环状和非编码 RNA 作为胰腺胆管癌临床上有用的生物标志物 (CIRCUS)
- 定义 PDAC 中的 circRNA 表达谱并识别失调的 circRNA 候选者。 这些将在进一步的组织样本中得到验证。
- 评估候选 circRNA 在血液(血浆样本)中的表达作为临床相关的诊断生物标志物;扩展主要目标以包括其他诊断特征,例如特异性、接受者操作曲线下的面积、阳性预测值和阴性预测值。
- 探索候选circRNAs和相关分子在患者生物材料(包括组织、血液、胆汁和活检样本)中的表达,作为诊断的生物标志物;预测;与临床病理特征和生存结果的关联;以及他们预测/监测治疗反应的能力,例如 手术和/或化疗。
- 利用基于计算机的分析来描述候选 circRNA 在人类 PDAC 中肿瘤细胞产生的完整 RNA 和相关分子(称为“转录组”)中的理论相互作用。
研究概览
详细说明
该项目的第一步是“发现实验”,用于描述 8 个 PDAC 组织样本与对照相比的表达谱;随后对候选 circRNA 进行验证:
PDAC 肿瘤组织和相关正常胰腺组织的 8 对样本将在手术时(胰腺肿瘤切除后)收集。 将分析 circRNA 的表达水平,并选择最显着失调的候选 circRNA(在该决定中也考虑其他数据集和当前文献)。
该项目的第二步是一项前瞻性非干预性观察性队列研究,以进一步研究这些候选 circRNA:
这些候选 circRNA 表达水平的表达将在血液样本中的 PDAC 患者的整个临床时间线上纵向测量;以及胆汁、组织和活检样本(当临床取样后可以安全获取且无需额外调查时)。 这将与患有良性胆道疾病和其他胆道癌的对照患者进行比较。 这些控制仅适用于血液测试,如果进行胆囊切除术,则适用于胆汁。 血液检查将与临床血液一起进行,或在外科手术麻醉后进行,当胆汁超出临床要求时,将在胆囊结石病切除胆囊后进行胆汁检查。
将描述每个 circRNA 作为诊断、预后和预测生物标志物的能力,并与 CA 19-9(目前在 PDAC 中被广泛接受的唯一生物标志物)进行比较。 这将首先在血液样本中考虑,然后在其他患者生物材料中考虑。
该项目的最后一部分将是对候选 circRNA 进行计算机和实验室评估,以提出其分子关系以及如何解释和描述关联。
生物信息学审查将能够通过计算确定候选 circRNA 的 miRNA 结合能力,以及受调节的下游 mRNA。 差异表达基因的基因本体论和 KEGG 通路富集分析将允许对 PDAC 中 circRNA 调控下的转录组进行全局观察。
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Kate Penhaligon
- 电话号码:01483 688 660
- 邮箱:k.penhaligon@nhs.net
学习地点
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Guildford、英国、GU2 7XX
- 招聘中
- Royal Surrey County Hospital
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 能够给予知情同意的参与者
- 年龄 >18 岁
排除标准:
- 不愿意或不能提供书面知情同意
- 不会说英语
- 已知怀孕
- 年龄 <18 岁
- 已知的 HIV 或乙型/丙型肝炎病毒诊断
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
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胰腺癌
在 MDT 对患者进行疑似胰腺导管腺癌 (PDAC) 评估,通过放射学检查(例如
内镜超声(EUS)、内镜逆行胆管造影(ERCP)、横断面成像)、血清肿瘤标志物(即
CA 19-9),或其他诊断程序
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控制
诊断和/或将接受良性病理手术的患者(例如
胆结石、慢性胰腺炎等);或诊断为癌前病变的患者(例如
胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤);胰腺神经内分泌肿瘤,或胆道癌(即
胆管癌;胆囊癌;壶腹癌)
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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用于诊断的circRNA
大体时间:12个月
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鉴定能够诊断胰腺导管腺癌 (PDAC) 且灵敏度高于血清 CA 19-9 的血浆 circRNA“特征”
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12个月
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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描述circRNA表达谱
大体时间:12个月
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定义和验证 PDAC 中的 circRNA 表达谱,并识别失调的 circRNA 候选者。
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12个月
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血液circRNA的诊断特征
大体时间:12个月
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评估候选 circRNA 在血液(血浆)中的表达作为临床相关的诊断生物标志物;扩展主要目标以包括其他诊断特征,例如特异性、接受者操作曲线下的面积、阳性预测值和阴性预测值
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12个月
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其他生物材料中的circRNA
大体时间:30个月
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探索候选 circRNA 和相关分子在患者生物材料(包括组织、血液、胆汁和活检样本)中的表达,作为诊断的生物标志物;预测;与临床病理特征和生存结果的关联;以及他们预测/监测治疗反应的能力(即
手术和/或化疗)。
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30个月
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生物信息学
大体时间:18个月
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利用基于计算机的分析来描述候选 circRNA 在人类 PDAC 转录组中的理论相互作用。
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18个月
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:C A Limb, MBBS MRes、The Royal Surrey NHS Foundation Trust
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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