Pyöreät ja ei-koodaavat RNA:t kliinisesti hyödyllisinä biomarkkereina haimasyövissä (CIRCUS)
- Määrittele circRNA-ekspressioprofiili PDAC:ssa ja tunnista epäsäännellyt sircRNA-ehdokkaat. Nämä validoidaan muissa kudosnäytteissä.
- Arvioi ehdokas cirRNA-ekspressio veressä (plasmanäytteet) kliinisesti merkityksellisenä diagnostisena biomarkkerina; päätavoitteen laajentaminen sisältämään muita diagnostisia ominaisuuksia, kuten spesifisyys, vastaanottimen operaattorikäyrän alla oleva pinta-ala, positiivinen ennustearvo ja negatiivinen ennustearvo.
- Tutkia ehdokascirrRNA:iden ja niihin liittyvien molekyylien ilmentymistä potilaan biomateriaaleissa (mukaan lukien kudos-, veri-, sappi- ja biopsianäytteet) diagnoosin biomarkkereina; ennustus; yhteys kliinis-patologisiin piirteisiin ja eloonjäämistuloksiin; ja niiden kyky ennustaa/seurata hoitovastetta esim. leikkaus ja/tai kemoterapia.
- Hyödynnä tietokonepohjaisia analyyseja kuvaamaan ehdokkaiden sircRNA:iden teoreettisia vuorovaikutuksia RNA:n ja siihen liittyvien molekyylien täydellisessä komplementissa, jota kasvainsolut tuottavat, nimeltään "transkriptomi", ihmisen PDAC:ssa.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Ehdot
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämä tämän projektin ensimmäinen vaihe on "löytökoe", jolla kuvataan 8 PDAC-kudosnäytteen ilmentymisprofiileja verrokkeihin verrattuna; myöhemmällä ehdokascirRNA:iden validoinnilla:
8 parinäytettä PDAC-kasvainkudoksesta ja siihen liittyvästä normaalista haimakudoksesta kerätään leikkauksen yhteydessä (kun haimakasvain on resektoitu). SircRNA:iden ilmentymistasot profiloidaan ja valitaan merkittävimmin säädellyt ehdokascirRNA:t (ottaen huomioon myös muut tietojoukot ja tämän päätöksen nykyinen kirjallisuus).
Tämän projektin toinen vaihe on prospektiivinen ei-interventiivinen havainnointikohorttitutkimus näiden ehdokkaiden sircRNA:iden tutkimiseksi edelleen:
Näiden ehdokkaiden sircRNA-ilmentymistasojen ilmentyminen mitataan pitkittäin koko kliinisen aikajanan potilailla, joilla on PDAC verinäytteissä; sekä sappi-, kudos- ja biopsianäytteissä (kun tämä on turvallisesti saatavilla kliinisen näytteenoton jälkeen ja ilman lisätutkimuksia). Tätä verrataan verrokkipotilaisiin, joilla on hyvänlaatuinen sappisairaus ja muita sappiteiden syöpiä. Nämä kontrollit olisivat käytettävissä vain verikokeita ja, jos heille tehdään kolekystektomia, sappeen. Verikokeet otetaan kliinisen veren rinnalla tai nukutuksen jälkeen kirurgisia toimenpiteitä varten, sappirakon poistamisen jälkeen sappikivitaudin varalta, kun se ylittää kliiniset vaatimukset.
Kunkin sircRNA:n kyky diagnostisena, prognostisena ja ennustavana biomarkkerina kuvataan ja sitä verrataan CA 19-9:ään (ainoa biomarkkeri, joka on tällä hetkellä laajalti hyväksytty PDAC:ssa). Tämä otetaan ensin huomioon verinäytteissä ja sitten muissa potilaan biomateriaaleissa.
Projektin viimeinen osa on suorittaa sekä tietokone- että laboratorioarviointi ehdokkaiden sircRNA:ista, jotta voidaan ehdottaa sen molekyylisuhteita ja sitä, miten tämä voi selittää ja kuvailla assosiaatioita.
Bioinformaattinen katsaus antaa kyvyn määrittää laskennallisesti ehdokascirRNA:iden miRNA-sitoutumiskyvyt ja säädellyt alavirran mRNA:t. Erilaisesti ilmentyneiden geenien geeniontologia ja KEGG-reitin rikastusanalyysit mahdollistavat globaalin kuvan PDAC:n sirrRNA-säätelyn alaisena olevasta transkriptistä.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
- Nimi: Kate Penhaligon
- Puhelinnumero: 01483 688 660
- Sähköposti: k.penhaligon@nhs.net
Opiskelupaikat
-
-
-
Guildford, Yhdistynyt kuningaskunta, GU2 7XX
- Rekrytointi
- Royal Surrey County Hospital
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Osallistujat, jotka pystyvät antamaan tietoisen suostumuksen
- Ikä > 18 vuotta
Poissulkemiskriteerit:
- Ei halua tai ei pysty antamaan kirjallista tietoon perustuvaa suostumusta
- Ei-englanninkielinen
- Tiedetään olevan raskaana
- Ikä <18 vuotta
- Tunnettu HIV- tai hepatiitti B/C -virus
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
|---|
|
Haimasyöpä
Potilaat, joita arvioidaan MDT:ssä epäillyn haimatiehyen adenokarsinooman (PDAC) varalta radiologisella testillä (esim.
endoskooppinen ultraääni (EUS), endoskooppinen retrogradinen kolangiografia (ERCP), poikkileikkauskuvaus, seerumin kasvainmarkkeri (ts.
CA 19-9) tai muu diagnostinen toimenpide
|
|
Ohjaus
Potilaat, joilla on diagnosoitu ja/tai joutuvat joutumaan leikkaukseen hyvänlaatuisen patologian vuoksi (esim.
sappikivet, krooninen haimatulehdus jne.); tai potilaat, joilla on diagnosoitu esipahanlaatuinen leesio (esim.
haiman intraduktaalinen papillaarinen limakasvain); Haiman neuroendokriininen kasvain tai sappiteiden syöpä (ts.
kolangiokarsinooma; sappirakon syöpä; ampullisyöpä)
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
sircRNA:t diagnoosia varten
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Tunnistaa plasman sircRNA:n "allekirjoitus", joka pystyy diagnosoimaan haiman kanavan adenokarsinooman (PDAC) herkemmin kuin seerumin CA 19-9
|
12 kuukautta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Kuvaile sircRNA:iden ilmentymisprofiilia
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Määrittele ja validoi circRNA:n ilmentymisprofiili PDAC:ssa ja tunnista epäsäädellyt circRNA-ehdokkaat.
|
12 kuukautta
|
|
Veren circRNA:iden diagnostiset ominaisuudet
Aikaikkuna: 12 kuukautta
|
Arvioi ehdokas sircRNA-ekspressio veressä (plasmassa) kliinisesti merkityksellisenä diagnostisena biomarkkerina; päätavoitteen laajentaminen sisältämään muita diagnostisia ominaisuuksia, kuten spesifisyys, vastaanottimen käyttäjäkäyrän alla oleva pinta-ala, positiivinen ennustearvo ja negatiivinen ennustearvo
|
12 kuukautta
|
|
sircRNA:t muissa biomateriaaleissa
Aikaikkuna: 30 kuukautta
|
Tutki piiri-RNA-ehdokkaiden ja niihin liittyvien molekyylien ilmentymistä potilaan biomateriaaleissa (mukaan lukien kudos-, veri-, sappi- ja biopsianäytteet) diagnoosin biomarkkereina; ennustus; yhteys kliinis-patologisiin piirteisiin ja eloonjäämistuloksiin; ja heidän kykynsä ennustaa/seurata hoitovastetta (esim.
leikkaus ja/tai kemoterapia).
|
30 kuukautta
|
|
Bioinformatiikka
Aikaikkuna: 18 kuukautta
|
laatia tietokonepohjaisia analyyseja kuvaamaan ehdokascirRNA:iden teoreettisia vuorovaikutuksia transkriptomissa ihmisen PDAC:ssa.
|
18 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: C A Limb, MBBS MRes, The Royal Surrey NHS Foundation Trust
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (TODELLINEN)
Ensisijainen valmistuminen (ODOTETTU)
Opintojen valmistuminen (ODOTETTU)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- IRAS 277406
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .