Stockholm3 Validatiestudie in een multi-etnisch cohort (SEPTA)

Studieontwerp en -procedures:

De onderzoekscoördinator licht de informatie in de toestemming toe. Bovendien zal het bloed van de patiënt worden afgenomen voorafgaand aan hun biopsie.

Voorafgaand aan de biopsie zal bloed worden verzameld in x2 ethyleendiaminetetra-azijnzuur (EDTA) 4 ml buisjes na toestemming van de proefpersonen. Eén buisje wordt onmiddellijk gecentrifugeerd (10 minuten bij 2000G) en het plasma wordt gedecanteerd in een buisje zonder toevoegingen (dit levert meestal 1,5 ml plasma op). De gedecanteerde buis (met plasma) en de resterende EDTA-buis (met volbloed) worden vervolgens ingevroren en opgeslagen op de aangewezen locatie van de deelnemende instelling. Het wordt opgeslagen bij -20 graden Celsius tot het wordt verzonden.

Patiëntgegevens worden opgeslagen in een REDCap-database, gehost op de beveiligde server van Zweden. Gegevens worden bewaard voor de duur van het onderzoek en 5 jaar daarna voor data-analysedoeleinden.

Toegestane patiënten worden gevolgd door patiëntenlogboeken van elke deelnemende instelling. Het nummer van het medische dossier wordt verzameld om een ​​consistente identificatie te behouden voor het verzamelen van gegevens door personeel op sleutelposities. Zodra alle patiëntgegevens zijn geregistreerd, worden de gegevens geëxporteerd uit REDCap waarbij het MRN wordt verwijderd. Er zullen geen patiënt-ID's worden gebruikt in het Karolinska Instituut of het A23-lab. De volgende PHI- en niet-PHI-informatie wordt van de patiënt gelogd:

PHI:

Medisch dossiernummer (MRN)

Niet-PHI Demografische gegevens

• Stockholm3 Identificatienummer
• Race
• Postcode

Klinische gegevens

• Totaal PSA
• Leeftijd op bemonsteringsdatum [jaar]
• Familiegeschiedenis van prostaatkanker
• Gebruik van 5-alfa-reductaseremmers
• Eerdere biopsie uitgevoerd
• Prostaatvolume [Prostaatvolume als maat bij US]
• Digitale rectale onderzoeksstatus [goedaardig/normaal, nodule/verharding gevoeld, asymmetrie, niet uitgevoerd]

EN

Uitkomstgegevens - Resultaten van biopsie uitgevoerd onmiddellijk na bloedvenapunctie, d.w.z.:

Resultaten zullen worden gescheiden in gerichte biopsiekernen en systematische biopsiekernen

• Gleasonscore 1
• Gleasonscore 2
• Gleason som
• Kankerlengte (mm) (totaal en hoogste graad)
• Aantal kernen
• Aantal positieve kernen
• Tijd om biopsie uit te voeren na bloedafname [dagen]
• Resultaten van MRI, d.w.z. Rapportage- en gegevenssysteem voor prostaatbeeldvorming (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Toegestaan ​​gebruik:

Om de Stockholm3-test uit te voeren die is gedefinieerd door Gronberg et al AND Ancestry informatieve genetische markers

Monsters worden voor analyse verzonden naar het laboratorium in Uppsala (A23 Laboratory) in Zweden. Elke patiënt krijgt twee bloedmonsters (plasma en volbloed) en wordt ingevroren bij -20 graden Celsius. De bloedmonsters zullen vervolgens worden getest op kwantitatieve niveaus van serumeiwitniveaus en DNA zal worden geëxtraheerd uit witte bloedcellen en zal worden getest op gen- en kleine nucleotide polymorfe (SNP's) kiembaanmutaties en varianten.

Genotypering zal worden uitgevoerd met behulp van aangepaste genotyperingsassays. Plasma zal worden gebruikt voor eiwitanalyse. Plasma-eiwitanalyse zal worden uitgevoerd met behulp van aangepaste eiwittesten, waaronder totaal en vrij PSA, humaan glandulair kallikreïne 2 (hK2), microseminoproteïne-beta (MSMB) en macrofaagremmend cytokine 1 (MIC-1). PSA zal worden getest met een commerciële test.

Op basis van de resultaten van de plasma-eiwitanalyse, de genetische analyse en klinische gegevens wordt de Stockholm3 Risk Score berekend. De monsters van de deelnemers zullen worden behandeld in overeenstemming met de voorschriften van Zweden in het laboratorium in Uppsala, Zweden.

De resultaten van de tests worden niet gedeeld met de patiënt, noch zullen de resultaten medische beslissingen veranderen of beïnvloeden.

Verwachte risico's/voordelen

Verwachte risico's:

Aangezien dit een retrospectieve analyse is van geanonimiseerde patiëntinformatie en geanonimiseerde biospecimens, zijn er weinig verwachte risico's. Een schending van de vertrouwelijkheid en verlies van privacy zijn mogelijk, maar er zal alles aan worden gedaan om dit risico tot een minimum te beperken.

Verwachte voordelen:

Deelnemers zullen wetenschappelijke en klinische kennis vergroten. Deelnemers ontvangen ook een kleine vergoeding voor de tijd en betrokkenheid bij het onderzoek.

Procedures voor gegevensverzameling en -beheer

Deze studie zal gebruik maken van REDCap (Research Electronic Data Capture), een softwaretoolset en workflowmethodologie voor het elektronisch verzamelen en beheren van klinische en onderzoeksgegevens, om gegevens te verzamelen en op te slaan. De afdeling Informatietechnologie (KI-IT) van het Karolinska Instituut zal worden gebruikt als centrale locatie voor gegevensverwerking en -beheer. REDCap wordt gehost door KI-IT in het Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Zweden 17165)

Gegevensanalyse

De data-analyse zal worden uitgevoerd door de PI, mede-onderzoekers en/of belangrijk onderzoekspersoneel.

Kwaliteitscontrole en kwaliteitsborging

Sleutelonderzoekspersoneel is verantwoordelijk om ervoor te zorgen dat alle verzamelde gegevens voldoen aan het protocol.

Gegevens- en veiligheidsbewaking

Deze studie is een minimaal risico en er zal alles aan worden gedaan om ervoor te zorgen dat er geen schendingen van de vertrouwelijkheid en geen verlies van privacy zijn.

Statistische overwegingen

Power-analyse Dit onderzoek wordt uitgevoerd op verschillende sites en er zal dus een gepoolde analyse worden uitgevoerd. Op basis van het ontwikkelde raamwerk geeft een tweezijdige alfa van 0,05, 250 mannen in elke etniciteit 80% vermogen om 10 procentpunten verschillen in gevoeligheid en/of specificiteit van de Stockholm3-test tussen verschillende etniciteiten te detecteren. Gepoolde gegevens van verschillende sites zullen een vergelijking mogelijk maken tussen niet-Spaanse blanke, Afrikaans/zwarte, Aziatische en Latijns-Amerikaanse blanke mannen. Binnen elke etniciteitsgroep van 250 mannen geeft dezelfde steekproefomvang een vermogen van 90% voor het detecteren van verschillen in oppervlakte onder curve (AUC) tussen Stockholm3 en PSA voor het detecteren van PC die ten minste 10 procentpunten bedragen (primair doel).

Doelopbouw is 500 mannen binnen elk ras/etniciteit, tussentijdse analyse wordt uitgevoerd wanneer 250 mannen in elk ras/etniciteit zijn ingeschreven.

Gegevensanalyse Beschrijvende univariate statistieken zullen worden gebruikt om groepen te vergelijken. Binaire eindpunten zullen worden beoordeeld met een logistisch regressiemodel. Statistische analyse omvat logistische regressiemodellering, AUC-berekening, kalibratieanalyses en berekening van basisprestatiekenmerken (gevoeligheid, specificiteit en voorspellende waarden).

Regelgevende vereisten

Geïnformeerde toestemming De deelnemers geven hun toestemming om deel te nemen aan het onderzoek door geïnformeerde toestemming te ondertekenen voor toegang tot medische dossiers, het uitvoeren van genetisch onderzoek en het ondergaan van venapunctie voor bloedmonsters.

Vertrouwelijkheid van het onderwerp Gegevens die voor dit onderzoek worden gebruikt, worden opgeslagen in REDCaps en alle gegevens die tussen instellingen worden uitgewisseld, blijven gedurende het onderzoek geanonimiseerd.

Onvoorziene problemen Onvoorziene problemen zullen onmiddellijk worden gemeld aan de locatiespecifieke ethische beoordelingsraad door aangewezen onderzoekspersoneel.