Estocolmo3 Estudo de validação em uma coorte multiétnica (SEPTA)

Concepção e Procedimentos do Estudo:

O coordenador da pesquisa explicará as informações contidas no consentimento. Além disso, o sangue do paciente será coletado antes da biópsia.

Antes da biópsia, o sangue será coletado em tubos x2 de ácido etilenodiaminotetracético (EDTA) de 4 ml após a obtenção do consentimento dos sujeitos. Um tubo será imediatamente centrifugado (10 minutos a 2000G) e o plasma decantado para um tubo sem aditivos (isso normalmente produz 1,5 ml de plasma). O tubo decantado (com plasma) e o tubo EDTA restante (com sangue total) são então congelados e armazenados no local institucional participante designado. Ele será armazenado a -20 Celsius até ser enviado.

Os dados do paciente serão armazenados em um banco de dados REDCap, hospedado no servidor seguro da Suécia. Os dados serão armazenados durante a duração do estudo e 5 anos depois para fins de análise de dados.

Os pacientes consentidos serão rastreados pelos registros do paciente por cada instituição participante. O número do registro médico será coletado para manter um identificador consistente para a coleta de dados pelo pessoal principal do local. Depois que todos os dados do paciente forem registrados, os dados serão exportados do REDCap com o MRN removido. Não haverá identificadores de pacientes usados ​​no Instituto Karolinska ou no laboratório A23. As seguintes informações PHI e não PHI serão registradas do paciente:

PHI:

Número do registro médico (MRN)

Dados demográficos não PHI

• Estocolmo3 Número de identificação
• Corrida
• Código postal

Dados clínicos

• PSA total
• Idade na data da amostragem [anos]
• Histórico familiar de câncer de próstata
• Uso de inibidores da 5-alfa redutase
• Biópsia anterior realizada
• Volume da próstata [volume da próstata medido com US]
• Estado do exame retal digital [benigno/normal, nódulo/endurecimento sentido, assimetria, não realizado]

E

Dados do resultado - Resultados da biópsia realizada imediatamente após punção venosa de sangue, ou seja:

Os resultados serão separados em núcleos de biópsia direcionados e núcleos de biópsia sistemática

• Pontuação de Gleason 1
• Pontuação de Gleason 2
• Soma de Gleason
• Comprimento do câncer (mm) (total e grau mais alto)
• Número de núcleos
• Número de núcleos positivos
• Tempo para realizar biópsia após coleta de sangue [dias]
• Resultados da ressonância magnética, ou seja, Sistema de dados e relatórios de imagem da próstata (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Uso permitido:

Para executar o teste Stockholm3 definido por Gronberg et al AND marcadores genéticos informativos de ancestralidade

As amostras serão enviadas para o laboratório de Uppsala (Laboratório A23) na Suécia para análise. Cada paciente terá duas amostras de sangue (plasma e sangue total) e será congelada a -20 graus Celsius. As amostras de sangue serão então testadas para níveis quantitativos de proteínas séricas e o DNA será extraído de glóbulos brancos e será testado para mutações e variantes de genes e polimórficos de pequenos nucleotídeos (SNPs).

A genotipagem será realizada usando ensaios de genotipagem personalizados. O plasma será utilizado para análise de proteínas. A análise de proteínas plasmáticas será realizada usando ensaios de proteínas personalizados, incluindo PSA total e livre, calicreína glandular humana 2 (hK2), microseminoproteína-beta (MSMB) e citocina inibidora de macrófagos 1 (MIC-1). O PSA será testado com um ensaio comercial.

Com base nos resultados da análise de proteínas plasmáticas, análise genética e dados clínicos, o Stockholm3 Risk Score será calculado. As amostras dos participantes serão tratadas de acordo com os regulamentos da Suécia no laboratório com sede em Uppsala, Suécia.

Os resultados dos testes não serão compartilhados com o paciente, nem os resultados mudarão ou afetarão as decisões médicas.

Riscos/Benefícios Esperados

Riscos Antecipados:

Como esta é uma análise retrospectiva de informações não identificadas do paciente, bem como bioespécimes não identificados, há poucos riscos previstos. Uma quebra de confidencialidade, bem como a perda de privacidade, são possíveis, no entanto, todos os esforços serão feitos para minimizar esse risco.

Benefícios Antecipados:

Os participantes avançarão no conhecimento científico e clínico. Os participantes também receberão um pequeno pagamento pelo tempo e envolvimento no estudo.

Procedimentos de coleta e gerenciamento de dados

Este estudo utilizará REDCap (Research Electronic Data Capture), um conjunto de ferramentas de software e metodologia de fluxo de trabalho para coleta e gerenciamento eletrônico de dados clínicos e de pesquisa, para coletar e armazenar dados. O Departamento de Tecnologia da Informação do Instituto Karolinska (KI-IT) será usado como um local central para processamento e gerenciamento de dados. REDCap é hospedado por KI-IT no Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Suécia 17165)

Análise de dados

A análise de dados será realizada pelo PI, co-investigadores e/ou pessoal de pesquisa chave.

Controle de qualidade e garantia de qualidade

O pessoal-chave da pesquisa será responsável por garantir que todos os dados coletados sigam o protocolo.

Monitoramento de Dados e Segurança

Este estudo é de risco mínimo e todos os esforços serão feitos para garantir que não haja quebras de confidencialidade, bem como nenhuma perda de privacidade.

Considerações Estatísticas

Análise de poder Este estudo está sendo realizado entre vários sites e, portanto, uma análise agrupada será realizada. Com base na estrutura desenvolvida, um alfa bilateral de 0,05, 250 homens em cada etnia fornece 80% de poder para detectar diferenças de 10 pontos percentuais na sensibilidade e/ou especificidade do teste Stockholm3 em diferentes etnias. Os dados agrupados de vários sites permitirão a comparação entre homens brancos não hispânicos, africanos/negros, asiáticos e brancos hispânicos. Dentro de cada grupo étnico de 250 homens, o mesmo tamanho de amostra fornece um poder de 90% para detectar diferenças na área sob a curva (AUC) entre Estocolmo3 e PSA para detecção de PC que são de pelo menos 10 pontos percentuais (objetivo principal).

O acúmulo de meta é de 500 homens em cada raça/etnia, a análise intermediária será realizada quando 250 homens em cada raça/etnia estiverem inscritos.

Análise de dados Estatísticas descritivas univariadas serão usadas para comparar os grupos. Os endpoints binários serão avaliados com um modelo de regressão logística. A análise estatística envolverá modelagem de regressão logística, cálculo de AUC, análises de calibração e cálculo de características básicas de desempenho (sensibilidade, especificidade e valores preditivos).

Requisitos regulamentares

Consentimento Informado Os participantes indicam seu consentimento em participar do estudo assinando consentimentos informados para acesso a prontuários, realização de pesquisa genética e punção venosa para coleta de amostras de sangue.

Sigilo do sujeito Os dados utilizados para este estudo serão armazenados no REDCaps e todos os dados transferidos entre as instituições permanecerão sem identificação durante todo o estudo.

Problemas imprevistos Quaisquer problemas imprevistos serão imediatamente relatados ao conselho de revisão ética específico do local pelo pessoal de pesquisa designado.