Stockholm3 Validációs tanulmány egy többnemzetiségű kohorszban (SEPTA)

A tanulmány tervezése és eljárásai:

A kutatási koordinátor elmagyarázza a hozzájárulásban foglalt információkat. Ezenkívül a biopszia előtt vért vesznek a páciensből.

A biopszia előtt az alanyok beleegyezése után vért vesznek 2 x 4 ml-es etilén-diamin-tetraecetsav (EDTA) csövekbe. Az egyik csövet azonnal centrifugálják (10 percig 2000 G-vel), és a plazmát adalékanyagok nélkül dekantálják egy csőbe (ez általában 1,5 ml plazmát eredményez). A dekantált csövet (plazmával) és a maradék EDTA csövet (teljes vérrel) lefagyasztják és a kijelölt részt vevő intézményi helyen tárolják. Kiszállításig -20 Celsius fokon tároljuk.

A betegek adatait egy REDCap adatbázisban tárolják, amely Svédország biztonságos szerverén található. Az adatokat a vizsgálat időtartama alatt, majd azt követően 5 évig tároljuk adatelemzés céljából.

A beleegyező betegeket minden résztvevő intézmény betegnaplók alapján követi nyomon. A kórlapszámot összegyűjtjük, hogy konzisztens azonosító legyen a telephely kulcsfontosságú személyzete által végzett adatgyűjtéshez. Az összes betegadat rögzítése után az adatok exportálásra kerülnek a REDCapból az MRN eltávolításával. A Karolinska Intézetben vagy az A23 laboratóriumban nem fognak betegazonosítókat használni. A következő PHI és nem PHI információk kerülnek naplózásra a páciensről:

PHI:

Orvosi nyilvántartás száma (MRN)

Nem PHI demográfiai adatok

• Stockholm3 Azonosító szám
• Verseny
• Irányítószám

Klinikai adatok

• Összes PSA
• Életkor a mintavétel napján [év]
• Prosztatarák a családban
• 5-alfa-reduktáz inhibitorok alkalmazása
• Korábban biopsziát végeztek
• Prosztata térfogata [prosztata térfogata az Egyesült Államokkal mérve]
• Digitális rektális vizsgálat állapota [Jóindulatú/normál, Göb/induráció érezhető, Aszimmetria, Nem végezték el]

ÉS

Eredményadatok – A vérvétel után közvetlenül végzett biopszia eredményei, azaz:

Az eredményeket célzott biopsziás magokra és szisztematikus biopsziás magokra osztják

• Gleason-pontszám 1
• Gleason pontszáma 2
• Gleason Sum
• A rák hossza (mm) (teljes és legmagasabb fokozat)
• Magok száma
• Pozitív magok száma
• A vérvétel utáni biopszia elvégzésének ideje [nap]
• Az MRI eredményei, i.e. Prostate Imaging Reporting & Data System (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Engedélyezett felhasználás:

A Gronberg és munkatársai által meghatározott Stockholm3 teszt futtatása AND Ancestry informatív genetikai markerek

A mintákat a svédországi uppsalai laboratóriumba (A23 Laboratory) szállítják elemzés céljából. Minden betegnek két vérmintája (plazma és teljes vér) lesz, és -20 Celsius fokon lefagyasztják. A vérmintákat ezután megvizsgálják a szérumfehérje szintjének kvantitatív szintjére, a DNS-t kivonják a fehérvérsejtekből, és megvizsgálják a gén- és kis nukleotid-polimorf (SNP-k) csíravonal mutációit és változatait.

A genotipizálást egyedi genotipizálási tesztekkel végezzük. A fehérjeanalízishez plazmát használnak. A plazmafehérje-analízist egyedi fehérjevizsgálatokkal végezzük, beleértve a teljes és szabad PSA-t, a humán mirigy kallikreint 2-t (hK2), a mikroszeminoprotein-béta-t (MSMB) és a makrofág-gátló citokin 1-et (MIC-1). A PSA-t kereskedelmi forgalomban kapható assay-vel fogják tesztelni.

A plazmafehérje-analízis eredményei, a genetikai elemzés és a klinikai adatok alapján számítják ki a Stockholm3 kockázati pontszámot. A résztvevők mintáit a svédországi előírásoknak megfelelően a svédországi uppsalai laboratóriumban kezelik.

A vizsgálatok eredményeit nem osztják meg a pácienssel, és az eredmények nem változtatnak és nem befolyásolják az orvosi döntéseket.

Várható kockázatok/előnyök

Várható kockázatok:

Mivel ez az azonosítatlan betegek információinak, valamint az azonosítatlan biomintáknak retrospektív elemzése, kevés a várható kockázat. A titoktartás megsértése, valamint a magánélet elvesztése lehetséges, azonban minden erőfeszítést megtesznek ennek a kockázatnak a minimalizálása érdekében.

Várható előnyök:

A résztvevők továbbfejlesztik a tudományos és klinikai ismereteket. A résztvevők egy kis összeget is kapnak a vizsgálatban töltött időért és részvételért.

Adatgyűjtési és -kezelési eljárások

Ez a tanulmány a REDCap (Research Electronic Data Capture) szoftvert és munkafolyamat-módszert fogja használni a klinikai és kutatási adatok elektronikus gyűjtésére és kezelésére, az adatok gyűjtésére és tárolására. A Karolinska Institute Informatikai (KI-IT) Osztálya az adatfeldolgozás és -kezelés központi helyszíne lesz. A REDCap házigazdája a KI-IT a Biomedicumban (Solnavägen 9, Solna, Svédország 17165)

Adatelemzés

Az adatok elemzését a PI, a társkutatók és/vagy a kulcsfontosságú kutatószemélyzet végzi.

Minőségellenőrzés és minőségbiztosítás

A kulcsfontosságú kutatószemélyzet felelős azért, hogy minden összegyűjtött adat megfeleljen a protokollnak.

Adat- és biztonsági felügyelet

Ez a tanulmány minimális kockázatot jelent, és minden erőfeszítést megtesznek annak érdekében, hogy ne sértsék meg a titoktartást, és ne sérüljenek a magánélet.

Statisztikai megfontolások

Teljesítményelemzés Ezt a vizsgálatot több helyszínen végzik, így összevont elemzést fognak végezni. A kidolgozott keretrendszer alapján egy kétoldalú alfa 0,05, 250 férfi minden etnikumban 80%-os teljesítményt ad a Stockholm3 teszt érzékenységében és/vagy specifitásában 10 százalékpontos különbség kimutatására a különböző etnikumok között. A több oldalról származó egyesített adatok lehetővé teszik a nem spanyol fehér, afrikai/fekete, ázsiai és spanyol ajkú fehér férfiak összehasonlítását. Minden 250 férfiból álló etnikai csoporton belül ugyanaz a mintanagyság 90%-os teljesítményt ad a Stockholm3 és a PSA közötti görbe alatti terület (AUC) legalább 10 százalékpontos különbségeinek kimutatására a PC kimutatására (elsődleges cél).

A kitűzött cél 500 férfi fajonként/etnikai hovatartozáson belül, időközi elemzésre akkor kerül sor, ha minden fajból/etnikumból 250 férfit neveznek be.

Adatelemzés A csoportok összehasonlításához leíró egyváltozós statisztikákat használunk. A bináris végpontokat logisztikus regressziós modellel értékeljük. A statisztikai elemzés magában foglalja a logisztikus regressziós modellezést, az AUC-számítást, a kalibrációs elemzéseket és az alapvető teljesítményjellemzők kiszámítását (érzékenység, specificitás és prediktív értékek).

Szabályozási követelmények

Tájékozott beleegyezés A résztvevők beleegyezését fejezik ki a vizsgálatban való részvételhez, és aláírják az orvosi feljegyzésekhez való hozzáférést, a genetikai kutatásokat és a vérminták vénapunkcióját.

Az alanyok bizalmas kezelése A tanulmányhoz használt adatokat a REDCaps tárolja, és az intézmények között továbbított összes adat a vizsgálat során azonosítatlan marad.

Váratlan problémák A kijelölt kutatószemélyzet minden váratlan problémát azonnal jelenteni fog a helyszín-specifikus etikai felülvizsgálati bizottságnak.