Stockholm3-Validierungsstudie in einer multiethnischen Kohorte (SEPTA)

Studiendesign und -verfahren:

Der Forschungskoordinator erläutert die in der Einwilligung enthaltenen Informationen. Zusätzlich wird dem Patienten vor der Biopsie Blut entnommen.

Vor der Biopsie wird Blut in x2 Ethylendiamintetraessigsäure (EDTA) 4 ml-Röhrchen gesammelt, nachdem die Zustimmung der Probanden eingeholt wurde. Ein Röhrchen wird sofort zentrifugiert (10 Minuten bei 2000 G) und das Plasma in ein Röhrchen ohne Zusätze dekantiert (dies ergibt typischerweise 1,5 ml Plasma). Das dekantierte Röhrchen (mit Plasma) und das verbleibende EDTA-Röhrchen (mit Vollblut) werden dann eingefroren und an der benannten teilnehmenden Einrichtung gelagert. Es wird bis zum Versand bei -20 Grad Celsius gelagert.

Patientendaten werden in einer REDCap-Datenbank gespeichert, die auf Schwedens sicherem Server gehostet wird. Die Daten werden für die Dauer der Studie und 5 Jahre danach für Datenanalysezwecke gespeichert.

Eingewilligte Patienten werden von jeder teilnehmenden Einrichtung anhand von Patientenprotokollen nachverfolgt. Die Krankenaktennummer wird erfasst, um eine konsistente Kennung für die Datenerfassung durch das Schlüsselpersonal vor Ort zu erhalten. Sobald alle Patientendaten erfasst sind, werden die Daten aus REDCap exportiert, wobei die MRN entfernt wird. Am Karolinska-Institut oder im A23-Labor werden keine Patientenkennungen verwendet. Die folgenden PHI- und Nicht-PHI-Informationen werden vom Patienten protokolliert:

PHI:

Krankenaktennummer (MRN)

Nicht-PHI Demografische Daten

• Stockholm3 Identifikationsnummer
• Wettrennen
• Postleitzahl

Klinische Daten

• Gesamt-PSA
• Alter am Stichtag [Jahre]
• Familiengeschichte von Prostatakrebs
• Verwendung von 5-Alpha-Reduktase-Hemmern
• Frühere Biopsie durchgeführt
• Prostatavolumen [Prostatavolumen als Maß mit US]
• Status der digitalen rektalen Untersuchung [gutartig/normal, Knötchen/Induration spürbar, Asymmetrie, nicht durchgeführt]

UND

Ergebnisdaten - Ergebnisse einer Biopsie, die unmittelbar nach der Blutvenenpunktion durchgeführt wurde, d. h.:

Die Ergebnisse werden in gezielte Biopsiekerne und systematische Biopsiekerne unterteilt

• Gleason-Punktzahl 1
• Gleason-Punktzahl 2
• Gleason-Summe
• Krebslänge (mm) (gesamt und höchster Grad)
• Anzahl der Kerne
• Anzahl positiver Kerne
• Zeit zur Durchführung der Biopsie nach der Blutentnahme [Tage]
• Ergebnisse aus MRT, d.h. Berichts- und Datensystem für Prostatabildgebung (PIRADS) (0, 1, 2, 3, 4, 5)

Zulässige Nutzung:

Zur Durchführung des von Gronberg et al. definierten Stockholm3-Tests UND informativer genetischer Marker von Ancestry

Die Proben werden zur Analyse an das Labor in Uppsala (A23 Laboratory) in Schweden geschickt. Jedem Patienten werden zwei Blutproben (Plasma und Vollblut) entnommen und bei -20 Grad Celsius eingefroren. Die Blutproben werden dann auf quantitative Spiegel der Serumproteinspiegel getestet und DNA wird aus weißen Blutkörperchen extrahiert und auf Gen- und kleine Nukleotid-polymorphe (SNPs) Keimbahnmutationen und -varianten getestet .

Die Genotypisierung wird mit benutzerdefinierten Genotypisierungsassays durchgeführt. Plasma wird für die Proteinanalyse verwendet. Die Plasmaproteinanalyse wird unter Verwendung eines benutzerdefinierten Proteinassays durchgeführt, einschließlich Gesamt- und freiem PSA, humanem Drüsenkallikrein 2 (hK2), Mikroseminoprotein-beta (MSMB) und Makrophagen-hemmendem Zytokin 1 (MIC-1). PSA wird mit einem kommerziellen Assay getestet.

Basierend auf den Ergebnissen der Plasmaproteinanalyse, der genetischen Analyse und der klinischen Daten wird der Stockholm3 Risk Score berechnet. Die Proben der Teilnehmer werden gemäß den schwedischen Vorschriften im Labor in Uppsala, Schweden behandelt.

Die Ergebnisse der Tests werden weder mit dem Patienten geteilt, noch werden die Ergebnisse medizinische Entscheidungen ändern oder beeinflussen.

Erwartete Risiken/Nutzen

Erwartete Risiken:

Da es sich um eine retrospektive Analyse anonymisierter Patientendaten sowie anonymisierter Bioproben handelt, sind nur wenige Risiken zu erwarten. Eine Verletzung der Vertraulichkeit sowie ein Verlust der Privatsphäre sind möglich, es werden jedoch alle Anstrengungen unternommen, um dieses Risiko zu minimieren.

Erwartete Vorteile:

Die Teilnehmer erweitern wissenschaftliche und klinische Kenntnisse. Die Teilnehmer erhalten außerdem eine kleine Vergütung für die Zeit und das Engagement in der Studie.

Verfahren zur Datenerhebung und -verwaltung

Diese Studie wird REDCap (Research Electronic Data Capture) verwenden, ein Software-Toolset und eine Workflow-Methodik für die elektronische Erfassung und Verwaltung von klinischen und Forschungsdaten, um Daten zu sammeln und zu speichern. Die Abteilung für Informationstechnologie des Karolinska-Instituts (KI-IT) wird als zentraler Ort für die Datenverarbeitung und -verwaltung genutzt. REDCap wird von KI-IT im Biomedicum (Solnavägen 9, Solna, Schweden 17165) gehostet

Datenanalyse

Die Datenanalyse wird vom PI, den Co-Ermittlern und/oder dem wichtigsten Forschungspersonal durchgeführt.

Qualitätskontrolle und Qualitätssicherung

Wichtiges Forschungspersonal ist dafür verantwortlich, dass alle gesammelten Daten dem Protokoll entsprechen.

Daten- und Sicherheitsüberwachung

Diese Studie ist ein minimales Risiko und es werden alle Anstrengungen unternommen, um sicherzustellen, dass es keine Vertraulichkeitsverletzungen sowie keinen Verlust der Privatsphäre gibt.

Statistische Überlegungen

Leistungsanalyse Diese Studie wird an mehreren Standorten durchgeführt und daher wird eine gepoolte Analyse durchgeführt. Basierend auf dem entwickelten Framework ergibt ein zweiseitiges Alpha von 0,05, 250 Männer in jeder ethnischen Zugehörigkeit, eine Aussagekraft von 80 %, um 10 Prozentpunkte Unterschiede in der Sensitivität und/oder Spezifität des Stockholm3-Tests über verschiedene ethnische Zugehörigkeiten hinweg zu erkennen. Gepoolte Daten von mehreren Standorten ermöglichen einen Vergleich zwischen nicht-hispanischen weißen, afrikanischen/schwarzen, asiatischen und hispanischen weißen Männern. Innerhalb jeder ethnischen Gruppe von 250 Männern ergibt die gleiche Stichprobengröße eine 90 %ige Aussagekraft für die Erkennung von Unterschieden in der Fläche unter der Kurve (AUC) zwischen Stockholm3 und PSA für die Erkennung von PC, die mindestens 10 Prozentpunkte betragen (primäres Ziel).

Die Ansammlung von Zielen beträgt 500 Männer pro Rasse/Ethnie, eine Zwischenanalyse wird durchgeführt, wenn 250 Männer pro Rasse/Ethnie gemeldet sind.

Datenanalyse Zum Vergleich von Gruppen werden deskriptive univariate Statistiken verwendet. Binäre Endpunkte werden mit einem logistischen Regressionsmodell bewertet. Die statistische Analyse umfasst eine logistische Regressionsmodellierung, AUC-Berechnung, Kalibrierungsanalysen und die Berechnung grundlegender Leistungsmerkmale (Sensitivität, Spezifität und Vorhersagewerte).

Regulatorischen Anforderungen

Einverständniserklärung Die Teilnehmer erklären ihr Einverständnis zur Teilnahme an der Studie, indem sie Einverständniserklärungen für den Zugang zu Krankenakten, die Durchführung genetischer Forschung und die Durchführung einer Venenpunktion für Blutproben unterzeichnen.

Vertraulichkeit der Probanden Die für diese Studie verwendeten Daten werden in REDCaps gespeichert und alle Daten, die zwischen Institutionen übertragen werden, bleiben während der gesamten Studie anonymisiert.

Unvorhergesehene Probleme Alle unvorhergesehenen Probleme werden von ausgewiesenem Forschungspersonal unverzüglich dem standortspezifischen Ethikprüfungsgremium gemeldet.