Estudio de validación de Stockholm3 en una cohorte multiétnica (SEPTA)

Diseño y procedimientos del estudio:

El coordinador de investigación explicará la información contenida en el consentimiento. Además, se extraerá sangre del paciente antes de la biopsia.

Antes de la biopsia, se recogerá sangre en tubos de 4 ml de ácido etilendiaminotetraacético (EDTA) x2 después de obtener el consentimiento de los sujetos. Un tubo se centrifugará inmediatamente (10 minutos a 2000 G) y el plasma se decantará a un tubo sin aditivos (esto normalmente produce 1,5 ml de plasma). El tubo decantado (con plasma) y el tubo con EDTA restante (con sangre total) se congelan y almacenan en el sitio institucional participante designado. Se almacenará a -20 Celsius hasta que se envíe.

Los datos de los pacientes se almacenarán en una base de datos REDCap, alojada en el servidor seguro de Suecia. Los datos se almacenarán durante la duración del estudio y 5 años después para fines de análisis de datos.

Los pacientes que hayan dado su consentimiento serán rastreados por los registros de pacientes de cada institución participante. El número de registro médico se recopilará para mantener un identificador consistente para la recopilación de datos por parte del personal clave del sitio. Una vez que se registren todos los datos del paciente, los datos se exportarán desde REDCap con el MRN eliminado. No se utilizarán identificadores de pacientes en el Instituto Karolinska o en el laboratorio A23. Se registrará la siguiente información PHI y no PHI del paciente:

FI:

Número de registro médico (MRN)

Datos demográficos no PHI

• Estocolmo3 Número de identificación
• La raza
• Código postal

Datos clinicos

• APE total
• Edad en la fecha de muestreo [años]
• Antecedentes familiares de cáncer de próstata.
• Uso de inhibidores de la 5-alfa reductasa
• Biopsia anterior realizada
• Volumen prostático [Volumen prostático medido con US]
• Estado del examen rectal digital [Benigno/normal, Nódulo/induración palpable, Asimetría, No realizado]

Y

Datos de resultado: resultados de la biopsia realizada inmediatamente después de la venopunción de sangre, es decir:

Los resultados se separarán en núcleos de biopsia dirigidos y núcleos de biopsia sistemática

• Puntuación de Gleason 1
• Puntuación de Gleason 2
• Suma de Gleason
• Longitud del cáncer (mm) (grado total y más alto)
• Numero de nucleos
• Número de núcleos positivos
• Tiempo para realizar la biopsia después de la extracción de sangre [días]
• Resultados de la resonancia magnética, es decir, Sistema de datos e informes de imágenes de la próstata (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Uso permitido:

Para ejecutar la prueba Stockholm3 definida por Gronberg et al Y marcadores genéticos informativos de Ancestry

Las muestras se enviarán al laboratorio con sede en Uppsala (Laboratorio A23) en Suecia para su análisis. Cada paciente tendrá dos muestras de sangre (plasma y sangre completa) y se congelará a -20 grados centígrados. Luego, las muestras de sangre se analizarán para determinar los niveles cuantitativos de los niveles de proteína sérica y se extraerá el ADN de los glóbulos blancos y se analizarán las mutaciones y variantes de la línea germinal de genes y polimórficos de nucleótidos pequeños (SNP).

El genotipado se realizará mediante ensayos de genotipado personalizados. El plasma se utilizará para el análisis de proteínas. El análisis de proteínas plasmáticas se realizará utilizando ensayos de proteínas personalizados que incluyen PSA total y libre, calicreína glandular humana 2 (hK2), microseminoproteína-beta (MSMB) y citoquina inhibidora de macrófagos 1 (MIC-1). El PSA se analizará con un ensayo comercial.

Según los resultados del análisis de proteínas plasmáticas, el análisis genético y los datos clínicos, se calculará la puntuación de riesgo de Stockholm3. Las muestras de los participantes serán tratadas de acuerdo con las regulaciones de Suecia en el laboratorio con sede en Uppsala, Suecia.

Los resultados de las pruebas no se compartirán con el paciente, ni cambiarán ni afectarán las decisiones médicas.

Riesgos/beneficios esperados

Riesgos previstos:

Dado que se trata de un análisis retrospectivo de información de pacientes no identificados, así como de muestras biológicas no identificadas, existen pocos riesgos anticipados. Es posible que se produzca una violación de la confidencialidad y una pérdida de la privacidad; sin embargo, se hará todo lo posible para minimizar este riesgo.

Beneficios anticipados:

Los participantes avanzarán en el conocimiento científico y clínico. Los participantes también recibirán un pequeño pago por el tiempo y la participación en el estudio.

Procedimientos de recopilación y gestión de datos

Este estudio utilizará REDCap (Research Electronic Data Capture), un conjunto de herramientas de software y una metodología de flujo de trabajo para la recopilación y gestión electrónica de datos clínicos y de investigación, para recopilar y almacenar datos. El Departamento de Tecnología de la Información del Instituto Karolinska (KI-IT) se utilizará como ubicación central para el procesamiento y la gestión de datos. REDCap está alojado en KI-IT en Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Suecia 17165)

Análisis de los datos

El análisis de datos será realizado por el IP, co-investigadores y/o personal de investigación clave.

Control de Calidad y Garantía de Calidad

El personal clave de investigación será responsable de garantizar que todos los datos recopilados se adhieran al protocolo.

Monitoreo de datos y seguridad

Este estudio tiene un riesgo mínimo y se harán todos los esfuerzos para garantizar que no haya violaciones de confidencialidad ni pérdida de privacidad.

Consideraciones estadísticas

Análisis de potencia Este estudio se está realizando entre varios sitios y, por lo tanto, se realizará un análisis conjunto. Basado en el marco desarrollado, un alfa bilateral de 0.05, 250 hombres en cada etnia da un poder del 80% para detectar diferencias de 10 puntos porcentuales en sensibilidad y/o especificidad de la prueba de Estocolmo3 entre diferentes etnias. Los datos agrupados de varios sitios permitirán la comparación entre hombres blancos no hispanos, africanos/negros, asiáticos e hispanos blancos. Dentro de cada grupo étnico de 250 hombres, el mismo tamaño de muestra brinda un poder del 90 % para detectar diferencias en el área bajo la curva (AUC) entre Stockholm3 y PSA para la detección de PC que son al menos 10 puntos porcentuales (objetivo principal).

La meta de acumulación es de 500 hombres dentro de cada raza/etnia, el análisis intermedio se realizará cuando se inscriban 250 hombres en cada raza/etnia.

Análisis de datos Se utilizarán estadísticas univariadas descriptivas para comparar grupos. Los criterios de valoración binarios se evaluarán con un modelo de regresión logística. El análisis estadístico incluirá modelos de regresión logística, cálculo de AUC, análisis de calibración y cálculo de características básicas de rendimiento (sensibilidad, especificidad y valores predictivos).

Los requisitos reglamentarios

Consentimiento informado Los participantes manifiestan su consentimiento para participar en el estudio mediante la firma de consentimientos informados para acceder a registros médicos, realizar investigaciones genéticas y someterse a venopunción para obtener muestras de sangre.

Confidencialidad de los sujetos Los datos utilizados para este estudio se almacenarán en REDCaps y todos los datos transferidos entre instituciones permanecerán anonimizados durante todo el estudio.

Problemas imprevistos Cualquier problema imprevisto será informado de inmediato a la junta de revisión ética específica del sitio por parte del personal de investigación designado.