小儿实体瘤遗传改变的分子特征
实施全面的多层次分子策略来识别小儿实体瘤的遗传改变,旨在实现对患者的个性化治疗
背景:在阿根廷,中枢神经系统 (CNS) 实体瘤 (19%) 和非 CNS 实体瘤 (25%) 占儿童肿瘤的 44%。 世界卫生组织 (WHO) 2016 年的新分类包括基因组特征,包括 100 多个 CNS 肿瘤实体和亚类。 在儿童中,胶质细胞系肿瘤(神经胶质瘤)最常见,包括星形细胞瘤、室管膜瘤和少突胶质细胞瘤,而胚胎中枢神经系统肿瘤是 WHO IV 级肿瘤的异质组。 小儿软组织肿瘤 (STT) 存在准确诊断的困难,因为它们的形态学和免疫表型特征在不同的组织学模式之间重叠。
新分子技术的出现在实体瘤领域产生了巨大进步,特别是在患者群体的分子定义方面。 根据肿瘤的生物学特性,这一事实使得量身定制的治疗成为可能。
特别是在儿童中,治疗目标的确定尤为重要,因为它可以避免在成长中的儿童出现不必要的后遗症。 该项目允许基础研究组和临床研究组之间的衔接,从而巩固基础转化研究的目标,并产生关于我国小儿实体瘤发病机制的临床和基础知识。
目的:标准化和实施全面的多层次分子策略,使用中等和高度复杂的技术,检测原发性儿科实体瘤(神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤、尤文氏肉瘤家族肿瘤、软组织肉瘤和中枢神经系统肿瘤(神经胶质瘤)的分子改变和胚胎),可以应用于诊断、预后和/或使用针对分子靶标的靶向治疗,以提供量身定制的治疗机会。
材料和方法:将前瞻性地纳入儿童实体瘤病例。 根据参与中心统计,将纳入100个样本。 从每个病例中,将提供福尔马林固定活检,如果可能,还将在 -70ºC 下保存一个片段。 将从临床记录中获得临床和随访数据。
方法学途径包括:1)肿瘤谱系决定性标志物的免疫组织化学检测,其中一些具有预测价值。 2) FISH(荧光原位杂交)对涉及复发性染色体易位的基因采用分离策略,对其他不平衡结构染色体结构改变(基因或染色体片段的扩增和缺失)进行基因座特异性设计探针。 3) 实时 (RT)-聚合酶链反应 (PCR) 检测由染色体易位产生的融合转录物。 4) 定量聚合酶链反应 (qPCR) 和单核苷酸多态性 (SNP) 的 Sanger 测序分析作为治疗目标。 5) 融合、ins/del 的 Sanger 测序分析作为 RT-PCR 或 FISH(荧光原位杂交)的补充,6) 下一代测序 (NGS) 具有特定和定制的面板,包含定义肿瘤所需的所有基因'用于儿童肿瘤诊断、风险分层和预后的基因组突变概况。 然而,NGS测序只会应用于那些无法用以前的策略解决或进化不良的情况
基于上述分析,将根据 WHO 的建议开发综合分析算法,但要适应该机构的设施。 分子发现将与临床和组织学数据相关联
研究概览
地位
条件
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Maria Victoria Preciado, PhD
- 电话号码:+5491144916970
- 邮箱:mvpreciado67@gmail.com
学习地点
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Ciudad Autónoma de Buenos Aires、阿根廷、1425
- 招聘中
- Maria Victoria Preciado
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接触:
- Maria Victoria Preciado, Ph.D
- 电话号码:1144916970
- 邮箱:mvpreciado67@gmail.com
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
描述
纳入标准:
- 根据初步诊断检查和适合切除的大体疾病证据,必须疑似或已知诊断为神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤、软组织肉瘤和中枢神经系统肿瘤(神经胶质瘤和胚胎性肿瘤)。 可在以下部分或所有时间点收集标本:初始活检、肿瘤切除和可能复发时。
- 患者或其法定监护人(视情况而定)必须在为本协议移除第一次组织样本收集后 30 天内提供书面知情同意书。
- 该患者正在 Hospital de Niños R Gutierrez 或合作机构就诊。
- 患者在入组时必须小于或等于 18 岁。
排除标准:
- 无法获取肿瘤组织样本。
- 未获得书面知情同意书。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
- 观测模型:队列
- 时间观点:预期
研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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实体瘤的分子谱分析
大体时间:5年
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对神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤、尤文肉瘤家族肿瘤、软组织肉瘤和中枢神经系统肿瘤(神经胶质瘤和胚胎性肿瘤)的遗传改变进行分子鉴定
|
5年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
---|---|---|
免疫组织化学分子标记分析
大体时间:5年
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1) 对肿瘤谱系决定性标志物进行免疫组化分析,其中一些具有预测价值
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5年
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荧光原位杂交分子标记分析
大体时间:5年
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2) 对复发性染色体易位和染色体结构改变进行 FISH(荧光原位杂交)分析
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5年
|
通过基因扩增进行分子标记分析
大体时间:5年
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3) 对基因易位进行 RT-qPCR 分析,对报告的 SNP 进行 qPCR 分析
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5年
|
通过测序分析分子标记
大体时间:5年
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4) 对未解决病例的 SNP 和易位进行互补 Sanger 测序分析
|
5年
|
通过下一代测序进行分子标记分析
大体时间:5年
|
5) 使用特定和定制的 panel 进行下一代测序 (NGS),以定义对诊断、风险分层和预后很重要的肿瘤基因组突变谱
|
5年
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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小儿实体瘤的临床试验
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