Риск повторения мутаций de Novo: исследование и количественная оценка отцовского зародышевого мозаицизма с помощью комбинированного использования геномных инструментов (RRMUT)
16 апреля 2026 г. обновлено: University Hospital, Rouen
- Включение 5 семей. Включение будет сделано отделением клинической генетики университетской больницы Руана (моноцентрическое исследование) и будет соответствовать тройке родителей + ребенок с необъяснимыми аномалиями развития. Включение пациентов будет интегрировано в рутинную помощь и принесет немедленную пользу включенным семьям в расширенный анализ геномов пробанда и их родителей с помощью методов короткого и длинного считывания, которые представляют собой наиболее полные диагностические тесты для выявления заболеваний, связанных с развитием. и которые в настоящее время обычно не доступны. Включение в клиническую генетику клиницистов, привыкших назначать полногеномный анализ, позволит семьям получить четкую и полную информацию. Сбор согласий. ДНК троицы уже будет доступна в лаборатории молекулярной генетики, и при необходимости может быть предложен новый образец крови. Сбор спермы у отца.
- Идентификация большого набора мутаций de novo. Извлечение ДНК крови и отправка для секвенирования полного генома в Национальный центр исследований геномики человека (CNRGH, Эври) в рамках уже начатого сотрудничества. Анализ данных секвенирования благодаря уже существующему опыту в Руане. Идентификация около 40-120 мутаций de novo на трио. На данном этапе: интерпретация выявленных вариаций с второстепенной задачей выявления причины заболевания у детей. Геномы с длинным чтением позволят фазировать варианты de novo к отцовскому или материнскому гаплотипу.
- Поиск мутаций de novo в образцах спермы отца. Экстракция ДНК сперматозоидов. Дизайн панели секвенирования, нацеленной на генетические вариации, выявленные в разных трио. Подготовка библиотек, целевое высокопроизводительное секвенирование на большой глубине благодаря уже работающим методам и оборудованию. Специфический поиск вариаций de novo, выявленных у пробандов (в 2.), с оценкой для каждой из них (i) наличия вариации в образце спермы, (ii) количества мозаицизма, отражающего долю сперматозоидов-носителей и следовательно, риск рецидива, (iii) наличие моей вариации в образце крови обоих родителей при глубоком секвенировании.
Обзор исследования
Статус
Завершенный
Условия
Вмешательство/лечение
Тип исследования
Интервенционный
Регистрация (Действительный)
5
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Места учебы
-
-
-
Rouen, Франция
- Rouen University Hospital
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Да
Описание
Критерии включения:
- Трио, состоящее из ребенка с нарушением развития и обоих здоровых родителей
- Отсутствие этиологии после клинической экспертизы и генетического тестирования
- Показание к полногеномному секвенированию
- Ребенок от спонтанной беременности без лечения стимуляцией овуляции
- Наличие образцов крови ДНК
- Принадлежность к системе социального страхования
- Пациент или законный представитель пациента, который прочитал и понял информационное письмо и подписал форму согласия
Критерий исключения:
- Отсутствие показаний для полногеномного анализа у пробанда
- Этиология нарушения развития уже установлена
- Пробанд родился после экстракорпорального оплодотворения
- Невозможность неинвазивного забора спермы у отца
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Диагностика
- Распределение: Н/Д
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Показание для полногеномного анализа у пробанда
|
у пациентов и родителей (отец, мать) будет проведен полногеномный анализ.
Анализ спермы будет сделан в образцах отца.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Доля мутаций de novo пациента, обнаруживаемых в сперме отца
Временное ограничение: 1 день
|
1 день
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Временное ограничение |
|---|---|
|
Количество пациентов, у которых был получен молекулярный диагноз (выявлена причина нарушения развития) ≥1
Временное ограничение: 1 день
|
1 день
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Публикации и полезные ссылки
Лицо, ответственное за внесение сведений об исследовании, добровольно предоставляет эти публикации. Это может быть что угодно, связанное с исследованием.
Общие публикации
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
24 февраля 2021 г.
Первичное завершение (Действительный)
12 декабря 2022 г.
Завершение исследования (Действительный)
12 декабря 2022 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
21 сентября 2020 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
21 сентября 2020 г.
Первый опубликованный (Действительный)
25 сентября 2020 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
20 апреля 2026 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
16 апреля 2026 г.
Последняя проверка
1 февраля 2026 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- 2019/0401/HP
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
НЕТ
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .