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UW 未确诊遗传病计划

2023年10月18日 更新者:University of Wisconsin, Madison
这项研究的主要目的是发现罕见孟德尔疾病的新致病基因,其次要目的包括诊断患有以前未通过常规临床手段诊断出的罕见遗传疾病的人,更多地了解遗传疾病的病理生物学,并开发新的诊断技术和分析。 将在大约 5 年的时间内招募 500 名患有未确诊和疑似遗传疾病的参与者。

研究概览

详细说明

估计有 10,000 种罕见的孟德尔遗传疾病影响了十二分之一的个体。 重要的是,这些疾病中有超过一半具有已知的遗传原因。 这留下了数以千计的疾病基因等待被发现,数百万受影响的人没有得到诊断。 研究人员将通过使用基因组测序和其他组学技术来评估综合临床检查未能做出诊断的患者,从而解决基因组医学中的这些关键问题。 假设是,经过精心挑选,这些未确诊的疾病患者将成为发现新疾病基因的丰富资源。

这项研究是 UW 未确诊疾病计划 (UW-UDP) 的研究部门。 本研究的主要目的是发现新的疾病基因并扩展罕见孟德尔疾病的已知表型。 次要目标是:a) 诊断未使用常规临床手段诊断出的遗传性疾病患者,并为他们提供可操作的知识来管理他们的疾病; b) 提高​​我们对遗传疾病病理学以及基因组变异与疾病之间关系的理解; c) 开发和试验新的诊断技术和分析。

这些目标将通过三个目标实现:

目标 1:通过使用三重短读基因组测序和与罕见疾病数据库 GeneMatcher 和 MatchMaker Exchange 的数据共享,确定疑似未确诊遗传病的个体的候选疾病变异。

目标 2:通过使用新的“组学技术和生物信息学算法”进一步评估目标 1 中未诊断出的个体。 这些方法包括 a) 基于超长读取从头组装的基因组测序; b) RNA 序列; c) 表观基因组学分析,和 d) 染色质组织的构象分析。

目标 3:通过与威斯康星大学和外部模式生物研究人员的合作,对目标 1 和目标 2 中发现的选定候选疾病基因和基因组变异进行功能评估。 这些努力将通过使用与加拿大罕见疾病模型和机制网络数据库以及新兴的全球模型生物研究数据库网络相关联的威斯康星大学模式生物研究数据库来促进。

该研究项目与 UW-UDP 对未确诊患者的综合临床评估紧密结合。 标准的临床护理部分包括患者转诊、收集和就诊前医疗记录评估,以及在研究开始时进行广泛表型分析的门诊就诊,以及在研究结束时返回结果。 研究工作流程包括基因组测序、与全球疾病基因发现网络共享数据,以及确定通过基因检测发现的变异的因果关系的后续研究。 这项研究将促进对遗传疾病病理生物学的理解,改进临床诊断,并帮助诊断和管理威斯康星州内外以前未确诊的罕见疾病患者。

研究类型

观察性的

注册 (估计的)

500

联系人和位置

本节提供了进行研究的人员的详细联系信息,以及有关进行该研究的地点的信息。

学习联系方式

学习地点

    • Wisconsin
      • Madison、Wisconsin、美国、53705
        • 招聘中
        • University of Wisconsin School of Medicine and Public Health
        • 接触:
        • 首席研究员:
          • Stephen Meyn, MD PhD ABMGG
        • 首席研究员:
          • Elizabeth Petty, MD

参与标准

研究人员寻找符合特定描述的人,称为资格标准。这些标准的一些例子是一个人的一般健康状况或先前的治疗。

资格标准

适合学习的年龄

不超过 98年 (孩子、成人、年长者)

接受健康志愿者

取样方法

非概率样本

研究人群

年龄在 0-100 岁之间的所有种族和族裔的男性和女性,尽管医疗保健提供者进行了全面评估并且至少有一个客观发现,但仍患有未确诊的疾病。 受试者可以来自美国所有州,也可以来自其他国家。

描述

纳入标准:

  • 尽管医疗保健提供者进行了全面评估(包括临床基因检测),但申请人的病情仍未确诊。
  • 申请人至少有一项客观发现可能具有可识别的遗传病因。
  • 申请人可能具有当前未描述/新的遗传病症或与新基因相关的已知遗传病症。
  • 申请人/法定监护人同意在威斯康星大学未确诊疾病计划 (UW-UDP) 内外收集、存储和定期共享编码信息和生物材料,用于研究和诊断目的
  • 申请人/法定监护人同意接受基因检测的二次发现。
  • 申请人/法定监护人的英语水平足以理解同意书。

排除标准:

  • 申请人已经有了可以解释客观发现的诊断。
  • 怀疑有特定诊断,由转诊/初级保健提供者进行标准临床检查是合适的。
  • UW-UDP 不太可能改进申请人已经收到的综合检查。
  • 申请人的症状可能是多因素的或由于非遗传原因。

学习计划

本节提供研究计划的详细信息,包括研究的设计方式和研究的衡量标准。

研究是如何设计的?

设计细节

  • 观测模型:队列
  • 时间观点:预期

队列和干预

团体/队列
干预/治疗
未确诊疾病组
从同意的研究对象获得的血液或其他相关生物样本将被储存并提取 DNA 和 RNA。

初步评估从受影响个体和参与家庭成员血液中提取的 DNA 的短读长基因组测序开始(最常见的方法是三人全基因组测序,涉及受影响的儿童及其父母)。

其他评估可能包括:功能评估、动物建模、反向表型分析(可能需要临时访问)、表观遗传分析或通过与外部合作者选择性共享编码患者数据(例如,通过 Matchmaker Exchange 和 Phenome Central)进行临床数据库匹配,长期读取基因组测序、从头基因组组装、RNA 测序和新型生物信息学分析

研究衡量的是什么?

主要结果指标

结果测量
大体时间
发现的新疾病基因数量
大体时间:长达 5 年
长达 5 年
扩展的疾病基因表型数量
大体时间:长达 5 年
长达 5 年

次要结果测量

结果测量
措施说明
大体时间
5 年内确诊的参与者人数
大体时间:长达 5 年
本研究的第二个目标是诊断未使用常规临床手段诊断出的遗传性疾病患者,并为他们提供可操作的知识来管理他们的疾病。 这将作为整个研究的诊断率来衡量。
长达 5 年
每种分析技术诊断的参与者人数
大体时间:长达 5 年
本研究的第二个目的是开发和试验新的诊断技术和分析。 将评估每种新型分析技术的诊断率。
长达 5 年
按疾病表现分类的诊断率
大体时间:长达 5 年
为了提高对遗传疾病病理学以及基因组变异与疾病之间关系的理解,将报告通过疾病表现诊断的参与者人数。
长达 5 年

合作者和调查者

在这里您可以找到参与这项研究的人员和组织。

调查人员

  • 首席研究员:Stephen Meyn, MD PhD ABMGG、University of Wisconsin, Madison

研究记录日期

这些日期跟踪向 ClinicalTrials.gov 提交研究记录和摘要结果的进度。研究记录和报告的结果由国家医学图书馆 (NLM) 审查,以确保它们在发布到公共网站之前符合特定的质量控制标准。

研究主要日期

学习开始 (实际的)

2021年7月16日

初级完成 (估计的)

2025年10月1日

研究完成 (估计的)

2025年10月1日

研究注册日期

首次提交

2020年10月6日

首先提交符合 QC 标准的

2020年10月6日

首次发布 (实际的)

2020年10月14日

研究记录更新

最后更新发布 (实际的)

2023年10月19日

上次提交的符合 QC 标准的更新

2023年10月18日

最后验证

2023年10月1日

更多信息

与本研究相关的术语

其他研究编号

  • 2020-0700
  • SMPH (其他标识符:UW Madison)
  • Protocol Version 8/20/2020 (其他标识符:UW Madison)

计划个人参与者数据 (IPD)

计划共享个人参与者数据 (IPD)?

是的

IPD 计划说明

来自 UW-UDP 的数据将通过 PhenomeCentral (https://www.phenomecentral.org) 共享 和 Matchmaker Exchange (https://www.matchmakerexchange.org/)。

数据、图像和/或标本将按照 NIH 基因组数据共享政策共享,并与可能有类似患者和/或与参与者疾病相关的特定专业知识/检测的其他临床医生和研究人员共享。 在这方面,将通过我们中心的罕见疾病模型和机制网络 (http://rdmmn.biotech. wisc.edu)。 该网络有助于识别模型生物研究人员,他们愿意并且能够在功能上评估罕见疾病患者中候选疾病基因变异的致病性(详见 http://www.rare-diseases-catalyst-network.ca)。

药物和器械信息、研究文件

研究美国 FDA 监管的药品

研究美国 FDA 监管的设备产品

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