从头突变复发的风险:通过联合使用基因组工具研究和量化父本生发嵌合体 (RRMUT)
2026年4月16日 更新者:University Hospital, Rouen
- 纳入 5 个家庭 纳入将由鲁昂大学医院的临床遗传学部门进行(单中心研究),并且对应于父母三人组 + 具有无法解释的发育异常的孩子。 纳入患者将纳入常规护理,并通过短读和长读测序技术对先证者及其父母的基因组进行广泛分析,这将对纳入的家庭产生直接好处,这代表了发育性疾病最全面的诊断测试,目前还没有常规可用的。 习惯于开具全基因组分析处方的临床医生将其纳入临床遗传学将使家庭获得清晰和完整的信息。 收集同意书。 三人的 DNA 已经可以在分子遗传学实验室获得,如有必要,可能会提出新的血液样本。 从父亲那里收集精子。
- 鉴定大量从头突变。 在已经启动的合作框架内,提取血液 DNA 并将完整基因组测序发送至国家人类基因组学研究中心(CNRGH,Evry)。 得益于鲁昂现有的专业知识,对测序数据进行分析。 每三重奏鉴定约 40-120 个新突变。 在这个阶段:解释与确定儿童疾病原因的次要目标相关的变异。 长读长基因组将允许将新生变异定相为父本或母本单倍型。
- 在父亲的精子样本中搜索从头突变。 精子DNA的提取。 针对不同三重奏中识别的遗传变异设计测序面板。 得益于已经投入使用的技术和设备,文库的制备、深度靶向高通量测序。 针对先证者(在 2. 中)确定的新生变异进行特定搜索,每次评估 (i) 精子样本中变异的存在,(ii) 嵌合体的数量,反映携带者精子的比例和因此有复发的风险,(iii) 在深度测序中我的父母双方的血样存在变异。
研究概览
研究类型
介入性
注册 (实际的)
5
阶段
- 不适用
联系人和位置
本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。
学习地点
-
-
-
Rouen、法国
- Rouen University Hospital
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-
参与标准
研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
是的
描述
纳入标准:
- 由一名患有发育障碍的儿童和未受影响的父母组成的三人组
- 临床专业知识和基因检测后病因缺失
- 全基因组测序分析的指示
- 未经促排卵治疗的自然妊娠儿童
- DNA 血液样本的可用性
- 参加社会保险
- 已阅读并理解信息函并签署同意书的患者或患者的法定代表
排除标准:
- 缺乏对先证者进行全基因组分析的指征
- 发育障碍的病因已经确定
- 体外受精后出生的先证者
- 不可能从父亲那里进行无创精子采集
学习计划
本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。
研究是如何设计的?
设计细节
- 主要用途:诊断
- 分配:不适用
- 介入模型:单组作业
- 屏蔽:无(打开标签)
武器和干预
参与者组/臂 |
干预/治疗 |
|---|---|
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实验性的:对先证者进行全基因组分析的适应症
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将对患者和父母(父亲、母亲)进行全基因组分析
将在父亲样本中进行精子分析
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
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在父亲精子中可检测到的患者新生突变的比例
大体时间:第一天
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第一天
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次要结果测量
结果测量 |
大体时间 |
|---|---|
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已获得分子诊断(已确定发育障碍原因)的患者人数 ≥1
大体时间:第一天
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第一天
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合作者和调查者
在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。
调查人员
- 首席研究员:François LECOQUIERRE, MD、University Hospital, Rouen
出版物和有用的链接
负责输入研究信息的人员自愿提供这些出版物。这些可能与研究有关。
一般刊物
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
研究记录日期
这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。
研究主要日期
学习开始 (实际的)
2021年2月24日
初级完成 (实际的)
2022年12月12日
研究完成 (实际的)
2022年12月12日
研究注册日期
首次提交
2020年9月21日
首先提交符合 QC 标准的
2020年9月21日
首次发布 (实际的)
2020年9月25日
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
2026年4月20日
上次提交的符合 QC 标准的更新
2026年4月16日
最后验证
2026年2月1日
更多信息
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