Caratterizzazione dell'immunità specifica per SARS-CoV-2 negli individui che si sono ripresi da COVID-19

Persone non ricoverate per COVID-19, senza spettro clinico o esiti specificati nel gruppo 3

• 1A: persone con infezione asintomatica, di età compresa tra 18 e 55 anni inclusi
• 1B: Persone con infezione asintomatica, età > 55 anni
• 1C: persone con infezione sintomatica (ovvero COVID-19) di età compresa tra 18 e 55 anni
• 1D: persone con infezione sintomatica (es. COVID-19), età > 55 anni

• Campione(i) nasale(i) opzionale(i)
• Raccolta del sangue

Persone precedentemente ricoverate per COVID-19, senza spettro clinico o esiti specificati nel gruppo 3

• 2A: Persone di età compresa tra 18 e 55 anni
• 2B: Persone > 55 anni

• Campione(i) nasale(i) opzionale(i)
• Raccolta del sangue

• Campione(i) nasale(i) opzionale(i)
• Raccolta del sangue

I saggi BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili durante le visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 nel siero (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo bianco eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) vengono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume il Tasso di Risposta di Legame degli Anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alla Visita 1, 2, 3, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento.

Il saggio BAMA è stato eseguito per campioni di partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 nel siero (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno dichiarate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ al cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alle Visite 1, 2, 3, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento

Il dosaggio BAMA è stato eseguito per i campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 nel siero (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno i valori del bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento.

La tabella ha riassunto il tasso di risposta di legame dell'anticorpo specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana

I test BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti da partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove per fondo si intende un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) vengono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'Entità della Risposta Legante degli Anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella Coorte Americana

I saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili durante le visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno dichiarate se i valori MFI meno il fondo sono ≥ il cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il fondo (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana

I saggi BAMA sono stati eseguiti per i campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di legame degli anticorpi (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un diverso saggio, il saggio di neutralizzazione del virus pseudotipizzato VSV. Le chiamate di positività si basano sull'osservazione o meno di qualsiasi neutralizzazione durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alle visite 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana (solo USA e Perù)

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati nelle cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sulla presenza o assenza di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alle Visite 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana (solo USA e Perù)

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento dell'analisi) o MPI compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un'analisi diversa, il test di neutralizzazione del virus pseudotipizzato VSV. Le chiamate di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante test degli anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte africana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati nelle cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento dell'analisi) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un'analisi diversa, l'analisi di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante analisi degli anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte africana.

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule infettate e la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della percentuale di CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4.07 e ≥5.27 rispettivamente per le cellule infettate e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente da media+2DS, dai controlli negativi SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ rappresentava le magnitudini di risposta.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) alla Visita 1, complessivo e per regione e gruppo di arruolamento nella Cohorte Americana (solo USA e Perù)

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal background per le cellule infettate e la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal background per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della percentuale di CD107A+ sottratta dal background sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infettate e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente dalla media+2DS, dai controlli negativi SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ rappresentava le magnitudini di risposta.

La tabella riassume la magnitudine della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) Visita 1, complessiva e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana.

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte specifiche delle cellule T CD4+ e CD8+ contro SARS-CoV-2 mediante colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le determinazioni positive verranno effettuate utilizzando il test esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono espresse come % di cellule T che esprimono IFN-γ/IL-2.

La tabella riassume il tasso di risposta specifica delle cellule T CD4+ e CD8+ contro SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivo e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana (solo USA e Perù).

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte specifiche dei linfociti T CD4+ e CD8+ contro il SARS-CoV-2 mediante una colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le determinazioni positive saranno effettuate utilizzando il test di positività esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di linfociti T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume l'entità della risposta specifica dei linfociti T CD4+ e CD8+ contro il SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento tra i rispondenti positivi della coorte americana (USA e Perù)

Le risposte delle cellule B specifiche per SARS-CoV-2 e i dati fenotipici delle cellule B sono stati identificati e caratterizzati utilizzando proteine Env ricombinanti marcate fluorescentemente (S6P e RBD) in combinazione con un pannello di anticorpi per citometria a flusso su tutti i campioni disponibili della visita di arruolamento (V1). Non è prevista una chiamata di positività per i dati fenotipici delle cellule B. La grandezza è la frequenza del sottoinsieme di cellule B.

La tabella riassume l'entità della risposta delle cellule B della memoria specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana (solo USA e Perù)

Il saggio BAMA è stato eseguito sui campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili durante le visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 nel siero (diluizione 1:50) agli antigeni di SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il fondo sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il fondo (o MFI netta) vengono utilizzate per riassumere l'entità in un determinato momento.

La tabella riassume il Tasso di Risposta di Legame degli Anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alla Visita 1, 2, 3, in generale e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù)

Gli saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alle Visite 1, 2, 3, complessivamente e per regione e gravità di COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù).

Gli assay BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto bianco eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù).

Gli assay BAMA sono stati eseguiti su campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI nette) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume il Tasso di Risposta di Legame Anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gravità del COVID-19 nella Cohorte Americana (USA e Perù)

I test BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili nelle visite di follow-up (Mese 2, 4).
Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad).
Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard.
Le risposte positive a ciascuna visita saranno chiamate se i valori MFI meno il vuoto sono ≥ il cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio).
Gli MFI meno il vuoto (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'Entità della Risposta di Legame degli Anticorpi specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessiva e per regione e gravità del COVID-19 tra la Coorte Americana (USA e Perù).

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS sono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi è misurato da un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione dello pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o assenza di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 è prima stimato da Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e gravità del COVID-19.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) maggiore di 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del test) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un test diverso, il test di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sull'osservazione o meno di qualsiasi neutralizzazione durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'ampiezza della risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante test degli anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessiva e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (massima percentuale di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) >20 (il limite inferiore di rilevazione (LLOD) del saggio) oppure l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione dello pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per i campioni positivi in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e gravità del COVID-19

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sul fatto che si osservi o meno una neutralizzazione nell'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive ma dove la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta legante anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessiva e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte africana

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal background per le cellule infettate e la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal background per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della percentuale di CD107A+ sottratta dal background sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infettate e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente da media+2SD, dai controlli negativi SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ era la magnitudine della risposta.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) alla Visita 1, complessivamente e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù).

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno la % di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule infettate e la % di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della % CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infettate e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente dalla media+2SD, dai controlli negativi per SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ era la magnitudine della risposta.

La tabella riassume la magnitudine della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) Visita 1, complessiva e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù).

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte specifiche delle cellule T CD4+ e CD8+ per SARS-CoV-2 utilizzando una colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le valutazioni positive saranno effettuate utilizzando il test esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume il tasso di risposta specifica delle cellule T CD4+ e CD8+ per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivo e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù)

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 utilizzando una colorazione intracellulare di citochine (ICS). Le determinazioni positive saranno effettuate utilizzando il test di positività esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume la magnitudine della risposta delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessiva e per regione e gravità del COVID-19 tra la coorte americana

Le risposte delle cellule B specifiche per SARS-CoV-2 e i dati fenotipici delle cellule B sono stati identificati e caratterizzati utilizzando proteine Env ricombinanti marcate con fluorescenza (S6P e RBD) in combinazione con un pannello di anticorpi per citometria a flusso su tutti i campioni disponibili della visita di arruolamento (V1). Il campione sarà incluso nell'analisi solo se il numero di cellule B IgD- è uguale o superiore a 1000 per quel campione.

La tabella riassume l'entità della risposta delle cellule B della memoria specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e gravità del COVID-19 nella coorte americana (USA e Perù).

I saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche specifiche per SARS-CoV-2 IgA, IgG1, IgG3 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno dichiarate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ rispetto al cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netti) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 tramite saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alle Visite 1, 2, 3, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili nelle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche specifiche per SARS-CoV-2 IgA, IgG1, IgG3 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) vengono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante BAMA IgG1 alla Visita 1, 2, 3, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e su campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella ha riassunto la percentuale di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti sui campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'Entità della Risposta Legante degli Anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex degli anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella Cohorte Americana

Gli saggî BAMA sono stati eseguiti per i campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno chiamate se i valori MFI meno il vuoto sono ≥ del cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il vuoto (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella ha riassunto il Tasso di Risposta di Legame degli Anticorpi specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella Cohorte Americana

I saggi BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 nel siero (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno quelli del fondo sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Le MFI meno il fondo (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del test) oppure l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un test diverso, il test di neutralizzazione dello pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o assenza di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante test degli anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi di SARS-CoV-2 nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) >20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 dell'anticorpo neutralizzante di tutti i campioni HIV positivi viene misurato da un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione dello pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sull'osservazione o meno di qualsiasi neutralizzazione durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato da Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alle Visite 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati nelle cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (massima percentuale di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) maggiore di 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato mediante un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione del pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato da Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte Africa.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del test) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un test diverso, il test di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluzione iniziale 1:20) con MPI tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive ma in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante test di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi di SARS-CoV-2 nella coorte africana.

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione di 1:500. Due letture saranno la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule infette e la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della percentuale di CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infette e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente dalla media+2DS, ottenute dai controlli negativi per SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ rappresentava l'entità della risposta.

La tabella riassume il tasso di risposta legante anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) alla Visita 1, complessivo e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana (USA e Perù).

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due risultati saranno le % di cellule NK CD107A+ sottratte dal fondo per le cellule infette e le % di cellule NK CD107A+ sottratte dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della % CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infette e trasfettate. I valori di cutoff sono determinati rispettivamente dalla media+2DS, ottenuti dai controlli negativi per SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ rappresentava l'entità della risposta.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) alla Visita 1, complessivamente e per regione e giorni dalla diagnosi di SARS-CoV-2 nel gruppo della coorte americana.

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante una colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le determinazioni positive saranno effettuate utilizzando il test esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume il tasso di risposta delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e giorni dal gruppo di diagnosi SARS-CoV-2 nella coorte americana.

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante una colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le determinazioni positive saranno effettuate utilizzando il test esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume la magnitudine della risposta delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e giorni dalla diagnosi di SARS-CoV-2 nel gruppo della coorte americana.

Le risposte delle cellule B specifiche per SARS-CoV-2 e i dati fenotipici delle cellule B sono stati identificati e caratterizzati utilizzando proteine Env ricombinanti marcate con fluorescenza (S6P e RBD) in combinazione con un pannello di anticorpi per citometria a flusso su tutti i campioni disponibili dalla visita di arruolamento (V1). Il campione sarà incluso nell'analisi solo se il numero di cellule B IgD- è uguale o superiore a 1000 per quel campione.

La tabella riassume l'entità della risposta delle cellule B della memoria specifiche per SARS-CoV-2 (Cellule B) per regione e giorni dal gruppo di diagnosi di SARS-CoV-2 nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti per campioni di partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (ovvero, un pozzo vuoto eseguito su ciascuna piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ al cut-off specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netto) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella ha riassunto il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgG1) alle Visite 1, 2, 3, complessivamente e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

I test BAMA sono stati eseguiti per campioni prelevati dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mesi 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove per fondo si intende un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Verranno considerate risposte positive ad ogni visita se i valori MFI meno i valori di fondo sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il fondo (o MFI netto) vengono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgG1) alla Visita 1, 2, 3, in generale e per regione e gruppo di comorbidità all'interno della Cohorte Americana.

Sono stati eseguiti saggi BAMA per i campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni di SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto bianco eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Gli MFI meno il bianco (o MFI netti) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella ha riassunto il tasso di risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di comorbilità nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti per campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni di SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto bianco eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive ad ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ del cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità della risposta in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgG3) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di comorbidità nella Cohorte Americana.

Gli assay BAMA sono stati eseguiti per i campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e per i campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche SARS-CoV-2-specifiche IgA, IgG1, IgG3 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ogni visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume il Tasso di Risposta Legante degli Anticorpi SARS-CoV-2-specifici mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, in generale e per regione e gruppo di comorbidità nella Cohorte Americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni provenienti dai partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4).
Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad).
Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzetto vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard.
Le risposte positive a ciascuna visita saranno considerate se i valori MFI meno il bianco sono ≥ il cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (sarà fornito dal laboratorio).
Gli MFI meno il bianco (o MFI netti) sono utilizzati per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella ha riassunto l'Entità della Risposta di Legame Anticorpale Specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex di anticorpi leganti (BAMA IgA) alla Visita 1, 2, complessivamente e per regione e gruppo di comorbidità nella Cohorte Americana

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati nelle cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) oppure l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e 80%) >20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato mediante un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o meno di neutralizzazione osservata nell'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato da Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessiva e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati nelle cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le determinazioni di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) superiore a 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) o l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'ID50/ID80 degli anticorpi neutralizzanti di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione dello pseudovirus VSV. Le determinazioni di positività si basano sulla presenza o assenza di neutralizzazione osservata nell'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le determinazioni positive in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivo e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte africana.

Gli anticorpi neutralizzanti contro i coronavirus SARS vengono misurati in cellule 293T/ACE2 per tutti i campioni HIV negativi. Viene misurato anche l'MPI (percentuale massima di inibizione). Le chiamate di positività sono un valore ID50/ID80 (dose inibitoria al 50% e all'80%) maggiore di 20 (il limite inferiore di rilevamento (LLOD) del saggio) oppure l'MPI è compreso tra il 10% e il 50%. L'anticorpo neutralizzante ID50/ID80 di tutti i campioni HIV positivi viene misurato con un saggio diverso, il saggio di neutralizzazione con pseudovirus VSV. Le chiamate di positività si basano sull'osservazione o meno di qualsiasi neutralizzazione durante l'intera titolazione (diluizione iniziale 1:20) con MPI compreso tra il 10% e il 50%. Per le chiamate positive ma in cui la neutralizzazione non raggiunge il 50% o l'80%, il titolo ID50/ID80 viene prima stimato con Prism.

La tabella riassume l'entità della risposta di legame degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio di anticorpi neutralizzanti (NAb) alla Visita 1, 2, 3, 4, complessivamente e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte africana.

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno le % di cellule NK CD107A+ sottratte dal fondo per le cellule infettate e le % di cellule NK CD107A+ sottratte dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della % di CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infettate e trasfettate. I valori di cut-off sono determinati rispettivamente dalla media+2DS, dai controlli negativi per SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ era la grandezza della risposta.

La tabella riassume il tasso di risposta di legame anticorpale specifico per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) alla Visita 1, complessivo e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

La degranulazione delle cellule NK dipendente da anticorpi sarà misurata utilizzando il saggio ADCC a una diluizione 1:500. Due letture saranno la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule infette e la percentuale di cellule NK CD107A+ sottratta dal fondo per le cellule trasfettate. Le risposte positive saranno considerate se i valori della percentuale di CD107A+ sottratta dal fondo sono ≥ 4,07 e ≥5,27 rispettivamente per le cellule infette e trasfettate. Le soglie sono determinate rispettivamente dalla media+2DS dai controlli negativi SARS-CoV-2. La percentuale di cellule NK CD107a+ era la grandezza della risposta.

La tabella riassume la grandezza della risposta di legame anticorpale specifica per SARS-CoV-2 mediante saggio di citotossicità cellulare anticorpo-dipendente (ADCC) Visita 1, complessiva e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante una colorazione intracellulare per citochine (ICS). Le chiamate positive verranno effettuate utilizzando il test esatto di positività di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume il tasso di risposta delle cellule T CD4+ e CD8+ specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivo e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

La citometria a flusso è stata utilizzata per esaminare le risposte specifiche delle cellule T CD4+ e CD8+ per SARS-CoV-2 utilizzando una colorazione intracellulare delle citochine (ICS). Le chiamate positive verranno effettuate utilizzando il test di positività esatto di Fisher per tutti i marcatori. Le magnitudini sono % di cellule T che esprimono IFN-g/IL-2.

La tabella riassume la magnitudine della risposta specifica delle cellule T CD4+ e CD8+ per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessivamente e per regione e Gruppo di Comorbidità nella coorte americana

Le risposte delle cellule B specifiche per SARS-CoV-2 e i dati fenotipici delle cellule B sono stati identificati e caratterizzati utilizzando proteine Env ricombinanti marcate con fluorocromi (S6P e RBD) in combinazione con un pannello di anticorpi per citometria a flusso su tutti i campioni disponibili della visita di arruolamento (V1). Il campione verrà incluso nell'analisi solo se il numero di cellule B IgD- è uguale o superiore a 1000 per quel campione.

La tabella riassume l'ampiezza della risposta delle cellule B della memoria specifiche per SARS-CoV-2 mediante citometria a flusso alla Visita 1, complessiva e per regione e gruppo di comorbidità nella coorte americana.

I saggi BAMA sono stati eseguiti su campioni dei partecipanti alla Visita 1 (Mese 0, baseline) e sui campioni disponibili alle visite di follow-up (Mese 2, 4). Le risposte sieriche IgA, IgG1, IgG3 specifiche per SARS-CoV-2 (diluizione 1:50) agli antigeni SARS-CoV-2 sono state misurate su uno strumento Bio-Plex (Bio-Rad). Il software Bioplex fornisce 2 letture: un'intensità media di fluorescenza sottratta dal fondo (MFI), dove il fondo si riferisce a un controllo a livello di piastra (cioè, un pozzo vuoto eseguito su ogni piastra), e una concentrazione basata su una curva standard. Le risposte positive a ciascuna visita saranno definite se i valori MFI meno il bianco sono ≥ di un cutoff specifico per isotipo, antigene e diluizione (fornito dal laboratorio). Le MFI meno il bianco (o MFI netta) sono utilizzate per riassumere l'entità in un dato momento temporale.

La tabella riassume l'entità della risposta legante degli anticorpi specifici per SARS-CoV-2 mediante saggio multiplex per anticorpi leganti (BAMA IgA campione nasale) alla Visita 1, 2, 3, complessivamente e per regione e gruppo di arruolamento nella coorte americana.