Étude de validation de Stockholm3 dans une cohorte multiethnique (SEPTA)

Conception et procédures de l'étude :

Le coordinateur de recherche expliquera les informations contenues dans le consentement. De plus, le sang du patient sera prélevé avant sa biopsie.

Avant la biopsie, le sang sera prélevé dans x2 tubes d'acide éthylènediaminetétraacétique (EDTA) de 4 ml après avoir obtenu le consentement des sujets. Un tube sera immédiatement centrifugé (10 minutes à 2000G) et le plasma décanté dans un tube sans additif (cela produit typiquement 1,5 ml de plasma). Le tube décanté (avec du plasma) et le tube EDTA restant (avec du sang total) sont ensuite congelés et stockés au site institutionnel participant désigné. Il sera stocké à -20 Celsius jusqu'à son expédition.

Les données des patients seront stockées dans une base de données REDCap, hébergée sur le serveur sécurisé de la Suède. Les données seront conservées pendant toute la durée de l'étude et 5 ans après à des fins d'analyse des données.

Les patients consentants seront suivis par les registres des patients de chaque institution participante. Le numéro de dossier médical sera collecté pour conserver un identifiant cohérent pour la collecte de données par le personnel clé du site. Une fois toutes les données du patient enregistrées, les données seront exportées de REDCap avec le MRN supprimé. Aucun identifiant de patient ne sera utilisé à l'Institut Karolinska ou au laboratoire A23. Les informations PHI et non-PHI suivantes seront enregistrées sur le patient :

PHI :

Numéro de dossier médical (MRN)

Données démographiques non-ISP

• Stockholm3 Numéro d'identification
• Course
• Code postal

Donnée clinique

• PSA total
• Âge à la date de prélèvement [ans]
• Antécédents familiaux de cancer de la prostate
• Utilisation d'inhibiteurs de la 5-alpha réductase
• Biopsie effectuée plus tôt
• Volume de la prostate [volume de la prostate mesuré avec US]
• État du toucher rectal [Bénin/normal, Nodule/induration ressenti, Asymétrie, Non réalisé]

ET

Données sur les résultats - Résultats de la biopsie réalisée immédiatement après la ponction veineuse sanguine, c'est-à-dire :

Les résultats seront séparés en carottes de biopsie ciblées et carottes de biopsie systématique

• Score de Gleason 1
• Score de Gleason 2
• Somme de Gleason
• Longueur du cancer (mm) (total et grade le plus élevé)
• Nombres de coeurs
• Nombre de noyaux positifs
• Temps pour effectuer une biopsie après prélèvement sanguin [jours]
• Résultats de l'IRM, c'est-à-dire Système de rapports et de données sur l'imagerie de la prostate (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Utilisation autorisée :

Pour exécuter le test de Stockholm3 défini par Gronberg et al ET les marqueurs génétiques informatifs d'ascendance

Les échantillons seront expédiés au laboratoire basé à Uppsala (Laboratoire A23) en Suède pour analyse. Chaque patient aura deux échantillons de sang (plasma et sang total) et sera congelé à -20 Celsius. Les échantillons de sang seront ensuite testés pour les niveaux quantitatifs des niveaux de protéines sériques et l'ADN sera extrait des globules blancs et sera testé pour les mutations et les variantes de la lignée germinale polymorphe des gènes et des petits nucléotides (SNP) .

Le génotypage sera effectué à l'aide de tests de génotypage personnalisés. Le plasma sera utilisé pour l'analyse des protéines. L'analyse des protéines plasmatiques sera effectuée à l'aide d'un test de protéines personnalisé comprenant le PSA total et libre, la kallikréine glandulaire humaine 2 (hK2), la microséminoprotéine bêta (MSMB) et la cytokine inhibitrice des macrophages 1 (MIC-1). Le PSA sera testé avec un test commercial.

Sur la base des résultats de l'analyse des protéines plasmatiques, de l'analyse génétique et des données cliniques, le Stockholm3 Risk Score sera calculé. Les échantillons des participants seront traités conformément à la réglementation suédoise au laboratoire basé à Uppsala, en Suède.

Les résultats des tests ne seront pas partagés avec le patient, et les résultats ne changeront pas ou n'auront pas d'impact sur les décisions médicales.

Risques/Bénéfices attendus

Risques anticipés :

Comme il s'agit d'une analyse rétrospective d'informations anonymisées sur des patients ainsi que d'échantillons biologiques anonymisés, il y a peu de risques anticipés. Une violation de la confidentialité ainsi qu'une perte de vie privée sont possibles, mais tous les efforts seront faits pour minimiser ce risque.

Bénéfices attendus :

Les participants feront progresser les connaissances scientifiques et cliniques. Les participants recevront également un petit paiement pour le temps et la participation à l'étude.

Procédures de collecte et de gestion des données

Cette étude utilisera REDCap (Research Electronic Data Capture), un ensemble d'outils logiciels et une méthodologie de flux de travail pour la collecte et la gestion électroniques des données cliniques et de recherche, afin de collecter et de stocker des données. Le département des technologies de l'information de l'Institut Karolinska (KI-IT) servira de lieu central pour le traitement et la gestion des données. REDCap est hébergé par KI-IT dans le Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Suède 17165)

L'analyse des données

L'analyse des données sera effectuée par le PI, les co-chercheurs et/ou le personnel de recherche clé.

Contrôle de la qualité et assurance de la qualité

Le personnel de recherche clé sera chargé de s'assurer que toutes les données recueillies respectent le protocole.

Surveillance des données et de la sécurité

Cette étude présente un risque minimal et tous les efforts seront déployés pour s'assurer qu'il n'y a pas de violation de la confidentialité ni de perte de vie privée.

Considérations statistiques

Analyse de puissance Cette étude est menée sur plusieurs sites et donc une analyse groupée sera réalisée. Sur la base du cadre développé, un alpha bilatéral de 0,05, 250 hommes de chaque ethnie donne 80 % de puissance pour détecter des différences de 10 points de pourcentage dans la sensibilité et/ou la spécificité du test de Stockholm3 entre différentes ethnies. Les données regroupées de plusieurs sites permettront une comparaison entre les hommes blancs non hispaniques, africains/noirs, asiatiques et hispaniques blancs. Au sein de chaque groupe ethnique de 250 hommes, la même taille d'échantillon donne une puissance de 90 % pour détecter des différences d'aire sous la courbe (AUC) entre Stockholm3 et PSA pour la détection de PC qui sont d'au moins 10 points de pourcentage (objectif principal).

L'accumulation d'objectifs est de 500 hommes au sein de chaque race/ethnie, une analyse intermédiaire sera effectuée lorsque 250 hommes de chaque race/ethnie seront inscrits.

Analyse des données Des statistiques univariées descriptives seront utilisées pour comparer les groupes. Les paramètres binaires seront évalués à l'aide d'un modèle de régression logistique. L'analyse statistique impliquera la modélisation de régression logistique, le calcul de l'ASC, les analyses d'étalonnage et le calcul des caractéristiques de performance de base (sensibilité, spécificité et valeurs prédictives).

Exigences réglementaires

Consentement éclairé Les participants indiquent leur consentement à participer à l'étude en signant des consentements éclairés pour accéder aux dossiers médicaux, mener des recherches génétiques et subir une ponction veineuse pour des échantillons de sang.

Confidentialité du sujet Les données utilisées pour cette étude seront stockées dans REDCaps et toutes les données transférées entre les institutions resteront anonymisées tout au long de l'étude.

Problèmes imprévus Tout problème imprévu sera immédiatement signalé au comité d'examen éthique propre au site par le personnel de recherche désigné.