골수이형성 증후군(P-MDS)에서의 생체수집 (P-MDS)

biocollection의 목적은 MDS의 3가지 과학 프로젝트에 대응하는 것입니다.

프로젝트 1: SF3B1 돌연변이가 있는 MDS의 스플라이싱 이상 현상: 인간의 코딩 유전자의 약 95%는 단일 유전자에서 여러 단백질을 정의하여 프로테옴을 다양화하는 복잡하고 고도로 조절된 메커니즘인 얼터너티브 스플라이싱을 받습니다. 스플라이싱의 탈조절은 많은 암과 혈액병증(요시다 외, 2014 검토), 특히 골수이형성 증후군에서 관찰됩니다. MDS 환자의 절반 이상이 pre-RNA 메신저의 스플라이싱과 관련된 유전자에서 후천적 돌연변이를 나타냅니다. 3' 스플라이스 부위 인식에 관여하는 단백질을 암호화하는 SF3B1 유전자(스플라이스 인자 3B 서브유닛 1)는 SMD에서 가장 빈번하게 돌연변이되는 유전자로, 20-28% MDS의 빈도로, 골수이형성증의 최대 85%에서 발생합니다. 관형 측적모세포 증후군(Yoshida et al., 2011, Papaemmanuil et al., 2011). 따라서 MDS의 병리생리학에서 생성된 스플라이싱 이상의 기능적 결과는 명확하지 않습니다. 트랜스크립톰 분석(RNA-seq에 의한)은 SF3B1 유전자의 가장 빈번한 변이체가 3' 숨겨진 스플라이싱 부위의 사용에 의해 비정상적인 전사체의 형성을 초래한다는 다양한 후천적 병리학에서 최근에 수행되었습니다. 조사관은 MDS 환자에서 발견되는 SF3B1 돌연변이의 기능적 의미, 특히 크라운의 사이드로블라스트 형성에 대한 기능적 의미를 연구하고자 합니다. 연구자들은 돌연변이된 SF3B1이 있는 MDS 환자의 세포에서 특이적으로 발현되고 철 대사 또는 그 조절에 관여하는 유전자의 전사물에 영향을 미칠 비정상 접합부를 RNAseq를 통해 확인하고자 합니다. 이를 위해 연구자들은 SMD SF3B1WT 환자 대 SF3B1K700E의 골수에서 얻은 세포를 사용하고 브레스트의 CHRU의 CRB 사이트인 염색체 유전학 실험실에서 수집했습니다. 그런 다음 조사관은 이러한 동일한 환자의 배양에서 세포에 대한 이러한 비정상적인 접합의 존재와 관련된 기능적 영향을 분석합니다(특정 단백질의 검출, 효소 분석 등). 이러한 관심 환자의 생물학적 및 임상 데이터 수집은 결과 해석에 필수적입니다. 이 프로젝트는 이 병리학의 다양한 스플라이싱 이상 연구에 대한 보다 광범위한 접근 방식의 일부입니다.

프로젝트 2: 5q 결실과 같은 염색체 이상을 동반한 MDS의 스플라이싱 이상: 염색체 5 결실은 MDS에서 가장 빈번한 구조적 이상이며 분리되거나 이상과 관련되면 좋은 예후 실체를 구성하고 3개 이상의 염색체 이상과 관련되면 나쁜 예후를 구성합니다. 염색체 5에 위치한 두 개의 유전자는 pre-messenger RNA의 스플라이싱에 관여하는 복합체인 RBM22 유전자(RNA Binding Motif Protein 22)와 SLU7 유전자(SLU7 Homolog Splicing Factor)의 단백질을 암호화합니다.

연구자들은 이 2개의 유전자가 손실되었거나 RBM22가 손실되고 SLU7이 보존된 환자의 하위 그룹을 확인하고자 합니다. 하나 또는 두 유전자의 손실이 염색체 결실을 동반한 MDS의 병태생리형성에 역할을 하며 질병의 악화와 관련이 있습니까? 이러한 메커니즘을 이해하면 이 병리학의 치료 관리에도 영향을 미칠 수 있습니다.

진단 및 연구 관점에서 염색체 유전학 실험실을 위한 MDS의 스플라이싱 이상과 관련된 이러한 염색체 이상에 대한 연구. 수행된 여러 작업으로 인해 수년 동안 국제 독서 위원회와 함께 수많은 과학 출판물이 발행되었습니다.

프로젝트 3: 급성 골수성 백혈병(AML)에서 MDS의 진화 MDS 환자의 1/3 이상이 AML로 진행합니다. 연구자들은 이 환자 그룹에 초점을 맞추고 악성 세포의 클론 구조를 이해하여 나태하거나 빠른 질병 진행의 새로운 예측 마커를 감지하기를 원합니다.