CIRkulární a nekódující RNA jako klinicky užitečné biomarkery u pankreatobiliárních rakovin (CIRCUS)
- Definujte profil exprese circRNA v PDAC a identifikujte dysregulované kandidáty circRNA. Ty budou validovány v dalších vzorcích tkání.
- Vyhodnoťte kandidátní expresi circRNA v krvi (vzorky plazmy) jako klinicky relevantní diagnostický biomarker; rozšíření primárního cíle o další diagnostické vlastnosti, jako je specifičnost, oblast pod křivkou operátora přijímače, pozitivní prediktivní hodnota a negativní prediktivní hodnota.
- Prozkoumat expresi kandidátních circRNA a příbuzných molekul v biomateriálech pacientů (včetně tkání, krve, žluči a bioptických vzorků) jako biomarkery pro diagnostiku; prognóza; souvislost s klinicko-patologickými rysy a výsledky přežití; a jejich schopnost předvídat/monitorovat odpověď na léčbu, např. chirurgie a/nebo chemoterapie.
- Využijte počítačové analýzy k popisu teoretických interakcí kandidátských circRNA v rámci úplného komplementu RNA a příbuzných molekul produkovaných nádorovými buňkami, nazývaných „transkriptom“, v lidském PDAC.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Tento první krok tohoto projektu je „experimentem objevu“ k popisu expresních profilů 8 vzorků tkáně PDAC ve srovnání s kontrolami; s následnou validací kandidátních circRNA:
V době operace (po resekci nádoru slinivky) bude odebráno 8 párových vzorků nádorové tkáně PDAC a související normální tkáně slinivky břišní. Hladiny exprese circRNA budou profilovány a budou vybrány nejvýrazněji dysregulované kandidátní circRNA (také s ohledem na jiné soubory dat a současnou literaturu v tomto rozhodnutí).
Druhým krokem tohoto projektu je prospektivní neintervenční observační kohortová studie k dalšímu zkoumání těchto kandidátních circRNA:
Exprese těchto kandidátních hladin exprese circRNAs bude měřena podélně v průběhu klinické časové linie pacientů s PDAC ve vzorcích krve; a ve vzorcích žluči, tkáně a biopsie (pokud je to bezpečně dostupné po klinickém odběru vzorků a bez dalších vyšetření). To bude porovnáno s kontrolními pacienty s benigním onemocněním žlučových cest a jinými rakovinami žlučových cest. Tyto kontroly by byly k dispozici pouze pro krevní testy a v případě cholecystektomie pro žluč. Krevní testy budou odebírány spolu s klinickou krví nebo po anestezii pro chirurgické zákroky, žluč bude odebrána po odstranění žlučníku pro onemocnění žlučových kamenů, pokud to překračuje klinické požadavky.
Schopnost každé circRNA jako diagnostického, prognostického a prediktivního biomarkeru bude popsána a porovnána s CA 19-9 (jediný biomarker, který je v současné době široce akceptován v PDAC). To bude nejprve zohledněno ve vzorcích krve a poté v dalších biomateriálech pacientů.
Poslední částí projektu bude provedení počítačového i laboratorního vyhodnocení kandidátních circRNA s cílem navrhnout jejich molekulární vztahy a jak to lze vysvětlit a popsat asociace.
Bioinformatický přehled poskytne schopnost výpočetně určit schopnosti kandidátských circRNA vázat miRNA a regulované downstream mRNA. Gene-ontologie a analýzy obohacení KEGG dráhy odlišně exprimovaných genů umožní globální pohled na transkriptom pod regulací circRNA v PDAC.
Typ studie
Zápis (Očekávaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Kate Penhaligon
- Telefonní číslo: 01483 688 660
- E-mail: k.penhaligon@nhs.net
Studijní místa
-
-
-
Guildford, Spojené království, GU2 7XX
- Nábor
- Royal Surrey County Hospital
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Pohlaví způsobilá ke studiu
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Účastníci schopní dát informovaný souhlas
- Věk >18 let
Kritéria vyloučení:
- Neochota nebo neschopnost poskytnout písemný informovaný souhlas
- Neanglicky mluvící
- Je známo, že je těhotná
- Ve věku <18 let
- Známá diagnóza HIV nebo viru hepatitidy B/C
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Rakovina slinivky
Pacienti, kteří jsou na MDT hodnoceni na podezření na duktální adenokarcinom pankreatu (PDAC), pomocí radiologického testu (např.
endoskopický ultrazvuk (EUS), endoskopická retrográdní cholangiografie (ERCP), průřezové zobrazení), sérový nádorový marker (tj.
CA 19-9), nebo jiný diagnostický postup
|
|
Řízení
Pacienti, u kterých byla diagnostikována a/nebo podstoupit operaci pro benigní patologii (např.
žlučové kameny, chronická pankreatitida atd.); nebo pacientů s diagnózou premaligní léze (např.
pankreatický intraduktální papilární mucinózní novotvar); Neuroendokrinní nádor pankreatu nebo rakovina žlučových cest (tj.
cholangiokarcinom; rakovina žlučníku; ampulární rakovina)
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
circRNA pro diagnostiku
Časové okno: 12 měsíců
|
Identifikovat „podpis“ cirkulární plazmy, který je schopen diagnostikovat duktální adenokarcinom slinivky (PDAC) s vyšší citlivostí než sérový CA 19-9
|
12 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Popište profil exprese circRNA
Časové okno: 12 měsíců
|
Definujte a ověřte profil exprese circRNA v PDAC a identifikujte dysregulované kandidáty circRNA.
|
12 měsíců
|
|
Diagnostické vlastnosti krevních circRNA
Časové okno: 12 měsíců
|
Vyhodnotit kandidátní expresi circRNA v krvi (plazmě) jako klinicky relevantní diagnostický biomarker; rozšíření primárního cíle o další diagnostické funkce, jako je specifičnost, oblast pod křivkou operátora přijímače, pozitivní prediktivní hodnota a negativní prediktivní hodnota
|
12 měsíců
|
|
circRNA v jiných biomateriálech
Časové okno: 30 měsíců
|
Prozkoumat expresi kandidátských circRNA a příbuzných molekul v biomateriálech pacientů (včetně tkání, krve, žluči a bioptických vzorků) jako biomarkery pro diagnostiku; prognóza; souvislost s klinicko-patologickými rysy a výsledky přežití; a jejich schopnost předvídat/monitorovat odpověď na léčbu (tj.
operace a/nebo chemoterapie).
|
30 měsíců
|
|
Bioinformatika
Časové okno: 18 měsíců
|
tilise počítačové analýzy k popisu teoretických interakcí kandidátních circRNAs v rámci transkriptomu v lidském PDAC.
|
18 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: C A Limb, MBBS MRes, The Royal Surrey NHS Foundation Trust
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (AKTUÁLNÍ)
Primární dokončení (OČEKÁVANÝ)
Dokončení studie (OČEKÁVANÝ)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (AKTUÁLNÍ)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (AKTUÁLNÍ)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- IRAS 277406
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .