小児固形腫瘍における遺伝子変化の分子的特徴付け

背景: アルゼンチンでは、中枢神経系 (CNS) 固形腫瘍 (19%) と非 CNS 固形腫瘍 (25%) が小児腫瘍の 44% を占めています。 世界保健機関 (WHO) の 2016 年の新しい分類には、ゲノムの特徴付けが含まれており、100 を超える CNS 腫瘍実体とサブクラスで構成されています。 小児では、グリア系腫瘍（神経膠腫）が最も多く、星状細胞腫、上衣腫、希突起膠腫が含まれますが、胎児性CNS腫瘍はWHOグレードIV腫瘍の異種グループです。 小児軟部組織腫瘍（STT）は、その形態学的および免疫表現型の特徴が異なる組織学的パターン間で重複しているため、正確な診断が困難です。

新しい分子技術の出現により、固形腫瘍の分野、特に患者グループの分子定義において大きな進歩がもたらされました。 この事実により、腫瘍の生物学に応じたオーダーメイドの治療が可能になります。

特に小児では、成長期の小児における不必要な続発症を回避できる可能性があるため、治療標的の特定は特に重要です。 このプロジェクトにより、基礎研究グループと臨床研究グループの連携が可能となり、基礎トランスレーショナル研究の目的が強化され、我が国における小児固形腫瘍の病因に関する臨床知識と基礎知識の両方が生み出されます。

目的：原発性小児固形腫瘍（神経芽腫、横紋筋肉腫、ユーイング肉腫ファミリー腫瘍、軟部肉腫およびCNS腫瘍（神経膠腫）における分子変化の検出のために、中程度および高度の複雑さの技術を使用して、包括的なマルチレベルの分子戦略を標準化および実装すること）これは、診断、予後、および/または分子標的に対する標的療法の使用に適用して、カスタマイズされた治療の機会を提供することができます。

材料と方法: 固形腫瘍の小児症例は前向きに登録されます。 参加センターの統計に基づいて、100 個のサンプルが含まれます。 各ケースからホルマリン固定生検が利用可能になり、可能であれば断片も-70℃で保存されます。 臨床データと追跡データは臨床記録から取得されます。

方法論的アプローチには次のものが含まれます。 1) 腫瘍系列決定マーカーの免疫組織化学的検出 (その一部には予測値があります)。 2) 反復性​​染色体転座に関与する遺伝子のブレイクアパート戦略を備えた FISH (蛍光 in situ ハイブリダイゼーション)、およびその他の不均衡な染色体構造変化 (遺伝子または染色体セグメントの増幅および欠失) に対する遺伝子座特異的設計プローブ。 3) 染色体転座から生じる融合転写物のリアルタイム (RT) ポリメラーゼ連鎖反応 (PCR) 検出。 4) 治療の標的としての一塩基多型 (SNP) の定量的ポリメラーゼ連鎖反応 (qPCR) およびサンガー配列分析。 5) RT-PCR または FISH (蛍光 in situ ハイブリダイゼーション) を補完する融合のサンガー シーケンス解析 (ins/del)、6) 腫瘍を定義するために必要なすべての遺伝子を含む特定のカスタマイズされたパネルによる次世代シーケンス (NGS)小児腫瘍の診断、リスク層別化および予後のためのゲノム変異プロファイル。 ただし、NGS シーケンスは、以前の戦略では解決できなかった場合や進化が不十分な場合にのみ適用されます。

上記の分析に基づいて、WHO の推奨に従って、施設の設備に合わせた統合分析アルゴリズムが開発されます。 分子所見は臨床データおよび組織学的データと関連付けられます