膵胆道癌における臨床的に有用なバイオマーカーとしての CIRcular および非コード RNA (CIRCUS)

このプロジェクトのこの最初のステップは、コントロールと比較した 8 つの PDAC 組織サンプルの発現プロファイルを説明する「発見実験」です。候補circRNAのその後の検証:

PDAC腫瘍組織と関連する正常な膵臓組織の8つの対のサンプルが、手術時に収集されます（膵臓腫瘍が切除された後）。 circRNAの発現レベルがプロファイリングされ、最も著しく調節不全の候補circRNAが選択されます（この決定では、他のデータセットと現在の文献も考慮されます）。

このプロジェクトの 2 番目のステップは、これらの候補 circRNA をさらに調査するための前向き非介入観察コホート研究です。

これらの候補circRNAの発現レベルは、血液サンプル中のPDAC患者の臨床タイムライン全体で縦方向に測定されます。および胆汁、組織、および生検サンプル（臨床サンプリング後、追加の調査なしで安全に入手できる場合）。 これは、良性胆道疾患および他の胆道癌の対照患者と比較されます。 これらのコントロールは、血液検査にのみ利用でき、胆嚢摘出術を受ける場合は胆汁にのみ利用できます。 血液検査は、臨床血液と一緒に、または外科的処置のための麻酔後に行われ、胆石症のために胆嚢の除去後に胆汁が採取されますが、これが臨床的要件を超える場合.

診断、予後、および予測バイオマーカーとしての各circRNAの能力について説明し、CA 19-9（現在PDACで広く受け入れられている唯一のバイオマーカー）と比較します。 これは、最初に血液サンプルで考慮され、次に他の患者の生体材料で考慮されます。

プロジェクトの最後の部分は、その分子関係と、これがどのように説明され、関連付けが説明されるかを提案するために、候補circRNAのコンピューターと実験室の両方の評価を行うことです。

バイオインフォマティカル レビューにより、候補 circRNA の miRNA 結合能力と、制御される下流の mRNA をコンピューターで決定することが可能になります。 差次的に発現する遺伝子の遺伝子オントロジーおよび KEGG 経路濃縮分析により、PDAC での circRNA 制御下のトランスクリプトームのグローバル ビューが可能になります。