法属圭亚那卡宴综合医院乙型肝炎的分子流行病学
研究概览
详细说明
人口统计和迁移在病毒种群的系统地理学中起着至关重要的作用。 乙型肝炎病毒的特征是高度遗传多样性，这是由于该病毒在其复制周期中使用逆转录酶这一事实导致的，逆转录酶会导致错误并因此产生变异。 到目前为止，已经描述了十几种基因型，并细分为具有不同民族地理分布的亚基因型。 基因型 A 和 D 普遍存在，代表了欧洲最常见的基因型； B 和 C 基因型在亚洲和大洋洲很常见，E 基因型在中非和西非很常见，H 和 F 基因型在拉丁美洲和阿拉斯加很常见，I 基因型在东南亚很常见。 来自这些不同大陆的人口在圭亚那都有代表，因此了解法属圭亚那流行病的传播链和系统动力学方面是很有趣的。 此外，不同的基因型具有不同的临床后果，这取决于宿主的种族以不同的方式。 因此，在墨西哥，F 和 H 基因型在它们长期流传的美洲印第安人中似乎是相当良性的。 另一方面，基因型 F、A 和 D 在高加索血统的墨西哥人中进化得相当严重，因此表明宿主的免疫遗传因素是病毒致病力的重要决定因素（Roman 和 al WJG 2014）。
一些前核心突变使病毒具有复制能力。 HBe 抗原的缺失使免疫系统失去了一个重要的目标，因此病毒可以继续复制。 这些前核心突变与 HBe Ag 阴性表型（7% 至 30% 的患者）相关，后者与更严重的慢性肝炎病程相关。 这些突变的频率越来越高（Funk ML 和 al 2001）。
快克可卡因成瘾在法属圭亚那很普遍，似乎是该流行病的驱动因素之一。 用于抽烟的烟斗破裂会导致嘴唇灼伤，共用烟斗可能会增加传播风险（Fischer 等人，2008 年）。 危险的性行为与可卡因的使用有关，这表明可卡因使用者可能存在特定的传播链。
主要目标 确定与不同基因型相关的因素（年龄、性别、出生国家、性取向、性冒险、IV 吸毒成瘾的概念、快克……），以确定法属圭亚那的特定传播链。
次要目标
- 描述法属圭亚那乙型肝炎（AgS 和前核心突变）的分子流行病学
- 开展不同 HBV 基因型的系统动力学研究，以重建法属圭亚那的流行史
- 确定与不同基因型和系统发育方面相关的临床预后因素，以确定在法属圭亚那具有最大致病潜力的病毒
- 描述法属圭亚那合并感染 B-D 的丁型肝炎分子流行病学
具有生物收集的横断面、单中心、观察性研究。
涉及人类的研究方案（第 3 类 - 非干预研究_ 与健康产品无关）
研究类型
注册 (预期的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Roxane SCHAUB, MD
- 电话号码：+594 594 39 55 96
- 邮箱：roxane.schaub@ch-cayenne.fr
研究联系人备份
- 姓名：DRISP General Hospital of Cayenne
- 电话号码：+594 594 39 53 85
- 邮箱：cicec@ch-cayenne.fr
学习地点
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Cayenne、法属圭亚那、97306
- 招聘中
- General Hospital of Cayenne
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接触：
- Mathieu Nacher, MD, PhD
- 电话号码：5024 +594 594 39 50 24
- 邮箱：mathieu.nacher@ch-cayenne.fr
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
接受健康志愿者
有资格学习的性别
取样方法
研究人群
在 Cayenne 医院中心随访感染乙型肝炎的成年患者（成人日间医院会诊、传染病和热带病科会诊以及肝病 B 医学会诊）
预计目标人群规模：1000
描述
纳入标准：
- 年龄≥18岁
- 慢性乙型肝炎确诊者
- 不反对其参与协议的人
- HBV病毒载量>=500拷贝/mL
- 计划/愿意在 Cayenne 医院中心接受当前护理的下一次 HBV 评估的人
排除标准：
- 拒绝参加
- 年龄<18岁
- 反对他们参与协议的人
- HBV病毒载量<500拷贝/mL
- 没有计划/不愿意在 Cayenne 医院中心接受当前护理的下一次 HBV 评估的人
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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乙型肝炎病毒 (HBV) 测序
大体时间：2年
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研究的突变将是与 AgS 和前核心区域相关的突变。 将在 Qiacube® 机器上使用 Qiagen® 技术提取病毒核酸。 HBV 基因分型将通过对从 HBV S 基因（nt 414 到 nt 822，参考序列 HBV 毒株 NC003977）扩增的 DNA 片段的核苷酸进行测序来进行。 为了研究 HBV 菌株之间的遗传接近性，将根据 Ramachandran 等人的方法使用两个扩增步骤对样本进行全基因组测序。 第一轮全基因组扩增后将进行第二轮 PCR，嵌套在 6 个重叠片段上，每个片段 600bp。 系统动力学方法将估计病毒进化的各个方面时间。 将生成系统发育树，以说明使用 Mega 软件在法属圭亚那传播的不同类型病毒之间的遗传差异。 |
2年
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次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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丁型肝炎病毒 (VHD) 测序
大体时间：2年
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在同样感染 HDV 的患者中，将通过基因组扩增的 R0 区域（nt 889 至 nt 1289）的核苷酸测序和系统发育分析进行 HDV 基因分型。 完整序列的特征在于覆盖整个基因组的 4 个重叠区域的扩增和测序：R0（nt 889 至 nt 1289）、R1（nt 320 至 nt 1289）、R2（nt 889 至 nt 420）和 R3（nt 200 至新台币 560）。 系统动力学方法将估计病毒进化的各个方面时间。 将生成系统发育树，以说明使用 Mega 软件在法属圭亚那传播的不同类型病毒之间的遗传差异。 |
2年
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肝功能指标
大体时间：2年
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将采用各种肝功能标志物。
将根据基因型和子进化枝区分和比较几个组，从而检验基因型和进化标记之间不存在差异的零假设。
关联将使用卡方检验对分类变量和其他基因型（探索性分析）的交叉制表进行评估。
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2年
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合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员：Mathieu NACHER, MD, PhD、Centre Hospitalier de Cayenne
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (预期的)
研究完成 (预期的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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