Gyermekkori szilárd daganatok genetikai változásainak molekuláris jellemzése

Háttér: Argentínában a központi idegrendszeri (CNS) szolid daganatok (19%) és a nem központi idegrendszeri szolid daganatok (25%) teszik ki a gyermekkori daganatok 44%-át. Az Egészségügyi Világszervezet (WHO) 2016-os új osztályozása, amely magában foglalja a genomi jellemzést is, több mint 100 központi idegrendszeri tumor entitást és alosztályt foglal magában. Gyermekeknél a glia vonalú daganatok (gliomák) a leggyakoribbak, és asztrocitómákat, ependimomákat és oligodendrogliomákat foglalnak magukban, míg az embrionális központi idegrendszeri daganatok a WHO IV. fokozatú daganatok heterogén csoportját alkotják. A gyermekkori lágyszöveti daganatok (STT) nehézségeket okoznak a pontos diagnózisban, mivel morfológiai és immunfenotípusos jellemzőik átfedik egymást a különböző szövettani mintázatokban.

Az új molekuláris technikák megjelenése nagy előrelépést hozott a szolid tumorok területén, különösen a betegcsoportok molekuláris meghatározásában. Ez a tény a daganat biológiájának megfelelően személyre szabott kezelést tesz lehetővé.

Különösen gyermekeknél különösen fontos a kezelési célok meghatározása, mivel ez elkerülheti a szükségtelen folytatást egy növekvő gyermekben. Ez a projekt lehetővé teszi az alap- és klinikai kutatócsoportok közötti artikulációt, megszilárdítva ezzel a transzlációs alapkutatások célját, valamint klinikai és alapvető ismereteket generálva a gyermekkori szolid tumorok patogeneziséről hazánkban.

Cél: Átfogó, többszintű molekuláris stratégia szabványosítása és megvalósítása közepes és nagy komplexitású technikákat alkalmazva a primer gyermekgyógyászati ​​szolid daganatok (neuroblasztóma, rhabdomyosarcoma, Ewing-szarkóma családba tartozó daganatok, lágyrész-szarkómák és központi idegrendszeri daganatok (gliómák)) molekuláris elváltozásainak kimutatására. és embrionális)), amelyek alkalmazhatók a diagnózisra, a prognózisra és/vagy a molekuláris célpontok elleni célzott terápiák alkalmazására, testreszabott terápiás lehetőség biztosítása érdekében.

Anyag és módszerek: A szolid daganatok gyermekgyógyászati ​​eseteit prospektíven veszik fel. A résztvevő központok statisztikái alapján 100 minta kerül bele. Minden esetben rendelkezésre áll egy formalinban fixált biopszia, és lehetőség szerint egy töredéket -70°C-on is megőriznek. A klinikai és nyomon követési adatok a klinikai feljegyzésekből származnak.

A módszertani megközelítések a következők: 1) A tumorvonalat meghatározó markerek immunhisztokémiai kimutatása, amelyek közül néhány prediktív értékű. 2) FISH (fluoreszcencia in situ hibridizáció) a visszatérő kromoszómatranszlokációban részt vevő gének széttörési stratégiájával, valamint lókusz-specifikus tervezési próbákkal más kiegyensúlyozatlan szerkezeti kromoszómaszerkezeti változásokhoz (gének vagy kromoszómaszegmensek amplifikációi és deléciói). 3) Kromoszómális transzlokációból származó fúziós transzkriptumok valós idejű (RT)-polimeráz láncreakció (PCR) detektálása. 4) Kvantitatív polimeráz láncreakció (qPCR) és egy nukleotid polimorfizmusok (SNP-k) Sanger szekvenciaanalízise a terápia célpontjaként. 5) A fúziók Sanger szekvenciaanalízise, ​​ins/del az RT-PCR vagy FISH kiegészítéseként (fluoreszcens in situ hibridizáció), 6) Next Generation Sequencing (NGS) specifikus és testreszabott panellel, amely tartalmazza a tumor meghatározásához szükséges összes gént. s genomi mutációs profil a gyermekkori daganatok diagnosztizálásához, kockázati rétegződéséhez és prognózisához. Az NGS szekvenálást azonban csak azokban az esetekben alkalmazzuk, amelyeket a korábbi stratégiákkal nem lehetett megoldani, vagy rossz fejlődésű esetekben

A fenti elemzések alapján a WHO ajánlásainak megfelelően, de az intézmény adottságaihoz igazodó integrált elemzési algoritmus kerül kidolgozásra. A molekuláris leleteket összefüggésbe kell hozni a klinikai és szövettani adatokkal