Studio di convalida Stockholm3 in una coorte multietnica (SEPTA)

Progettazione e procedure dello studio:

Il coordinatore della ricerca spiegherà le informazioni contenute nel consenso. Inoltre, il sangue del paziente verrà prelevato prima della biopsia.

Prima della biopsia, il sangue verrà raccolto in tubi x2 di acido etilendiamminotetraacetico (EDTA) da 4 ml dopo aver ottenuto il consenso dei soggetti. Una provetta verrà immediatamente centrifugata (10 minuti a 2000 G) e il plasma decantato in una provetta senza additivi (questo tipicamente produce 1,5 ml di plasma). La provetta decantata (con plasma) e la restante provetta con EDTA (con sangue intero) vengono quindi congelate e conservate presso il sito istituzionale partecipante designato. Verrà conservato a -20 gradi Celsius fino alla spedizione.

I dati dei pazienti saranno archiviati in un database REDCap, ospitato sul server sicuro della Svezia. I dati saranno conservati per tutta la durata dello studio e 5 anni dopo per scopi di analisi dei dati.

I pazienti acconsentiti saranno monitorati dai registri dei pazienti di ciascuna istituzione partecipante. Il numero della cartella clinica verrà raccolto per mantenere un identificatore coerente per la raccolta dei dati da parte del personale chiave del sito. Una volta registrati tutti i dati del paziente, i dati verranno esportati da REDCap con l'MRN rimosso. Non verranno utilizzati identificatori dei pazienti presso il Karolinska Institute o il laboratorio A23. Verranno registrate le seguenti informazioni PHI e non PHI del paziente:

PHI:

Numero di cartella clinica (MRN)

Dati demografici non PHI

• Stoccolma3 Numero di identificazione
• Corsa
• Cap

Dati clinici

• PSA totale
• Età alla data di campionamento [anni]
• Storia familiare di cancro alla prostata
• Uso di inibitori della 5-alfa reduttasi
• Prima biopsia condotta
• Volume della prostata [Volume della prostata come misura con US]
• Stato esame rettale digitale [benigno/normale, nodulo/indurimento percepito, asimmetria, non eseguito]

E

Dati sugli esiti - Risultati della biopsia eseguita immediatamente dopo la venipuntura, vale a dire:

I risultati saranno separati in nuclei di biopsia mirata e nuclei di biopsia sistematica

• Punteggio Gleason 1
• Gleason Punteggio 2
• Somma Gleason
• Lunghezza del cancro (mm) (totale e grado più alto)
• Numero di core
• Numero di core positivi
• Tempo per eseguire la biopsia dopo il prelievo di sangue [giorni]
• Risultati della risonanza magnetica, ad es. Sistema di segnalazione e dati per imaging della prostata (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Uso consentito:

Eseguire il test Stockholm3 definito da Gronberg et al AND Ancestry marcatori genetici informativi

I campioni saranno spediti al laboratorio di Uppsala (Laboratorio A23) in Svezia per l'analisi. Ogni paziente avrà due campioni di sangue (plasma e sangue intero) e sarà congelato a -20 gradi Celsius. I campioni di sangue saranno quindi testati per i livelli quantitativi dei livelli di proteine ​​sieriche e il DNA sarà estratto dai globuli bianchi e sarà testato per le mutazioni e le varianti germinali del gene e dei polimorfi a piccoli nucleotidi (SNP).

La genotipizzazione verrà eseguita utilizzando saggi di genotipizzazione personalizzati. Il plasma sarà utilizzato per l'analisi delle proteine. L'analisi delle proteine ​​plasmatiche verrà eseguita utilizzando un test proteico personalizzato che include PSA totale e libero, callicreina ghiandolare umana 2 (hK2), microseminoproteina-beta (MSMB) e citochina 1 inibitoria dei macrofagi (MIC-1). Il PSA sarà testato con un test commerciale.

Sulla base dei risultati dell'analisi delle proteine ​​plasmatiche, dell'analisi genetica e dei dati clinici, verrà calcolato lo Stockholm3 Risk Score. I campioni dei partecipanti saranno trattati in conformità con le normative svedesi presso il laboratorio con sede a Uppsala, Svezia.

I risultati dei test non saranno condivisi con il paziente, né i risultati cambieranno o influiranno sulle decisioni mediche.

Rischi/benefici attesi

Rischi previsti:

Poiché si tratta di un'analisi retrospettiva delle informazioni dei pazienti non identificate e dei campioni biologici deidentificati, ci sono pochi rischi previsti. Sono possibili una violazione della riservatezza e la perdita della privacy, tuttavia verrà fatto ogni sforzo per ridurre al minimo questo rischio.

Benefici previsti:

I partecipanti avanzeranno le conoscenze scientifiche e cliniche. I partecipanti riceveranno anche un piccolo compenso per il tempo e il coinvolgimento nello studio.

Procedure di raccolta e gestione dei dati

Questo studio utilizzerà REDCap (Research Electronic Data Capture), un set di strumenti software e una metodologia del flusso di lavoro per la raccolta elettronica e la gestione dei dati clinici e di ricerca, per raccogliere e archiviare i dati. Il dipartimento di tecnologia informatica del Karolinska Institute (KI-IT) sarà utilizzato come sede centrale per l'elaborazione e la gestione dei dati. REDCap è ospitato da KI-IT nel Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Svezia 17165)

Analisi dei dati

L'analisi dei dati sarà eseguita dal PI, dai co-ricercatori e/o dal personale di ricerca chiave.

Controllo di qualità e garanzia di qualità

Il personale di ricerca chiave sarà responsabile di garantire che tutti i dati raccolti aderiscano al protocollo.

Dati e monitoraggio della sicurezza

Questo studio comporta un rischio minimo e verranno compiuti tutti gli sforzi per garantire che non vi siano violazioni della riservatezza e nessuna perdita di privacy.

Considerazioni statistiche

Analisi della potenza Questo studio viene condotto tra diversi siti e pertanto verrà eseguita un'analisi aggregata. Sulla base del quadro sviluppato, un alfa bilaterale di 0,05, 250 uomini in ciascuna etnia fornisce l'80% di potenza per rilevare differenze di 10 punti percentuali nella sensibilità e/o specificità del test di Stoccolma3 tra le diverse etnie. I dati raccolti da diversi siti consentiranno il confronto tra uomini bianchi non ispanici, africani / neri, asiatici e bianchi ispanici. All'interno di ciascun gruppo etnico di 250 uomini, la stessa dimensione del campione fornisce una potenza del 90% per rilevare differenze nell'area sotto la curva (AUC) tra Stoccolma3 e PSA per il rilevamento di PC che sono almeno 10 punti percentuali (obiettivo primario).

L'accumulo di obiettivi è di 500 uomini all'interno di ogni razza/etnia, l'analisi ad interim verrà eseguita quando saranno iscritti 250 uomini in ogni razza/etnia.

Analisi dei dati Le statistiche univariate descrittive verranno utilizzate per confrontare i gruppi. Gli endpoint binari saranno valutati con un modello di regressione logistica. L'analisi statistica comporterà modelli di regressione logistica, calcolo dell'AUC, analisi di calibrazione e calcolo delle caratteristiche prestazionali di base (sensibilità, specificità e valori predittivi).

Requisiti normativi

Consenso informato I partecipanti indicano il loro consenso a partecipare allo studio firmando i consensi informati per l'accesso alle cartelle cliniche, la conduzione di ricerche genetiche e la puntura venosa per i campioni di sangue.

Riservatezza del soggetto I dati utilizzati per questo studio verranno archiviati in REDCaps e tutti i dati trasferiti tra le istituzioni rimarranno deidentificati durante lo studio.

Problemi imprevisti Eventuali problemi imprevisti verranno immediatamente segnalati al comitato di revisione etica specifica del sito dal personale di ricerca designato.