COVID-19에서 회복된 개인의 SARS-CoV-2 특정 면역 특성화

COVID-19로 입원하지 않고 그룹 3에 명시된 임상 스펙트럼 또는 결과가 없는 사람

• 1A: 18세에서 55세까지의 무증상 감염자
• 1B: 무증상 감염자, 연령 > 55
• 1C: 증상이 있는 감염(즉, COVID-19)이 있는 18세에서 55세 사이의 사람
• 1D: 증상이 있는 감염(즉, COVID-19)이 있는 사람, 연령 > 55

• 비강 표본(들)
• 채혈

이전에 COVID-19로 입원한 적이 있으며 임상 스펙트럼 또는 그룹 3에 지정된 결과가 없는 사람

• 2A: 18세에서 55세 사이의 사람
• 2B: 55세 이상의 사람

• 비강 표본(들)
• 채혈

• 비강 표본(들)
• 채혈

BAMA 분석법은 방문 1(0개월, 기준선) 시 참가자로부터 채취한 샘플과 추적 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. 혈청 SARS-CoV-2 특이 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 SARS-CoV-2 항원에 대해 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 측정하였습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)로, 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 의미하며, 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시 양성 반응은 MFI에서 빈 값(blank)을 뺀 값이 동형 항원(isotype), 항원(antigen), 희석 특이적 컷오프(연구실에서 제공) ≥인 경우로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 방문 1, 2, 3에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG1)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 전체적으로, 그리고 지역별 및 등록 그룹별로 요약하였습니다.

참가자들의 방문 1(0개월, 기준선)과 추적 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석이 수행되었습니다. SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)은 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 측정되었습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)(배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문에서 MFI에서 빈 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 빈 값을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 주어진 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 방문 1, 2, 3에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG1)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 크기를 전반적으로 그리고 지역 및 등록 그룹별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 참가자 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 배경을 뺀 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도 두 가지 판독값을 제공합니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 의미합니다. 각 방문에서 MFI에서 빈 값을 뺀 값이 아이소타입, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공) 이상인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점의 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 아메리카 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역별, 등록 그룹별 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약합니다.

BAMA 분석법은 방문 1(0개월, 기준선) 시 참가자 샘플과 추적 방문(2개월, 4개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 SARS-CoV-2 항원에 대해 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)로 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI, 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 공백 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 임계값(실험실에서 제공될 예정) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 공백을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 규모를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 방문 1, 2에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 규모를 전체적으로, 지역별 및 등록 그룹별로 미국 코호트에서 요약했습니다.

참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 후속 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석을 수행했습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 결과를 제공합니다: 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 배경으로 하는 배경 제거 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 빈 값(공백값)을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공) 이상인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 빈 값(공백값)을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 아메리카 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역별, 등록 그룹별 결합 항체 멀티플렉스 분석(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약했습니다.

BAMA 분석법은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행되는 공백 웰)을 배경으로 하는 배경 제거 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 ≥ 아이소타입, 항원 및 희석 특이적 절단값(연구실에서 제공됨)인 경우 양성 반응으로 판정합니다. 공백을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 규모를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역별, 등록 그룹별로 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 규모를 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 293T/ACE2 세포에서 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체를 측정합니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 VSV 가상바이러스 중화 검사라는 다른 검사법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20) 과정에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 미국 코호트(미국 및 페루만)에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, 등록 그룹별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 농도) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 VSV 의사바이러스 중화 검사라는 다른 검사법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 MPI가 10%-50% 사이로 중화가 관찰되는지 여부를 기준으로 합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 미국 코호트(미국 및 페루만 해당)에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체, 지역 및 등록 그룹별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 293T/ACE2 세포에서 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체를 측정합니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 농도) 값이 >20(검사의 검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%~50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체, 지역 및 등록 그룹별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 농도) 값이 >20(검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 다른 분석법인 VSV 의사바이러스 중화 분석법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, 등록 그룹별 중화 항체 분석법(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약했습니다.

항체 의존적 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포와 형질감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질감염된 세포에 대해 각각 배경 제거된 % CD107A+ 값이 ≥4.07 및 ≥5.27일 때 호출됩니다. 컷오프는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD에 의해 결정되었습니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 크기였습니다.

이 표는 방문 1에서 항체 의존적 세포독성 분석(ADCC)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전반적으로, 지역별 및 등록 그룹별로 아메리카 코호트(미국 및 페루만)에서 요약했습니다.

항체 의존적 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경을 뺀 % CD107A+ NK 세포와 형질전환된 세포에 대한 배경을 뺀 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질전환된 세포에 대해 각각 배경을 뺀 % CD107A+ 값이 ≥ 4.07 및 ≥5.27인 경우로 판정됩니다. 컷오프는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD로 결정됩니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 크기였습니다.

이 표는 미국 코호트에서 ADCC 분석을 통한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 크기를 방문 1, 전체 및 지역별, 등록 그룹별로 요약한 것입니다.

유세포 분석을 이용하여 세포내 사이토카인 염색(ICS)을 통해 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확 검정을 사용하여 양성 판정을 할 것입니다. 크기는 IFN-g/IL-2를 발현하는 T 세포의 백분율입니다.

이 표는 방문 1에서 유세포 분석으로 측정한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응률을 전체적으로, 그리고 지역 및 등록 그룹별로 미국 코호트(미국 및 페루만 해당)에서 요약한 것입니다.

세포 내 사이토카인 염색(ICS)을 사용하여 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 검사하기 위해 유세포 분석이 사용되었습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확한 양성 검정을 사용하여 양성 판정을 합니다. 크기는 IFN-γ/IL-2를 발현하는 % T 세포입니다.

이 표는 방문 1에서 유세포 분석을 통해 측정한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응 크기를 아메리카 코호트 양성 반응자(미국 및 페루)를 대상으로 전반적으로, 그리고 지역별 및 등록 그룹별로 요약한 것입니다.

모든 등록 방문(V1)에서 사용 가능한 샘플에 대해 형광 표지 재조합 Env 단백질(S6P 및 RBD)과 유세포 분석 항체 패널을 조합하여 SARS-CoV-2 특이적 B 세포 반응과 B 세포 표현형 데이터를 확인하고 특성을 분석하였습니다. B 세포 표현형 데이터에 대한 양성 판정은 없습니다. 크기는 B 세포 하위 집단 빈도입니다.

이 표는 방문 1에서 유세포 분석을 통한 SARS-CoV-2 특이적 기억 B 세포 반응 크기를 미국 코호트(미국 및 페루만 해당) 전체, 지역별 및 등록 그룹별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 시점과 후속 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 배경 차감 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도, 두 가지 판독값을 제공합니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 공백 웰)을 의미합니다. 각 방문 시점의 양성 반응은 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우로 판정됩니다. 공백을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트(미국 및 페루) 내 방문 1, 2, 3 시점에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG1)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체적으로, 지역별 및 COVID-19 중증도별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 시점 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시점에서 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(1:50 희석)을 SARS-CoV-2 항원에 대해 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)로 측정하였습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 결과를 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)로, 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 공백 웰)을 의미하며, 표준 곡선에 기반한 농도입니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정합니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 주어진 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 방문 1, 2, 3에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG1)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 강도를 전반적으로, 지역별 및 COVID-19 중증도별로 미국 코호트(미국 및 페루)에서 요약하였습니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 차감된 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함) 및 표준 곡선을 기반으로 한 농도. 각 방문 시 MFI에서 빈 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 미국 코호트(미국 및 페루)에서 방문 1, 2, 전체 및 지역 및 COVID-19 중증도별 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약했습니다.

참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 후속 방문(2개월, 4개월)에서 수집된 샘플에 대해 BAMA 분석을 수행했습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이 IgA, IgG1, IgG3 반응(1:50 희석)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)(배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문에서 MFI에서 빈 값(blank)을 뺀 값이 동형(isotype), 항원 및 희석 특이적 컷오프(실험실에서 제공됨)보다 크거나 같은 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 빈 값(blank)을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 아메리카 코호트(미국 및 페루)에서 방문 1, 2, 전체, 지역별 및 COVID-19 중증도별 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약한 것입니다.

참가자들의 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석을 수행하였습니다. SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)은 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 측정되었습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경을 뺀 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 공백 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 공백을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 방문 1, 2에서 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 미국 코호트(미국 및 페루)에서 전반적으로, 지역별 및 COVID-19 중증도별로 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 293T/ACE2 세포에서 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체가 측정됩니다. MPI(최대 억제 백분율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD)) 또는 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별 및 COVID-19 중증도별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율) 또한 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 VSV 가성 바이러스 중화 검사라는 다른 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%~50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, COVID-19 중증도별로 중화 항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사법의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 다른 검사법인 VSV 의사바이러스 중화 검사법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%~50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, COVID-19 중증도별 중화 항체 검사법(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 293T/ACE2 세포에서 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체가 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 유사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20) 과정에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, COVID-19 중증도별로 아프리카 코호트에서 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 크기를 요약합니다.

항체 의존성 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포와 형질감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질감염된 세포에 대해 각각 배경 제거된 % CD107A+ 값이 ≥ 4.07 및 ≥ 5.27인 경우로 판정됩니다. 기준값은 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군에서 평균+2SD로 결정되었습니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

이 표는 방문 1에서 항체 의존성 세포독성 분석(ADCC)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체적으로, 그리고 지역별 및 코로나19 중증도별로 미국 코호트(미국 및 페루)에서 요약한 것입니다.

항체 의존적 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포와 형질 도입된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포입니다. 감염된 세포와 형질 도입된 세포에 대해 각각 배경 제거된 % CD107A+ 값이 ≥ 4.07 및 ≥ 5.27인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 기준치는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD로 결정됩니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

이 표는 항체 의존적 세포독성 분석(ADCC)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 강도를 요약한 것으로, 방문 1, 전체 및 지역별, COVID-19 중증도별로 아메리카 코호트(미국과 페루)에서 측정된 결과입니다.

세포 내 사이토카인 염색법(ICS)을 사용하여 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T세포 반응을 조사하기 위해 유세포 분석을 사용하였습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확한 양성 검정을 사용하여 양성 판정을 할 것입니다. 크기는 IFN-γ/IL-2를 발현하는 % T세포로 나타냅니다.

이 표는 방문 1에서 유세포 분석을 통한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T세포 반응률을 전체적으로, 지역별로, 그리고 미국 코호트(미국과 페루) 내 COVID-19 중증도별로 요약한 것입니다.

세포 내 사이토카인 염색법(ICS)을 사용하여 유세포 분석을 통해 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확 검정을 사용하여 양성 판정을 내릴 것입니다. 크기는 IFN-γ/IL-2를 발현하는 T 세포의 백분율입니다.

이 표는 방문 1 시점에서 유세포 분석을 통해 측정한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응 크기를 전체적으로, 지역별로, 그리고 미국 코호트 내 COVID-19 중증도에 따라 요약한 것입니다.

SARS-CoV-2 특이적 B 세포 반응 및 B 세포 표현형 데이터는 모든 참가 시점(V1)에서 이용 가능한 샘플을 대상으로 형광 표지된 재조합 Env 단백질(S6P 및 RBD)과 유세포 분석 항체 패널을 조합하여 확인 및 특성화되었습니다. 해당 샘플의 IgD- B 세포 수가 1000 이상일 경우에만 분석에 포함됩니다.

이 표는 방문 1 시점에서 유세포 분석을 통해 측정한 SARS-CoV-2 특이적 기억 B 세포 반응 강도를 미국 코호트(미국 및 페루)의 전체, 지역별, COVID-19 중증도별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선) 참가자 샘플과 후속 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 장비(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 측정값을 제공합니다: 배경 제거 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시 MFI에서 빈 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정합니다. 빈 값을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트 내 방문 1, 2, 3, 전체 및 지역별, SARS-CoV-2 진단 후 일수 그룹별 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG1)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약했습니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선)의 참가자 샘플과 추적 방문(2개월, 4개월)의 유효한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 장치(Bio-Rad)에서 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 공백 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(연구실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 공백을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 아메리카 코호트에서 방문 1, 2, 3에서 BAMA IgG1에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 전체적으로, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 이후 일수 그룹별로 요약했습니다.

참가자로부터 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석이 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경을 뺀 평균 형광 강도(MFI)(배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함) 및 표준 곡선에 기반한 농도. MFI에서 빈 값의 차가 ≥ 동형, 항원 및 희석 특이적 컷오프(실험실에서 제공됨)인 경우 각 방문 시 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 주어진 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역별, SARS-CoV-2 진단 후 일수별 그룹에 따른 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG3)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 시점 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시점에서 수집된 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 장비(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(1:50 희석)을 측정하였습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 측정값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 의미합니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 빈 값(blank)을 뺀 값이 동형 항원(isotype), 항원 및 희석 특이적 기준치(연구실에서 제공 예정) 이상인 경우 양성 반응으로 판정합니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2 시점에서 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 강도를 전체, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 경과 일수 그룹별로 요약한 내용입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행되는 빈 웰)을 의미합니다. 각 방문 시 MFI에서 빈 값(blank)을 뺀 값이 아이소타입, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) 이상인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 아메리카 코호트에서 방문 1, 2 시점의 결합 항체 다중 분석법(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 일수 그룹별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선) 참가자 샘플 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정하였습니다. Bioplex 소프트웨어는 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도, 이렇게 2가지 판독값을 제공합니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 의미합니다. 각 방문 시 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특정 절단값(연구실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트 내 방문 1, 2 시점에서, 전체적으로 그리고 지역 및 SARS-CoV-2 진단 후 일수별 그룹에 따라 결합 항체 다중 분석(BAMA IgA)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 요약하였습니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD)) 또는 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 MPI가 10%~50% 사이로 중화가 관찰되는지 여부에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, 그리고 SARS-CoV-2 진단 후 일수 그룹별 중화 항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약했습니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역별, SARS-CoV-2 진단 후 일수 그룹별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 크기를 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 VSV 의사바이러스 중화 분석이라는 다른 분석법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 Prism으로 먼저 추정됩니다.

이 표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 일수별 그룹에 따른 중화 항체 분석(NAb)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%~50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 일수 그룹별 중화 항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약한 것입니다.

항체 의존적 NK 세포 탈과립은 1:500 희석으로 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포와 형질전환된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질전환된 세포에 대해 각각 배경 제거된 % CD107A+ 값이 ≥ 4.07 및 ≥5.27인 경우로 판정됩니다. 컷오프는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD로 결정되었습니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

이 표는 방문 1에서 항체 의존적 세포독성 분석(ADCC)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전반적으로, 지역별로, SARS-CoV-2 진단 후 일수별로 미국 코호트(미국 및 페루) 중에서 요약한 것입니다.

항체 의존적 NK 세포 탈과립은 1:500 희석으로 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경을 뺀 % CD107A+ NK 세포와 형질감염된 세포에 대한 배경을 뺀 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질감염된 세포에 대해 각각 배경을 뺀 % CD107A+ 값이 ≥4.07 및 ≥5.27인 경우로 판정됩니다. 컷오프는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군으로부터 평균+2SD로 결정되었습니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

이 표는 미국 코호트에서 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 강도를 항체 의존적 세포독성 분석(ADCC) 방문 1 기준으로 전체, 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 일수별 그룹으로 요약한 것입니다.

세포 내 사이토카인 염색(ICS)을 사용하여 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사하기 위해 유세포 분석을 사용했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확 검정을 사용하여 양성 판정을 수행할 것입니다. 크기는 IFN-g/IL-2를 발현하는 T 세포의 %입니다.

이 표는 아메리카 코호트에서 방문 1 시점의 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응률을 유세포 분석으로 요약한 것으로, 전체적으로 그리고 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 이후 일수별 그룹으로 구분하여 나타냅니다.

세포 내 사이토카인 염색법(ICS)을 사용하여 유세포 분석을 통해 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확 검정을 사용하여 양성 판정을 합니다. 크기는 IFN-γ/IL-2를 발현하는 T 세포의 백분율입니다.

표는 아메리카 코호트에서 방문 1 시점의 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응 크기를 전체적으로, 지역별, 그리고 SARS-CoV-2 진단 후 경과 일수별로 요약한 것입니다.

등록 방문(V1) 시 수집된 모든 샘플을 대상으로 형광 표지 재조합 Env 단백질(S6P 및 RBD)과 유세포 분석 항체 패널을 조합하여 SARS-CoV-2 특이적 B 세포 반응 및 B 세포 표현형 데이터를 확인하고 특성을 분석했습니다. 해당 샘플의 IgD- B 세포 수가 1000 이상일 경우에만 분석에 포함됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 지역별 및 SARS-CoV-2 진단 후 경과 일수별 SARS-CoV-2 특이적 기억 B 세포 반응 강도(B 세포)를 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선)과 추적 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(1:50 희석)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 결과를 제공합니다: 배경을 뺀 평균 형광 강도(MFI)(배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함)와 표준 곡선에 기반한 농도입니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 빈 값(blank)을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 컷오프(실험실에서 제공됨)보다 크거나 같으면 양성 반응으로 판정됩니다. 빈 값을 뺀 MFI(또는 순 MFI)는 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3 시점에서 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG1)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체적으로, 그리고 지역 및 동반 질환군별로 요약한 것입니다.

참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 및 추적 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석이 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 배경이 차감된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도, 이렇게 두 가지 결과를 제공합니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 빈 웰)을 의미합니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 아이소타입, 항원 및 희석 특이적 컷오프(연구실에서 제공) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3 시점에 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG1)을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 전체적으로, 그리고 지역 및 동반 질환군별로 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선) 시점의 참가자 샘플과 후속 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행되는 공백 웰)을 의미합니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) 이상인 경우 양성 반응으로 판정합니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2 시점의 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체적으로, 지역별 및 동반 질환군별로 요약했습니다.

참가자의 방문 1(월 0, 기준선) 및 추적 방문(월 2, 4)에서 이용 가능한 샘플에 대해 BAMA 분석을 수행했습니다. SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)은 Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 측정되었습니다. Bioplex 소프트웨어는 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도, 이 두 가지 판독값을 제공합니다. 여기서 배경은 플레이트 수준 대조군(즉, 각 플레이트에서 실행된 공백 웰)을 의미합니다. 각 방문에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(연구실에서 제공됨) 이상인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역 및 동반 질환군별 결합 항체 다중 분석(BAMA IgG3)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 요약합니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 시점과 후속 방문 시점(2개월, 4개월)에서 사용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 판독값을 제공합니다: 배경을 뺀 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 공백 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 아이소타입, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) 이상일 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 전체 및 지역 및 동반 질환 그룹별로 결합 항체 다중 분석(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약한 것입니다.

BAMA 분석은 참가자의 방문 1(0개월, 기준선) 시점 샘플과 후속 방문(2개월, 4개월) 시점의 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)를 사용하여 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 두 가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI)(여기서 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 빈 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시점에서 MFI에서 빈 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 빈 값을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 반응 강도를 요약하는 데 사용됩니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1, 2 시점, 전체 및 지역 및 동반 질환 그룹별 결합 항체 멀티플렉스 분석(BAMA IgA)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제 백분율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 하한 검출 한계(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역 및 동반 질환 그룹별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응률을 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화 항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제율) 또한 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 최저 검출 한계(LLOD)) 또는 MPI가 10%~50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화 항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%~50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

이 표는 미국 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역 및 동반질환 그룹별 중화 항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약합니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체는 293T/ACE2 세포에서 측정됩니다. MPI(최대 억제 백분율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 VSV 의사바이러스 중화 검사라는 다른 방법으로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)에서 MPI가 10%-50% 사이일 때 중화가 관찰되는지 여부에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 Prism으로 먼저 추정됩니다.

이 표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역 및 동반질환군별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 요약한 것입니다.

모든 HIV 음성 샘플에 대해 293T/ACE2 세포에서 SARS 코로나바이러스에 대한 중화항체를 측정합니다. MPI(최대 억제율)도 측정됩니다. 양성 판정은 ID50/ID80(50% 및 80% 억제 용량) 값이 >20(검사의 검출 하한(LLOD))이거나 MPI가 10%-50% 사이인 경우입니다. 모든 HIV 양성 샘플의 중화항체 ID50/ID80은 다른 검사인 VSV 의사바이러스 중화 검사로 측정됩니다. 양성 판정은 전체 희석(시작 희석 1:20)을 통해 중화가 관찰되는지 여부와 MPI가 10%-50% 사이인지에 기반합니다. 양성 판정이지만 중화가 50% 또는 80%에 도달하지 않는 경우, ID50/ID80 역가는 먼저 Prism으로 추정됩니다.

표는 아프리카 코호트에서 방문 1, 2, 3, 4, 전체 및 지역 및 동반 질환군별 중화항체 검사(NAb)에 의한 SARS-CoV-2 특이 항체 결합 반응 강도를 요약합니다.

항체 의존성 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 판독값은 감염된 세포에 대한 배경 차감 % CD107A+ NK 세포와 형질주입된 세포에 대한 배경 차감 % CD107A+ NK 세포입니다. 감염된 세포와 형질주입된 세포에 대해 각각 배경 차감 % CD107A+ 값이 ≥4.07 및 ≥5.27인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. 절단값은 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD로 결정됩니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

표는 방문 1에서 항체 의존성 세포독성 분석(ADCC)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응률을 전체적으로, 지역별 및 동반질환군별로 미국 코호트에서 요약한 것입니다.

항체 의존성 NK 세포 탈과립은 1:500 희석에서 ADCC 분석을 사용하여 측정됩니다. 두 가지 측정치는 감염된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포와 형질 도입된 세포에 대한 배경 제거된 % CD107A+ NK 세포입니다. 양성 반응은 감염된 세포와 형질 도입된 세포에 대해 각각 배경 제거된 % CD107A+ 값이 ≥ 4.07 및 ≥5.27일 때로 판정됩니다. 컷오프는 각각 SARS-CoV-2 음성 대조군의 평균+2SD로 결정됩니다. % CD107a+ NK 세포는 반응 강도였습니다.

이 표는 항체 의존성 세포독성 분석(ADCC) 방문 1을 통한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 강도를 미국 코호트 전체 및 지역 및 동반 질환군별로 요약한 것입니다.

세포 내 사이토카인 염색(ICS)을 이용하여 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사하기 위해 유세포 분석을 사용했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확한 양성 테스트를 사용하여 양성 판정을 할 것입니다. 크기는 IFN-g/IL-2를 발현하는 % T 세포입니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1에서 유세포 분석에 의한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응률을 전체적으로, 지역별 및 동반 질환군별로 요약했습니다.

유세포 분석을 사용하여 세포내 사이토카인 염색(ICS)을 통해 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응을 조사했습니다. 모든 마커에 대해 Fisher의 정확 검정을 사용하여 양성 판정을 합니다. 크기는 IFN-g/IL-2를 발현하는 T 세포의 백분율입니다.

표는 미국 코호트에서 방문 1 시점의 유세포 분석을 통한 SARS-CoV-2 특이적 CD4+ 및 CD8+ T 세포 반응 크기를 전체적으로, 그리고 지역 및 동반 질환군별로 요약했습니다.

등록 방문(V1)에서 이용 가능한 모든 샘플에 대해 형광 표지 재조합 Env 단백질(S6P 및 RBD)과 유세포 분석 항체 패널을 결합하여 SARS-CoV-2 특이적 B 세포 반응과 B 세포 표현형 데이터를 확인하고 특성을 규명하였습니다. 해당 샘플의 IgD- B 세포 수가 1000 이상일 때만 분석에 포함됩니다.

이 표는 아메리카 코호트에서 방문 1 시점의 SARS-CoV-2 특이적 기억 B 세포 반응 크기를 유세포 분석으로 요약하였으며, 전체적으로 그리고 지역 및 동반질환군별로 구분하여 제시합니다.

BAMA 분석은 방문 1(0개월, 기준선) 참가자 샘플과 후속 방문(2개월, 4개월)에서 이용 가능한 샘플에 대해 수행되었습니다. Bio-Plex 기기(Bio-Rad)에서 SARS-CoV-2 항원에 대한 혈청 SARS-CoV-2 특이적 IgA, IgG1, IgG3 반응(희석 1:50)을 측정했습니다. Bioplex 소프트웨어는 2가지 판독값을 제공합니다: 배경이 제거된 평균 형광 강도(MFI, 배경은 플레이트 수준 대조군, 즉 각 플레이트에서 실행된 공백 웰을 의미함)와 표준 곡선을 기반으로 한 농도입니다. 각 방문 시 MFI에서 공백 값을 뺀 값이 동형, 항원 및 희석 특이적 절단값(실험실에서 제공됨) ≥인 경우 양성 반응으로 판정됩니다. MFI에서 공백을 뺀 값(또는 순 MFI)은 특정 시점에서의 크기를 요약하는 데 사용됩니다.

이 표는 방문 1, 2, 3에서 결합 항체 다중 분석(BAMA IgA 비강 샘플)에 의한 SARS-CoV-2 특이적 항체 결합 반응 크기를 전체적으로, 지역별 및 등록 그룹별로 미국 코호트 중에서 요약한 것입니다.