Молекулярная характеристика генетических изменений в солидных опухолях у детей

Актуальность: В Аргентине солидные опухоли центральной нервной системы (ЦНС) (19%) и солидные опухоли вне ЦНС (25%) составляют 44% опухолей у детей. Новая классификация Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) 2016 года, которая включает геномную характеристику, включает более 100 опухолей ЦНС и подклассов. У детей опухоли глиального происхождения (глиомы) являются наиболее частыми и включают астроцитомы, эпендимомы и олигодендроглиомы, в то время как эмбриональные опухоли ЦНС представляют собой гетерогенную группу опухолей IV степени по ВОЗ. Опухоли мягких тканей у детей (STT) представляют трудности для точной диагностики, так как их морфологические и иммунофенотипические особенности перекрываются среди различных гистологических моделей.

Появление новых молекулярных методов привело к большому прогрессу в области солидных опухолей, особенно в молекулярном определении групп пациентов. Этот факт делает возможным индивидуальное лечение в соответствии с биологией опухоли.

В частности, у детей определение целей лечения особенно важно, поскольку это может помочь избежать нежелательных последствий у растущего ребенка. Этот проект позволяет объединить группы фундаментальных и клинических исследований, тем самым консолидируя цель фундаментальных трансляционных исследований и генерируя как клинические, так и базовые знания о патогенезе солидных опухолей у детей в нашей стране.

Цель: стандартизировать и внедрить комплексную многоуровневую молекулярную стратегию с использованием методов средней и высокой сложности для выявления молекулярных изменений в первичных солидных опухолях у детей (нейробластома, рабдомиосаркома, опухоли семейства сарком Юинга, саркомы мягких тканей и опухоли ЦНС (глиомы). и эмбриональные)), которые можно применять для диагностики, прогнозирования и/или использования таргетной терапии против молекулярных мишеней, чтобы обеспечить индивидуальную терапевтическую возможность.

Материалы и методы: Педиатрические случаи солидных опухолей будут зарегистрированы проспективно. На основании статистики участвующих центров будет включено 100 образцов. В каждом случае будет доступна биопсия, фиксированная формалином, и, по возможности, фрагмент также будет сохранен при -70ºC. Клинические и последующие данные будут получены из историй болезни.

Методологические подходы включают: 1) Иммуногистохимическое выявление маркеров детерминант опухолевого ростка, некоторые из них имеют прогностическое значение. 2) FISH (флуоресцентная гибридизация in situ) со стратегией разрыва для генов, участвующих в повторяющихся хромосомных транслокациях, и локус-специфическим дизайном зондов для других несбалансированных структурных хромосомных структурных изменений (амплификации и делеции генов или хромосомных сегментов). 3) Обнаружение в режиме реального времени (RT) с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) слитых транскриптов, возникающих в результате хромосомных транслокаций. 4) Количественная полимеразная цепная реакция (КПЦР) и анализ последовательности по Сэнгеру однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в качестве мишеней для терапии. 5) Секвенирование слияний по Сэнгеру, ins/del в качестве дополнения к RT-PCR или FISH (флуоресцентная гибридизация in situ), 6) Секвенирование нового поколения (NGS) со специальной и настроенной панелью, содержащей все необходимые гены для определения опухоли. s профиль геномных мутаций для диагностики, стратификации риска и прогнозирования опухолей у детей. Однако секвенирование NGS будет применяться только в тех случаях, которые не могли быть решены с помощью предыдущих стратегий или в случаях с плохой эволюцией.

На основе вышеуказанных анализов будет разработан комплексный алгоритм анализа в соответствии с рекомендациями ВОЗ, но адаптированный к возможностям учреждения. Молекулярные данные будут коррелированы с клиническими и гистологическими данными.