Zirkuläre und nicht-kodierende RNAs als klinisch nützliche Biomarker bei pankreatikobiliären Krebserkrankungen (CIRCUS)
- Definieren Sie das circRNA-Expressionsprofil in PDAC und identifizieren Sie dysregulierte circRNA-Kandidaten. Diese werden in weiteren Gewebeproben validiert.
- Bewertung der circRNA-Expression in Blut (Plasmaproben) als klinisch relevanter diagnostischer Biomarker; Erweiterung des primären Ziels um andere diagnostische Merkmale wie Spezifität, Fläche unter der Receiver-Operator-Kurve, positiver Vorhersagewert und negativer Vorhersagewert.
- Untersuchung der Expression von circRNA-Kandidaten und verwandten Molekülen in Biomaterialien von Patienten (einschließlich Gewebe-, Blut-, Gallen- und Biopsieproben) als Biomarker für die Diagnose; Prognose; Assoziation mit klinisch-pathologischen Merkmalen und Überlebensergebnissen; und ihre Fähigkeit, das Ansprechen auf die Behandlung vorherzusagen/zu überwachen, z. Operation und/oder Chemotherapie.
- Verwenden Sie computergestützte Analysen, um die theoretischen Wechselwirkungen von circRNA-Kandidaten innerhalb des vollständigen Komplements von RNA und verwandten Molekülen zu beschreiben, die von den Tumorzellen, dem so genannten „Transkriptom“, im menschlichen PDAC produziert werden.
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Dieser erste Schritt dieses Projekts ist ein „Entdeckungsexperiment“, um die Expressionsprofile von 8 PDAC-Gewebeproben im Vergleich zu Kontrollen zu beschreiben; mit anschließender Validierung von Kandidaten-circRNAs:
Zum Zeitpunkt der Operation (nach Resektion des Pankreastumors) werden 8 gepaarte Proben von PDAC-Tumorgewebe und zugehörigem normalem Pankreasgewebe entnommen. Die Expressionsniveaus von circRNAs werden profiliert und die am stärksten dysregulierten circRNAs-Kandidaten werden ausgewählt (auch unter Berücksichtigung anderer Datensätze und der aktuellen Literatur in dieser Entscheidung).
Der zweite Schritt dieses Projekts ist eine prospektive, nicht-interventionelle, beobachtende Kohortenstudie, um diese circRNA-Kandidaten weiter zu untersuchen:
Die Expression dieser Kandidaten-circRNAs-Expressionsniveaus wird im Verlauf der klinischen Zeitachse von Patienten mit PDAC in Blutproben gemessen; und in Gallen-, Gewebe- und Biopsieproben (wenn dies nach klinischer Probenahme und ohne zusätzliche Untersuchungen sicher verfügbar ist). Dies wird mit Kontrollpatienten mit gutartiger Gallenerkrankung und anderen Gallengangskrebsarten verglichen. Diese Kontrollen wären nur für Blutuntersuchungen und, wenn sich einer Cholezystektomie unterzieht, Galle verfügbar. Blutuntersuchungen werden zusammen mit klinischem Blut oder nach Anästhesie für chirurgische Eingriffe durchgeführt, Galle wird nach Entfernung der Gallenblase bei Gallensteinerkrankungen entnommen, wenn dies über die klinischen Anforderungen hinausgeht.
Die Fähigkeit jeder circRNA als diagnostische, prognostische und prädiktive Biomarker wird beschrieben und mit CA 19-9 verglichen (dem einzigen Biomarker, der derzeit in PDAC weithin akzeptiert ist). Dies wird zuerst in Blutproben und dann in anderen Biomaterialien von Patienten berücksichtigt.
Der letzte Teil des Projekts besteht darin, sowohl eine Computer- als auch eine Laborbewertung von circRNA-Kandidaten durchzuführen, um ihre molekularen Beziehungen vorzuschlagen und zu erklären, wie dies erklärt und Assoziationen beschrieben werden können.
Eine bioinformatische Überprüfung wird die Möglichkeit geben, die miRNA-Bindungsfähigkeiten von circRNA-Kandidaten und die nachgeschalteten regulierten mRNAs rechnerisch zu bestimmen. Geneontologische und KEGG Pathway Enrichment-Analysen der differentiell exprimierten Gene werden einen globalen Überblick über das Transkriptom unter circRNA-Regulierung in PDAC ermöglichen.
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
- Name: Kate Penhaligon
- Telefonnummer: 01483 688 660
- E-Mail: k.penhaligon@nhs.net
Studienorte
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Guildford, Vereinigtes Königreich, GU2 7XX
- Rekrutierung
- Royal Surrey County Hospital
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Teilnehmer, die in der Lage sind, eine Einverständniserklärung abzugeben
- Alter >18 Jahre
Ausschlusskriterien:
- Nicht willens oder nicht in der Lage, eine schriftliche Einverständniserklärung abzugeben
- Nicht englischsprachig
- Bekanntlich schwanger
- Alter <18 Jahre
- Bekannte Diagnose von HIV oder Hepatitis B/C-Virus
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
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Bauchspeicheldrüsenkrebs
Patienten, die am MDT auf Verdacht auf duktales Adenokarzinom des Pankreas (PDAC) untersucht werden, mittels radiologischer Untersuchung (z.
endoskopischer Ultraschall (EUS), endoskopische retrograde Cholangiographie (ERCP), Querschnittsbildgebung), Serumtumormarker (d. h.
CA 19-9) oder andere diagnostische Verfahren
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Kontrolle
Patienten, bei denen eine gutartige Pathologie diagnostiziert wurde und/oder die sich einer Operation unterziehen soll (z.
Gallensteine, chronische Pankreatitis usw.); oder Patienten mit der Diagnose einer prämalignen Läsion (z.
intraduktales papilläres muzinöses Neoplasma der Bauchspeicheldrüse); Neuroendokriner Tumor der Bauchspeicheldrüse oder ein Krebs der Gallenwege (d. h.
Cholangiokarzinom; Gallenblasenkrebs; Ampullenkrebs)
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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CircRNAs für die Diagnose
Zeitfenster: 12 Monate
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Identifizierung einer Plasma-circRNA-'Signatur', die in der Lage ist, Pankreas-Duktal-Adenokarzinom (PDAC) mit überlegener Sensitivität als Serum-CA 19-9 zu diagnostizieren
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12 Monate
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
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Beschreiben Sie das Expressionsprofil von circRNAs
Zeitfenster: 12 Monate
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Definieren und validieren Sie das circRNA-Expressionsprofil in PDAC und identifizieren Sie dysregulierte circRNA-Kandidaten.
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12 Monate
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Diagnostische Merkmale von Blut-circRNAs
Zeitfenster: 12 Monate
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Bewerten Sie die Expression von circRNA-Kandidaten im Blut (Plasma) als klinisch relevanten diagnostischen Biomarker; Erweiterung des primären Ziels um andere diagnostische Merkmale wie Spezifität, Fläche unter der Receiver-Operator-Kurve, positiver Vorhersagewert und negativer Vorhersagewert
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12 Monate
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circRNAs in anderen Biomaterialien
Zeitfenster: 30 Monate
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Untersuchung der Expression von circRNA-Kandidaten und verwandten Molekülen in Biomaterialien von Patienten (einschließlich Gewebe-, Blut-, Gallen- und Biopsieproben) als Biomarker für die Diagnose; Prognose; Assoziation mit klinisch-pathologischen Merkmalen und Überlebensergebnissen; und ihre Fähigkeit, das Ansprechen auf die Behandlung vorherzusagen/zu überwachen (d. h.
Operation und/oder Chemotherapie).
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30 Monate
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Bioinformatik
Zeitfenster: 18 Monate
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nutzen computerbasierte Analysen, um die theoretischen Wechselwirkungen von circRNA-Kandidaten innerhalb des Transkriptoms in menschlichem PDAC zu beschreiben.
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18 Monate
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Mitarbeiter und Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: C A Limb, MBBS MRes, The Royal Surrey NHS Foundation Trust
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (TATSÄCHLICH)
Primärer Abschluss (ERWARTET)
Studienabschluss (ERWARTET)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (TATSÄCHLICH)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (TATSÄCHLICH)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
- IRAS 277406
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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