas serão feitas usando o teste de positividade exato de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-γ/IL-2.

A tabela resume a taxa de resposta de células T CD4+ e CD8+ específicas para o SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da Coorte Americana.

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2 usando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As chamadas positivas serão feitas usando o teste exato de positividade de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-g/IL-2.

A tabela resume a magnitude da resposta das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, no geral e por região e dias desde o diagnóstico de SARS-CoV-2 no grupo da coorte americana.

As respostas específicas das células B ao SARS-CoV-2 e os dados fenotípicos das células B foram identificados e caracterizados utilizando proteínas Env recombinantes marcadas com fluorescência (S6P e RBD) em combinação com um painel de anticorpos de citometria de fluxo em todas as amostras disponíveis da visita de inscrição (V1). A amostra será incluída na análise apenas se o número de células B IgD- for igual ou superior a 1000 para essa amostra.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta das Células B de Memória Específicas ao SARS-CoV-2 (Células B) por Região e Dias Desde o Diagnóstico de SARS-CoV-2 no Grupo da Coorte Americana.

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). As MFIs menos o branco (ou MFI líquida) são usadas para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos o branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG1) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de acompanhamento (Mês 2, 4). As respostas séricas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Serão consideradas respostas positivas em cada visita se os valores MFI menos o branco forem ≥ o corte específico do isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras dos participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. Respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos os valores em branco forem ≥ ao ponto de corte específico para isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). MFIs menos branco (ou MFI líquido) são usados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgG3) na Visita 1, 2, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras de participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos o branco forem ≥ o limite específico de isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, no geral e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras dos participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), em que o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores MFI menos o branco forem ≥ ao ponto de corte específico para o isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). Os MFIs menos o branco (ou MFI líquido) são utilizados para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (BAMA IgA) na Visita 1, 2, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As determinações de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) superior a 20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As determinações de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização em toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as determinações positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte da América

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O IPM (percentual máximo de inibição) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) maior que 20 (o limite inferior de deteção (LID) do ensaio) ou o IPM está entre 10%-50%. A ID50/ID80 do anticorpo neutralizante de todas as amostras HIV positivas é medida por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização com pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização durante toda a titulação (diluição inicial 1:20) com IPM entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpo neutralizante (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de comorbidade na Coorte Americana.

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (inibição percentual máxima) também é medido. As chamadas de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O ID50/ID80 do anticorpo neutralizante de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização por pseudovírus VSV. As chamadas de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as chamadas positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a Taxa de Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpo neutralizante (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte de África

Os anticorpos neutralizantes contra os coronavírus SARS são medidos em células 293T/ACE2 para todas as amostras HIV negativas. O MPI (percentagem máxima de inibição) também é medido. As determinações de positividade são um valor ID50/ID80 (dose inibitória de 50% e 80%) >20 (o limite inferior de deteção (LLOD) do ensaio) ou o MPI está entre 10%-50%. O anticorpo neutralizante ID50/ID80 de todas as amostras HIV positivas é medido por um ensaio diferente, o ensaio de neutralização de pseudovírus VSV. As determinações de positividade baseiam-se na observação ou não de qualquer neutralização ao longo de toda a titulação (diluição inicial 1:20) com MPI entre 10%-50%. Para as determinações positivas em que a neutralização não atinge 50% ou 80%, o título ID50/ID80 é primeiro estimado pelo Prism.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de anticorpos neutralizantes (NAb) na Visita 1, 2, 3, 4, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na coorte de África.

A desgranulação de células NK dependente de anticorpos será medida usando o ensaio ADCC numa diluição de 1:500. Duas leituras serão a % subtraída do fundo de células NK CD107A+ para as células infetadas e a % subtraída do fundo de células NK CD107A+ para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da % subtraída do fundo de CD107A+ forem ≥ 4,07 e ≥5,27 para as células infetadas e transfectadas, respetivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respetivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a taxa de resposta de ligação de anticorpos específicos do SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na coorte americana.

A degranulação de células NK dependente de anticorpos será medida utilizando o ensaio ADCC a uma diluição de 1:500. Dois resultados serão a % de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células infectadas e a % de células NK CD107A+ subtraída do fundo para as células transfectadas. As respostas positivas serão consideradas se os valores da % de CD107A+ subtraída do fundo forem ≥ 4,07 e ≥ 5,27 para as células infectadas e transfectadas, respectivamente. Os pontos de corte são determinados pela média+2DP, respectivamente, a partir dos controlos negativos de SARS-CoV-2. A percentagem de células NK CD107a+ foi a magnitude da resposta.

A tabela resume a magnitude da resposta de ligação de anticorpos específicos para SARS-CoV-2 pelo ensaio de citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC) na Visita 1, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na coorte da América.

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2 utilizando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As chamadas positivas serão feitas utilizando o teste de positividade exata de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-γ/IL-2.

A tabela resume a taxa de resposta das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na coorte americana

A citometria de fluxo foi utilizada para examinar as respostas das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2, utilizando uma coloração intracelular de citocinas (ICS). As deteções positivas serão realizadas utilizando o teste exato de positividade de Fisher para todos os marcadores. As magnitudes são % de células T que expressam IFN-γ/IL-2.

A tabela resume a magnitude da resposta das células T CD4+ e CD8+ específicas do SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e Grupo de Comorbilidade na coorte americana.

As respostas das células B específicas para o SARS-CoV-2 e os dados fenotípicos das células B foram identificados e caracterizados utilizando proteínas Env recombinantes marcadas com fluorescência (S6P e RBD) em combinação com um painel de anticorpos de citometria de fluxo em todas as amostras disponíveis da visita de inscrição (V1). A amostra será incluída na análise apenas se o número de células B IgD- for igual ou superior a 1000 para essa amostra.

A tabela resume a Magnitude da Resposta das Células B de Memória Específicas para o SARS-CoV-2 por citometria de fluxo na Visita 1, globalmente e por região e grupo de comorbilidade na Coorte Americana

Os ensaios BAMA foram realizados para amostras dos participantes na Visita 1 (Mês 0, linha de base) e amostras disponíveis nas visitas de seguimento (Mês 2, 4). As respostas de IgA, IgG1, IgG3 específicas para SARS-CoV-2 no soro (diluição 1:50) aos antigénios SARS-CoV-2 foram medidas num instrumento Bio-Plex (Bio-Rad). O software Bioplex fornece 2 leituras: uma intensidade média de fluorescência subtraída do fundo (MFI), onde o fundo se refere a um controlo ao nível da placa (ou seja, um poço em branco executado em cada placa), e uma concentração baseada numa curva padrão. As respostas positivas em cada visita serão consideradas se os valores de MFI menos o branco forem ≥ ao ponto de corte específico do isotipo, antigénio e diluição (será fornecido pelo laboratório). As MFIs menos o branco (ou MFI líquida) são utilizadas para resumir a magnitude num determinado momento.

A tabela resumiu a Magnitude da Resposta de Ligação de Anticorpos Específicos para SARS-CoV-2 por ensaio multiplex de anticorpos de ligação (amostra nasal BAMA IgA) na Visita 1, 2, 3, globalmente e por região e grupo de inscrição na América Cohort.