骨髓增生异常综合征 (P-MDS) 的生物收集 (P-MDS)

生物收集的目的是响应 MDS 中的 3 个科学项目：

项目 1：具有 SF3B1 突变的 MDS 中的剪接异常：人类中大约 95% 的编码基因都受到选择性剪接的影响，这是一种复杂的、高度调控的机制，通过从单个基因定义多种蛋白质来使蛋白质组多样化。 在许多癌症和血液病中观察到剪接失调（综述 Yoshida 等人，2014 年），尤其是在骨髓增生异常综合征中。超过一半的 MDS 患者在参与 RNA 前信使剪接的基因中出现获得性突变。 SF3B1基因（剪接因子3B亚基1）编码一种参与识别3'剪接位点的蛋白，是SMD中突变频率最高的基因，频率为20-28% MDS，高达85%的骨髓增生异常冠状铁粒幼细胞综合征（Yoshida 等人，2011 年；Papaemmanuil 等人，2011 年）。 因此产生的剪接异常对 MDS 病理生理学的功能性后果远不清楚。 最近在各种获得性病理学中进行的转录组分析（通过 RNA-seq）表明，SF3B1 基因的最常见变异通过使用 3' 隐蔽剪接位点导致异常转录本的形成。 研究人员试图研究在 MDS 患者中发现的 SF3B1 突变的功能意义，特别是对牙冠铁粒幼细胞形成的影响。 研究人员希望通过 RNAseq 识别在 SF3B1 突变的 MDS 患者细胞中特异性表达的异常连接，这些连接会影响参与铁代谢或其调节的基因的转录。 为此，研究人员将使用从 SMD SF3B1WT 患者和 SF3B1K700E 患者骨髓中获得的细胞，这些细胞是在布雷斯特 CHRU CRB 的染色体遗传学实验室收集的。 然后，研究人员将分析与这些患者培养的细胞上存在这些异常连接相关的功能影响（某些蛋白质的检测、酶分析等）。 从这些感兴趣的患者那里收集生物学和临床数据对于解释结果至关重要。 该项目是研究这种病理学中各种剪接异常的更全面方法的一部分。

项目 2：MDS 中伴有 5q 缺失染色体异常的剪接异常：5 号染色体缺失是 MDS 中最常见的结构异常，如果孤立或与异常相关则构成良好的预后实体，如果与超过 3 条染色体异常相关则预后不良。 位于 5 号染色体上的两个基因编码参与前信使 RNA 剪接的复合体的蛋白质：RBM22 基因（RNA 结合基序蛋白 22）和 SLU7 基因（SLU7 同系物剪接因子）。

研究人员想要确定丢失这 2 个基因或丢失 RBM22 和保留 SLU7 的患者亚组。 一个或两个基因的丢失是否在染色体缺失的 MDS 的病理生理学中起作用，它是否与疾病的恶化有关？ 了解这些机制也可能对这种病理的治疗管理产生影响。

染色体遗传学实验室从诊断和研究的角度研究这些与 MDS 剪接异常相关的染色体异常。 几年来，开展的几项工作已经与国际阅读委员会一起产生了许多科学出版物。

项目 3：急性髓性白血病 (AML) 中 MDS 的演变 超过三分之一的 MDS 患者进展为 AML。 研究人员希望关注这组患者并了解其恶性细胞的克隆结构，以检测惰性或快速疾病进展的新预测标志物。