Stockholm3 在多种族队列中的验证研究 (SEPTA)

研究设计和程序：

研究协调员将解释同意书中包含的信息。 此外，患者的血液将在活组织检查之前抽取。

在活组织检查之前，在获得受试者同意后，将血液收集在 x2 乙二胺四乙酸 (EDTA) 4 ml 试管中。 将立即离心一管（在 2000G 下 10 分钟）并将血浆倾析到不含添加剂的管中（这通常会产生 1.5 ml 血浆）。 然后将倒出的试管（装有血浆）和剩余的 EDTA 试管（装有全血）冷冻并储存在指定的参与机构场所。 它将在-20 摄氏度下储存直至发货。

患者数据将存储在托管在瑞典安全服务器上的 REDCap 数据库中。 数据将在研究期间存储，5 年后用于数据分析。

每个参与机构将通过患者日志跟踪同意的患者。 将收集医疗记录编号，以保持关键站点人员收集数据的一致标识符。 一旦所有患者数据都被记录下来，数据将从 REDCap 中导出，并删除 MRN。 卡罗林斯卡研究所或 A23 实验室将不会使用患者标识符。 将记录患者的以下 PHI 和非 PHI 信息：

披：

医疗记录编号 (MRN)

非 PHI 人口统计数据

• Stockholm3 身份证号码
• 种族
• 邮政编码

临床数据

• 总 PSA
• 采样日期的年龄 [岁]
• 前列腺癌家族史
• 5-α还原酶抑制剂的使用
• 较早进行活检
• 前列腺体积 [前列腺体积用美国衡量]
• 直肠指检状态 [良性/正常、结节/硬结感觉、不对称、未执行]

和

结果数据——血液静脉穿刺后立即进行的活检结果，即：

结果将分为靶向活检核心和系统活检核心

• 格里森评分 1
• 格里森评分 2
• 格里森总和
• 癌症长度（毫米）（总和最高级别）
• 芯数
• 正芯数
• 抽血后进行活检的时间 [天]
• MRI 结果，即 前列腺成像报告和数据系统 (PIRADS)（0、1、2、3、4、5）

允许使用：

运行由 Gronberg 等人定义的 Stockholm3 测试和 Ancestry 信息遗传标记

样品将被运往位于瑞典的乌普萨拉实验室（A23 实验室）进行分析。 每位患者将有两份血液样本（血浆和全血），并在-20 摄氏度下冷冻。 然后将测试血液样本的血清蛋白水平的定量水平，并从白细胞中提取 DNA，并将测试基因和小核苷酸多态性 (SNP) 种系突变和变异。

基因分型将使用定制基因分型分析进行。 血浆将用于蛋白质分析。 血浆蛋白质分析将使用定制蛋白质测定法进行，包括总 PSA 和游离 PSA、人腺激肽释放酶 2 (hK2)、微精蛋白-β (MSMB) 和巨噬细胞抑制性细胞因子 1 (MIC-1)。 PSA 将使用商业化验进行测试。

根据血浆蛋白分析、遗传分析和临床数据的结果，将计算出 Stockholm3 风险评分。 参与者的样本将在位于瑞典乌普萨拉的实验室按照瑞典的规定进行处理。

测试结果不会与患者共享，结果也不会改变或影响医疗决策。

预期风险/收益

预期风险：

由于这是对未识别的患者信息和未识别的生物样本的回顾性分析，因此几乎没有预期的风险。 可能会出现违反保密规定和隐私泄露的情况，但我们会尽一切努力将这种风险降至最低。

预期收益：

参与者将推进科学和临床知识。 参与者还将因参与研究的时间和参与而获得少量报酬。

数据收集和管理程序

本研究将利用 REDCap（研究电子数据捕获），一种软件工具集和工作流程方法，用于临床和研究数据的电子收集和管理，以收集和存储数据。 卡罗林斯卡学院信息技术 (KI-IT) 部门将用作数据处理和管理的中心位置。 REDCap 由 KI-IT 在 Biomedicum（Solnavägen 9, Solna, Sweden 17165）中托管

数据分析

数据分析将由 PI、合作研究者和/或主要研究人员进行。

质量控制和质量保证

主要研究人员将负责确保收集的所有数据都符合协议。

数据和安全监控

这项研究的风险极小，将尽一切努力确保不存在机密泄露和隐私泄露问题。

统计考虑

功率分析 这项研究是在几个站点之间进行的，因此将进行汇总分析。 基于该框架开发的双侧 alpha 为 0.05，每个种族的 250 名男性有 80% 的能力检测不同种族间 Stockholm3 测试的灵敏度和/或特异性的 10 个百分点的差异。 来自多个站点的汇总数据将允许对非西班牙裔白人、非洲/黑人、亚洲人和西班牙裔白人进行比较。 在每个由 250 名男性组成的种族群体中，相同的样本量提供了 90% 的功效来检测 Stockholm3 和 PSA 之间的曲线下面积 (AUC) 差异，以检测 PC 至少 10 个百分点（主要目标）。

目标累积是每个种族/民族中 500 名男性，当每个种族/民族中有 250 名男性被登记时，将进行中期分析。

数据分析描述性单变量统计将用于比较组。 二元终点将用逻辑回归模型进行评估。 统计分析将涉及逻辑回归建模、AUC 计算、校准分析和基本性能特征（灵敏度、特异性和预测值）的计算。

监管要求

知情同意书参与者通过签署知情同意书来表示他们同意参与研究，以获取医疗记录、进行基因研究和接受静脉穿刺血液样本。

受试者保密性 用于本研究的数据将存储在 REDCaps 中，机构之间传输的所有数据将在整个研究过程中保持去识别化状态。

意外问题任何意外问题都将由指定的研究人员立即报告给站点特定的伦理审查委员会。