ARN circulaires et non codants comme biomarqueurs cliniquement utiles dans les cancers pancréaticobiliaires (CIRCUS)
- Définir le profil d'expression de circRNA dans PDAC et identifier les candidats circRNA dérégulés. Ceux-ci seront validés dans d'autres échantillons de tissus.
- Évaluer l'expression candidate de circARN dans le sang (échantillons de plasma) en tant que biomarqueur de diagnostic cliniquement pertinent ; développer l'objectif principal pour inclure d'autres caractéristiques de diagnostic telles que la spécificité, l'aire sous la courbe récepteur-opérateur, la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative.
- Explorer l'expression des circARN candidats et des molécules apparentées dans les biomatériaux des patients (y compris les échantillons de tissus, de sang, de bile et de biopsie) en tant que biomarqueurs pour le diagnostic ; pronostic; association avec les caractéristiques clinico-pathologiques et les résultats de survie ; et leur capacité à prédire/surveiller la réponse au traitement, par ex. Chirurgie et/ou chimiothérapie.
- Utiliser des analyses informatisées pour décrire les interactions théoriques des circARN candidats dans le complément complet de l'ARN et des molécules apparentées produites par les cellules tumorales, appelées le « transcriptome », dans le PDAC humain.
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
Description détaillée
Cette première étape de ce projet est une « expérience de découverte » pour décrire les profils d'expression de 8 échantillons de tissus PDAC par rapport aux témoins ; avec validation ultérieure des circARN candidats :
8 échantillons appariés de tissu tumoral PDAC et de tissu pancréatique normal associé seront prélevés au moment de la chirurgie (après la résection de la tumeur pancréatique). Les niveaux d'expression des circARN seront profilés et les circARN candidats les plus significativement dérégulés seront choisis (en tenant également compte d'autres ensembles de données et de la littérature actuelle dans cette décision).
La deuxième étape de ce projet est une étude de cohorte observationnelle prospective non interventionnelle pour étudier plus en détail ces candidats circRNA :
L'expression de ces niveaux d'expression de circARN candidats sera mesurée longitudinalement tout au long de la chronologie clinique des patients atteints de PDAC dans des échantillons de sang ; et dans les échantillons de bile, de tissus et de biopsie (lorsque ceux-ci sont disponibles en toute sécurité après le prélèvement clinique et sans investigations supplémentaires). Cela sera comparé à des patients témoins atteints d'une maladie biliaire bénigne et d'autres cancers des voies biliaires. Ces contrôles ne seraient disponibles que pour les tests sanguins et, en cas de cholécystectomie, la bile. Des tests sanguins seront prélevés parallèlement aux analyses de sang cliniques ou après l'anesthésie pour les interventions chirurgicales, la bile sera prélevée après l'ablation de la vésicule biliaire pour la maladie des calculs biliaires lorsque cela dépasse les exigences cliniques.
La capacité de chaque circARN en tant que biomarqueur diagnostique, pronostique et prédictif sera décrite et comparée au CA 19-9 (le seul biomarqueur actuellement largement accepté dans la PDAC). Cela sera d'abord pris en compte dans les échantillons de sang, puis dans d'autres biomatériaux de patients.
La dernière partie du projet consistera à entreprendre une évaluation à la fois informatique et en laboratoire des circARN candidats afin de proposer ses relations moléculaires et comment cela peut expliquer et décrire les associations.
Un examen bioinformatique permettra de déterminer par calcul les capacités de liaison aux miARN des circARN candidats et les ARNm en aval régulés. L'ontologie génique et les analyses d'enrichissement de la voie KEGG des gènes exprimés de manière différentielle permettront une vue globale du transcriptome sous la régulation du circARN dans le PDAC.
Type d'étude
Inscription (Anticipé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Kate Penhaligon
- Numéro de téléphone: 01483 688 660
- E-mail: k.penhaligon@nhs.net
Lieux d'étude
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Guildford, Royaume-Uni, GU2 7XX
- Recrutement
- Royal Surrey County Hospital
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Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
Accepte les volontaires sains
Sexes éligibles pour l'étude
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
Critère d'intégration:
- Participants capables de donner un consentement éclairé
- >18 ans
Critère d'exclusion:
- Refus ou incapacité de fournir un consentement éclairé écrit
- Non anglophone
- Connue pour être enceinte
- <18 ans
- Diagnostic connu du VIH ou du virus de l'hépatite B/C
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Cancer du pancréas
Patients évalués à la PCT pour suspicion d'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC), via un test radiologique (par ex.
échographie endoscopique (EUS), cholangiographie rétrograde endoscopique (ERCP), imagerie en coupe), marqueur tumoral sérique (c.-à-d.
CA 19-9), ou autre procédure de diagnostic
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Contrôle
Les patients diagnostiqués et/ou devant subir une intervention chirurgicale pour une pathologie bénigne (par ex.
calculs biliaires, pancréatite chronique, etc.) ; ou les patients avec un diagnostic de lésion pré-cancéreuse (par ex.
néoplasme mucineux papillaire intracanalaire pancréatique); Tumeur neuroendocrine du pancréas ou cancer des voies biliaires (c.-à-d.
cholangiocarcinome; cancer de la vésicule biliaire; cancer ampullaire)
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Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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circARN pour le diagnostic
Délai: 12 mois
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Identifier une « signature » de circRNA plasmatique capable de diagnostiquer l'adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC) avec une sensibilité supérieure à celle du CA 19-9 sérique
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12 mois
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Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
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Décrire le profil d'expression des circARN
Délai: 12 mois
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Définir et valider le profil d'expression de circRNA dans PDAC et identifier les candidats circRNA dérégulés.
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12 mois
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Caractéristiques diagnostiques des circARN sanguins
Délai: 12 mois
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Évaluer l'expression du circARN candidat dans le sang (plasma) en tant que biomarqueur de diagnostic cliniquement pertinent ; développer l'objectif principal pour inclure d'autres caractéristiques de diagnostic, telles que la spécificité, l'aire sous la courbe récepteur-opérateur, la valeur prédictive positive et la valeur prédictive négative
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12 mois
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circARN dans d'autres biomatériaux
Délai: 30 mois
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Explorer l'expression des circARN candidats et des molécules apparentées dans les biomatériaux des patients (y compris les échantillons de tissus, de sang, de bile et de biopsie) en tant que biomarqueurs pour le diagnostic ; pronostic; association avec les caractéristiques clinico-pathologiques et les résultats de survie ; et leur capacité à prédire/surveiller la réponse au traitement (c.
chirurgie et/ou chimiothérapie).
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30 mois
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Bioinformatique
Délai: 18 mois
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tilise des analyses informatisées pour décrire les interactions théoriques des circARN candidats au sein du transcriptome dans le PDAC humain.
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18 mois
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Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: C A Limb, MBBS MRes, The Royal Surrey NHS Foundation Trust
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (RÉEL)
Achèvement primaire (ANTICIPÉ)
Achèvement de l'étude (ANTICIPÉ)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (RÉEL)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (RÉEL)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
Termes liés à cette étude
Termes MeSH pertinents supplémentaires
Autres numéros d'identification d'étude
- IRAS 277406
Plan pour les données individuelles des participants (IPD)
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Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude
Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine
Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine
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